Freesurfer的基本使用（基于WSL2）

准备环节

• 安装WSL（Ubuntu）

  • 参考：【WSL】使用WSL在Windows上安装Linux（Ubuntu20.04）_install linux on windows with wsl-优快云博客

• 配置WSL GUI：

  • 参考：Windows10 WSL2 Ubuntu 图形界面环境搭建（Xfce4 、XServer）-腾讯云开发者社区-腾讯云 (tencent.com)

• 启动WSL GUI界面命令：

xfce4-session

一、概述

（一）基本概念

• MRI（磁共振成像）：FreeSurfer处理的主要输入数据是高分辨率的T1加权MRI图像，这是人脑结构的详细三维图像。
  • T1加权MRI图像（T1-weighted MRI images）是一种在磁共振成像（MRI）中使用的成像技术，主要用于生成高对比度的解剖图像。
• 皮层（Cortex）：大脑皮层是大脑外层的灰质部分，负责处理感知、运动、认知等功能。
• 灰质和白质（Gray Matter and White Matter）：
  • 灰质：包含神经元细胞体的区域。
  • 白质：包含神经纤维（轴突）的区域，连接不同的大脑区域。
• 表面（Surface）：
  • 白质表面（White Matter Surface）：白质与灰质之间的边界。
  • 皮层表面（Pial Surface）