ovito+python相分数、位错密度统计

已于 2024-06-02 17:24:57 修改
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分类专栏： LAMMPS 文章标签： python
于 2024-03-23 16:51:17 首次发布
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本文链接：https://blog.youkuaiyun.com/qq_45762148/article/details/136969946
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本文介绍了如何使用Ovito软件结合Python进行原子轨迹处理，包括导入轨迹文件、DXA分析、编写并运行脚本来计算位错密度。通过lammps链接提供视频教程，便于用户按照步骤操作。

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lammps数据后处理：Python ovito 计算输出位错线长度
lammps_jiayou的博客
10-07 2108
ovito DXA模块可以分析位错类型并给出了每条位错线的长度，可以通过导出分析结果的方法汇总位错线长度。这种方法比较繁琐，使用python小程序统计位错线就简单多了。
python识别ovito中的位错，并统计长度，改进版提升运行速度
wcget123的博客
12-25 2898
要在Python中识别OVITO（The Object-Oriented Visualization Toolkit）中的位错，您可以使用OVITO的Python API来进行位错分析。OVITO是一个科学可视化和分析软件，用于原子尺度的模拟数据，如分子动力学或蒙特卡罗模拟。: 分析完成后，您可以提取位错数据，如位错线的位置、类型等。函数加载您的模拟数据，这些数据可能是原子坐标文件，如LAMMPS的输出文件。: 首先，确保您的系统中安装了OVITO。: 在您的Python脚本中，导入必要的OVITO模块。
Ovito的python脚本
novanova2009的博客
03-29 613
在 OVITO 里，Python 对象是构建脚本化操作的基础。
为ovito配置python
m0_52105006的博客
11-17 1438
第一步，下载python；第二步，下载最新版ovito；第三步，通过cmd安装ovito python module模块；最后通过cmd输入简单命令符检查是否配置成功。
高熵合金位错分析DXA（使用ovito）
qq_45762148的博客
01-09 3188
得到如下结果结果如下。
Python库 | ovito-3.1.1-cp37-cp37m-manylinux1_x86_64.whl
02-18
python库，解压后可用。 资源全名：ovito-3.1.1-cp37-cp37m-manylinux1_x86_64.whl
基于位错密度的晶体塑性模型及其Python实现与应用
最新发布
04-08
文中不仅提供了Python代码示例，演示了如何计算位错密度并进行晶体塑性模拟，还深入分析了位错密度演化方程及其在材料科学中的应用。通过数值求解和可视化工具，展示了位错密度变化对材料性能的影响，如强度、韧性等...
Python库 | ovito-3.7.2-cp310-cp310-manylinux1_x86_64.whl
05-08
资源分类：Python库 所属语言：Python 资源全名：ovito-3.7.2-cp310-cp310-manylinux1_x86_64.whl 资源来源：官方 安装方法：https://lanzao.blog.youkuaiyun.com/article/details/101784059
python ovito模块计算某一类原子的MSD均方位移
dabaicai_520的博客
02-05 3307
此文是关于计算多种原子体系下其中的一种原子的均方位移MSD
Lammps：Python上Ovito模块配置的问题与解决
weixin_44126081的博客
11-06 6393
ovito由于其图形界面化的处理方式，成为了许多lammps使用者后处理过程中最受欢迎的软件，它也提供了python接口模块，可以让ovito的分析更加灵活。本博文的运行环境为windows 11，大部分的安装过程提供的链接都可以进行参考，各位热心的博主写得都很详细。但是在安装过程中，如果出现和我一样并不顺利的情况，也希望自己的总结可以帮助到大家！
液滴/液膜蒸发过程的模拟与后处理分析——Ovito/Python绘图
NoerrorCode的博客
07-18 724
例如，我们可以使用Ovito的子程序语言来编写自定义的分析模块，以实现更复杂的后处理操作。总结起来，通过使用Ovito进行模拟数据加载和后处理分析，以及使用Python绘图库进行结果可视化，我们可以深入理解液滴/液膜蒸发过程中的微观行为和动力学变化。例如，我们可以计算液滴的径向分布函数（RDF），并使用Ovito提供的Python脚本语言来自定义分析过程。通过分析RDF，我们可以了解液滴中颗粒之间的距离分布情况，进而研究蒸发过程中的微观结构变化。以上就是关于液滴/液膜蒸发过程的模拟与后处理分析的介绍。
