6、化学化合物与数据资源在药物研究中的应用

化学化合物与数据资源在药物研究中的应用

在药物研究领域，对化学化合物的理解和数据资源的利用至关重要。本文将详细介绍化学化合物的指纹和描述符、相似性度量、定量构效关系（QSAR）以及相关的数据资源。

1. 化学化合物指纹

• 扩展连接指纹（ECFPs） ：用于结构 - 活性建模，具有拓扑和圆形的特点。其算法为每个原子分配标识符，并更新以捕获相邻原子信息，最后去除重复标识符，得到特征计数。
• 摩根指纹（Morgan fingerprints） ：与 ECFPs 相关，但算法不同。摩根指纹的原子标识符不依赖于原子的原始编号，通过迭代生成，直到达到唯一性。它常用于比较分子相似性，被哈希为预定义长度的位向量。
• 其他指纹 ：
  • MACCS 键 ：预定义的 116 个子结构集，但缺乏对每个子结构的明确定义。
  • Daylight 指纹 ：一种路径指纹，将图的路径枚举并转换为位向量。
  • 签名指纹 ：非二进制，基于扩展价序列，描述化合物内原子的连接性。

名称	备注
MACCS	子结构键