药物发现过程全解析
1. 筛选库设计
在药物发现过程中,筛选库设计至关重要,其中多样性是关键焦点之一。如今,人们正努力朝着更基于知识的筛选库设计方向发展。化学信息学技术可用于评估化合物在结构上的化学相似性。例如,Akella 和 DeCaprio 探讨了运用化学信息学方法分析筛选库的多样性。他们指出,各种可视化技术有助于识别化学空间中未被探索的区域,还可以使用指标来量化化合物与天然产物的相似程度等属性,这些方法都有助于增加筛选库的多样性。
创建化合物库时,有几个关键因素需要考虑:
- 成本和测定目标 :实际操作中,成本和测定目标是必须考虑的因素。
- 去除不适当的化合物 :应去除具有不适当特性的化合物,如 PAINS(泛测定干扰化合物),这类化合物在测定中很可能被误判为阳性结果。
- 预测化合物性质 :可以预测化合物的性质,去除那些不太可能成为合适药物的化合物。
- 进行复杂性分析 :考虑化合物的复杂程度。
- 评估多样性和独特性 :评估化合物集合的多样性以及结构的独特性。
2. 高通量筛选
高通量筛选(HTS)是大规模筛选和测定化合物对靶点作用的过程。在测定方法发展之后,高通量筛选成为识别先导化合物最常用的方法之一。它利用机器人和自动化技术,能够快速进行药理测试等。
在高通量筛选技术出现之前,筛选工作是手动进行的,每周只能分析 20 到 50 种化合物。随着识别潜在靶点的新技术不断涌现,这种手动方法
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