python下载ovito包教程
qq_45762148的博客
01-12 882
WARNING: You are using pip version 21.1.1; however, version 23.3.2 is available. You should consider upgrading via the 'D:\Workspace\Python\python.exe -m pip install --upgrade pip' command. 5、下载成功 6、打印一下pycharm版本，可以打印说明安装成功 7、参考链接ovito+python+
新手笔记：Ovito配置python 通过 anaconda
yingbaobao98的博客
08-08 1497
安装python-ovito过程。安装完成后即可在ovito-basic免费版导入python脚本，进行分子动力学数据后处理。
lammps后处理：Python调用Ovito模块配置方法
lammps_jiayou的博客
09-27 2948
ovito不仅提供了图形界面处理方法，也提供了python接口模块（OVITO Python Module），可以在python代码中调用ovito的分析功能，更加灵活方便。
lammps数据后处理：Python Ovito CNA结构统计输出
lammps_jiayou的博客
10-10 2182
Ovito CNA模块可以分析不同时刻的晶体结构，但是在ovito软件中的分析结果不方便直接绘图输出，因此本文给出一个python脚本，运行之后可以直接绘制不同晶体结构的比例图。
Ovito位错分析mesh透明度设置方法
lammps_jiayou的博客
12-12 296
Uniform color”可设置mesh颜色，此处改成白色，Transparency位置为透明度，改成85%，去掉勾选“Cap polygons”在ovito中使用DXA处理位错时，默认会显示mesh，该mesh会把一些位错或者原子挡住，不利于观察和绘图。如果在ovito中关闭mesh和particles显示，又不能很清晰的观察加工表面。在ovito中，可以调整mesh的透明度，点击右上角的“Defect mesh”本文介绍ovito DXA位错分析的mesh透明化方法。
lammps后处理：ovito快速提取单条位错线的伯氏矢量
lammps_jiayou的博客
02-11 3325
大家好，我是小马老师。 本文介绍如何使用ovito提取lammps模拟结果中的位错数据。 位错是晶体材料在塑形变形中产生的一种缺陷，位错的迁移或者增殖会影响晶体的进一步变形过程。 在lammps晶体力学模拟中，位错分析（DXA）是常用的一种后处理分析方法。 lammps模拟结果导入到ovito，添加“Dislocation analysis”即可显示位错信息。 关于ovito DXA的使用方法，网上有很多教程，可搜索查看。 本文介绍如何确定每条位错线的伯氏矢量。 如下图所示： 在ovito DXA分析中，
晶体塑性模型 位错密度 代码
09-19
晶体塑性模型是一种用于模拟金属材料在塑性变形过程中的力学行为的理论框架。它基于位错理论，认为材料的塑性流动是由晶格中原子排列（位错）的运动驱动的。在晶体塑性模型中，位错密度是一个关键参数，它表示单位体积内存在的位错数目。位错越多，意味着材料越容易发生形变。 位错密度通常通过实验测量，如电子显微镜观察，并在数值模拟中作为输入变量。在一些计算流体力学软件中，例如有限元分析程序，开发者可能会编写特定的算法来计算随加载状态变化的位错密度，或者模拟其对材料性能的影响，如强度、延展性和疲劳寿命等。 至于代码示例，这可能会涉及到编程语言库，比如Python的Atomate库，用于处理材料科学中的模拟任务。一个简化的示例可能是这样的： ```python import ase from atomate.vasp.powerups import add_tags # 加载结构 structure = ase.io.read('my_structure.cif') # 添加位错 structure = add_tags(structure, {'dislocation_density': 0.5}) # 计算并更新位错密度 dislocation_model.run(structure) dislocation_density = structure.get_tag('dislocation_density') # 输出结果 print(f"初始位错密度：{dislocation_density}") ``` 这里`dislocation_model.run()`是一个假设存在的函数，它会根据设定的条件（在这个例子中位错密度为0.5）运行位错动力学模拟。实际的代码会更复杂，包括设置边界条件、施加应力、迭代直到达到塑性变形状态等。
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