聚类分析与数据可视化方法详解

34、对奥伦赛数据集(两种分类)应用 k - 均值和你选择的凝聚聚类方法,使用已知的正确组数。使用轮廓图和平均轮廓值。改变 k 值重复此过程,并讨论结果。

需按照以下步骤操作求解:

  1. 对奥伦赛数据集的两种分类分别应用 k-均值和凝聚聚类方法,使用已知的正确组数。
  2. 绘制轮廓图并计算平均轮廓值。
  3. 改变 k 值,重复上述步骤。
  4. 分析不同 k 值下的轮廓图和平均轮廓值,讨论结果。

35、Fowlkes - Mallows [1983]指数可以使用匹配矩阵N(在这种情况下必须是g x g,其中g = g1 = g2)来计算。请用MATLAB函数实现这一计算。假设存在一个奥龙赛(oronsay)数据集,使用Fowlkes - Mallows指数处理该数据集,并将计算结果与一个已知的之前结果进行比较。

实现该功能的大致步骤为:先根据Fowlkes - Mallows指数公式编写MATLAB函数,然后对奥龙赛数据集进行相应操作,计算Fowlkes - Mallows指数,最后将结果与之前结果对比,但具体代码需根据详细公式和数据特点编写。

36、对奥朗赛(oronsay)数据集应用基于模型的凝聚式聚类方法。使用间隙统计量来选择聚类的数量。使用轮廓图和兰德指数评估划分结果。

操作步骤

  1. 对奥朗赛数据集应用基于模型的凝聚式聚类;
  2. 使用间隙统计量确定聚类数量;
  3. 利用轮廓图和兰德指数评估聚类划分结果。

37、对奥伦赛(oronsay)数据集使用基于模型的聚类方法。对其中一个模型应用间隙(gap)方法来确定聚类的数量。将间隙方法估计的聚类数量与通过贝叶斯信息准则(BIC)得到的结果进行比较。

可按照基于模型的聚类流程:

  1. 先使用无约束模型对数据进行基于模型的凝聚式聚类
  2. 选择模型、聚类数量
  3. 利用凝聚式聚类结果找到分区
  4. 计算混合系数、均值和协方差
  5. 应用期望最大化(EM)算法得到最终估计
  6. 计算该聚类数量和模型下的 BIC 值

分别用间隙方法和 BIC 确定聚类数量并比较。

38、使用单变量指数分布的混合来构造另一个单变量有限混合密度。

以下是构造使用单变量指数分布混合的单变量有限混合密度的步骤:

首先明确单变量指数分布的概率密度函数为:

  • 当 $ x \geq 0 $ 时,$ f(x; \lambda) = \lambda e^{-\lambda x} $
  • 当 $ x < 0 $ 时,$ f(x; \lambda) = 0 $

其中,$ \lambda > 0 $ 是速率参数。

假设我们要构造一个由两个单变量指数分布组成的有限混合密度,步骤如下:

  1. 设置各成分参数 :确定混合比例(权重)和每个指数分布的速率参数。
    例如,设混合比例相等,即权重 $ \pi_1 = 0.5 $,$ \pi_2 = 0.5 $;速率参数 $ \lambda_1 = 1 $,$ \lambda_2 = 2 $。

  2. 确定评估密度的定义域 :选择一个合适的范围,例如 $ x = \text{linspace}(0, 10) $。

  3. 计算各成分的概率密度函数 :使用指数分布的概率密度函数计算每个成分在定义域上的值。在 MATLAB 中可以编写函数来实现。

  4. 计算有限混合密度 :根据混合比例对各成分的概率密度函数进行加权求和。

  5. 绘制最终函数 :使用 plot 函数绘制混合密度曲线。


MATLAB 代码示例

% 混合系数
pie1 = 0.5;
pie2 = 0.5;

% 速率参数
lambda1 = 1;
lambda2 = 2;

% 生成定义域
x = linspace(0, 10);

% 计算各成分的概率密度函数
y1 = lambda1 * exp(-lambda1 * x);
y2 = lambda2 * exp(-lambda2 * x);

% 加权求和得到最终曲线
y = pie1 * y1 + pie2 * y2;

% 绘制最终函数
plot(x, y)
xlabel('x'), ylabel('Probability Density Function')
title('Univariate Finite Mixture - Two Exponential Terms')

39、对以下数据集应用基于模型的凝聚式聚类,并以树状图展示。若有必要,先进行降维处理。数据集包括:a. 头骨数据集 b. 麻雀数据集 c. 奥朗赛数据集(两种分类) d. BPM数据集 e. 基因表达数据集

在基于模型的凝聚式聚类中,以分类似然作为目标函数,从单例簇开始,每次合并使分类似然增加最大的两个簇,直至所有观测在一个组中。

  • 实现方式 :MATLAB实现中一般用无约束模型。
  • 函数说明 :函数 agmbclust 可用于基于模型的凝聚式聚类,它接收数据矩阵 X 并返回链接矩阵 Z ,该矩阵可用于其他期望此矩阵形式的MATLAB函数。
  • 扩展应用
  • 若需降维,可使用常见的数据降维方法。
  • 评估结果可使用通用的聚类评估方法。

40、使用Python对鸢尾花数据进行基于凝聚式模型的聚类方法,分别进行二聚类和四聚类,并使用轮廓系数法评估聚类结果。

以下是使用 Python 借助 scikit-learn 库对鸢尾

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