20、EBOCA与知识图谱中的反效应规则挖掘

EBOCA与知识图谱中的反效应规则挖掘

1. EBOCA简介

EBOCA是一个用于建模生物医学概念之间关联的证据和来源的本体，它由两个模块组成：
- EBOCA SEM - DISNET ：用于处理生物医学概念及其关联。
- EBOCA Evidences ：用于提供关联的证据、来源和元数据信息。

2. 药物 - 表型关联

药物（cco:Drug）和表型（Phenotype）之间通过三种关联类相连接，这些关联类反映了相互作用的可能因果关系：
- 适应症（Indication） ：复用自ChEMBL类cco:DrugIndication，指药物的获批用途。
- 副作用（Side effect） ：药物治疗导致患者表型改变的不良症状关联，数据来源于SNOMED CT数据库（sct:662014003）。
- 药物 - 药物相互作用（Drug - drug interaction, DDI） ：复用类sio:SIO 001006来建模这些相互作用。DISNET的DDI数据主要来自DrugBank，但不允许重新分发，不过DISNET也包含TWOSIDES信息，可提供DDI可能导致的潜在不良副作用。

以下是药物 - 表型关联的总结表格：
| 关联类型 | 来源 | 说明 |
| ---- | ---- | ---- |
| 适应症 | ChEMBL类cco:DrugIndication | 药物获批用