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原创 FSL预处理fmri,结合功能结构都提取大脑,结合服务器并行计算

【代码】FSL预处理fmri,结合功能结构都提取大脑,结合服务器并行计算。

2025-02-28 11:57:20 116

原创 新FSL批量处理fMRI步骤

【代码】新FSL批量处理fMRI步骤。

2025-02-24 22:28:42 118

原创 win11中wsl安装Ubuntu20.04运行base出现报错

do这些错误提示表明你的脚本文件包含 Windows 风格的换行符(\r\n),而在 Unix/Linux 系统中,脚本通常使用 Unix 风格的换行符(\n\r(回车符)在 Unix/Linux 系统中被视为一个普通字符,当 Bash 解析脚本时,它会把\r当作命令的一部分,从而导致错误。解决方法。

2025-02-20 09:21:01 323

原创 批量转换dcm2niix

1. 安装dcm2niix,以下脚本另存为batch_dcm2niix.sh。

2025-02-19 17:11:08 213

原创 Ubuntu 文件夹操作删除文件或文件夹中的中文字符

Ubuntu 文件夹操作删除文件或文件夹中的中文字符。

2025-02-14 10:32:39 79

原创 Install Ubuntu20.04

惠普(HP):Esc(然后按 F10),或直接按 F10。联想(Lenovo):F2 或 Fn+F2。戴尔(Dell):F2 或 F12。Rufus - 轻松创建 USB 启动盘。4. 安装Ubuntu。

2025-01-28 14:30:01 182

原创 Ubuntu20.04 install ORBIT GMT GMTSAR

【代码】Ubuntu20.04 install ORBIT GMT GMTSAR。

2025-01-28 14:07:27 210

原创 DiffusionKit处理DTI得到FA、MD数据

4. 下载示例代码命名process_primary.sh。5. 下载并运行process_advanced.sh。

2025-01-08 17:36:36 160

原创 freesurfer软件提取T1像的感兴趣区的数据

【代码】freesurfer软件提取T1像的感兴趣区的数据。

2024-04-07 11:01:11 472

原创 freesurfer软件T1像不同受试组组分析(组间比较)代码

【代码】组分析代码。

2024-03-30 17:38:36 291

原创 freesurfer 基于官方教学数据处理流程

src是source缩写,指需要读入的源文件,后面接“.”(表示当前路径)或完整路径。7. cd到DICOM文件夹,-i表述输入T1像的任意一个I0文件,-s表示命名。程序运行后可见在export输出目录/home/userroot/MRI_test/test1202/Subj001生成了mri、surf、stats等文件夹,这一步根据电脑配置不同会耗时数小时或几十个小时。2. 本路径为 /home/userroot/MRI_test/tutorial_data_20190918_1558。

2023-12-02 14:40:57 831

原创 freeview使用

【代码】freeview使用。

2023-11-22 10:41:05 409 1

原创 Linux常用命令

sudo cp -ipvr /要复制目录 /目标目录。格式化特定硬盘,注意盘符。2. 复制文件夹及子目录。1. 新加硬盘格式化。

2023-11-11 16:50:05 105 1

原创 Ubuntu22.04安装R及Rstudio

正在处理用于 desktop-file-utils (0.26-1ubuntu3) 的触发器 ...sudo dpkg -i rstudio-2023.09.1-494-amd64.deb ##安装。正在处理用于 hicolor-icon-theme (0.17-2) 的触发器 ...准备解压 rstudio-2023.09.1-494-amd64.deb ...正在处理用于 shared-mime-info (2.1-2) 的触发器 ...rstudio 依赖于 libssl-dev;

2023-11-01 10:51:39 988 1

原创 freesurfer提取皮层数据

【代码】freesurfer提取皮层厚度。

2023-09-23 09:14:03 1489 2

原创 rufus安装ubuntu22.04

使用rufus.ie网站下载,默认选项制作安装U盘即可。

2023-09-23 00:13:46 575 1

原创 浪潮5212M5简便调节风扇转速

ipmitool命令ipmitool -I lanplus -H 192.168.*.* -U admin -P admin raw 0x30 0x30 0x02 0xff 0x1e用不了。使用火狐浏览器打开设置的BMC网址192.168.*.*,点击风扇转速控制,按F12打开开发者模式,依次点击网络-XHR,点击FAN_2的低速20%,下方中间位置出现5数字处,点击右键-编辑并重发,在左侧拖到最下面,把20修改成10,点击发送,风扇转速明显下降,依次设置其它风扇速度。

2023-09-14 18:29:28 4840

原创 ANTS处理nii数据

去除非脑组织,使用Oasis模板。

2023-09-13 21:27:28 140

原创 dcm2niix批处理

批处理前文件夹中文件导出为txt文件,终端里输入ls>文件名.txt。

2023-09-13 21:10:21 314

原创 使用freesurfer软件parallel并行recon-all

3. 查看cpu性能,查看电脑逻辑处理器的核数(同时能处理结构像文件的个数,如第4步的num对应,如有20个逻辑处理器,可以--jobs 16)1. 安装parallel。2. 设置结果输出路径。

2023-09-09 12:06:15 494

原创 ubuntu22.04安装freesurfer

2. vim ~/.bashrc最后添加以下命令。解压安装完后进行以下操作。3. source一下。

2023-09-07 16:14:40 695

原创 wsl2安装freesurfer

官方版本和安装教程。

2023-09-03 18:48:23 499

原创 安装freesurfer步骤

5、转到freesurfer路径。1. Ubuntu升级。

2023-09-03 18:40:45 2002

原创 ubuntu linux安装matlabR2016b出错解决

安装目录下/R2016b/sys/java/jre/glnxa64/jre/bin/java:permission deined。不可能这么快,有个permission denied的错误不会再屏幕上提示出来,因此还要执行权限管理。3. 再次运行./install,出现。

2023-08-31 18:33:36 244

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