6、群体遗传学与遗传模型分析

群体遗传学与遗传模型分析

在遗传学研究中，群体遗传学以及基于表型数据的遗传模型分析是非常重要的领域。下面将详细介绍群体遗传学中的近亲繁殖系数计算、相关练习，以及不使用基因数据的遗传模型分析方法。

1. 群体遗传学中的近亲繁殖系数

近亲繁殖系数可以通过样本中观察到的基因型频率来估计，用于描述一个群体中近亲繁殖、群体分层和混合的程度。以下是两个样本的近亲繁殖系数计算示例：
| 品种 | O（观察值） | E（期望值） | ˆF（近亲繁殖系数） |
| ---- | ---- | ---- | ---- |
| 巴吉度猎犬 | 2 | (32 * 2(0.98)(0.02)) | 0.51 |
| 西藏梗犬 | 10 | (24 * 2(0.64)(0.36)) | 0.096 |

需要注意的是，在表中报告的样本里，贝生吉犬品种中 F 等位基因已经消失。

2. 群体遗传学练习

以下是一系列群体遗传学相关的练习，涵盖了等位基因频率估计、卡方检验、哈迪 - 温伯格平衡（HWE）验证等内容：
1. X 染色体上 A 等位基因频率估计 ：在随机群体样本中，X 染色体上某位点的等位基因频率定义为携带 A 变体的 X 染色体等位基因的比例。假设 HWE 成立，估计 A 等位基因频率及方差。
2. 镰状细胞贫血基因突变频率估计 ：已知某群体中镰状细胞贫血的患病比例为 0.01，假设为常染色体隐性疾病模型且 HWE 成立，估计该群体中血红蛋白位点的镰状细胞突变频率。
3. 卡方检验 ：利用