根据基因提取Go号--记录

逐行读取文本

open FH,"1.txt"；
while(<FH>) #逐行读取文本
{
print $_;
}

1、输入物种名 拿到tax id
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/Taxonomy/TaxIdentifier/tax_identifier.cgi

例如西瓜：

2、NCBI下载gene2go.gz
ftp://ftp.ncbi.nih.gov/gene/DATA/

3、下载
关于这个taxid的资料还有很多
链接: ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/pub/taxonomy/.

其中我们可以下载

wget  ftp://ftp.ncbi.nih.gov/pub/taxonomy/taxdump.tar.gz

这个文件，解压可以看到里面有以下文件，其中比较重要的两个文件

nodes.dmp 这个文件列出了taxid的树的结构信息，子节点，父节点等等

names.dmp 这个文件里面列出了每个独特的taxid对应着的物种名