SumGNN: 多类型药物相互作用预测 - 通过高效知识图谱概括

SumGNN: 多类型药物相互作用预测 - 通过高效知识图谱概括

在医学领域,准确预测药物之间的相互作用对于药物研发和治疗方案设计至关重要。为了解决这一挑战,我们提出了一种名为"SumGNN"的新方法,旨在通过高效的知识图谱概括实现多类型药物相互作用的准确预测。
在这里插入图片描述

项目背景和意义

药物相互作用预测是医学研究的重要课题之一,其准确性直接影响到临床用药的安全性和有效性。传统的药物相互作用预测方法往往受限于数据稀疏性和复杂性,难以有效处理多类型药物之间的关系。

为了解决这一问题,我们提出了SumGNN,它基于知识图谱的高效概括,能够充分利用药物之间的多种关联信息,从而提高药物相互作用预测的准确性和效率。通过深入挖掘药物之间的关联关系,SumGNN为药物研发和临床治疗提供了重要的参考依据。

项目安装与使用

你可以通过以下步骤安装SumGNN:

git clone git@github.com:yueyu1030/SumGNN.git
cd SumGNN
pip install -r requirements.txt
### 关于 Cygwin 的安装教程 #### 创建合适的安装位置 为了防止磁盘空间不足以及方便管理,建议将Cyginw的根目录设置在D盘。可以在D盘预先创建一个新的文件夹(例如命名为`cygwin`),之后通过浏览器导航至该新建文件夹内再继续后续操作[^2]。 #### 下载并启动安装程序 访问[Cygwin官方网站](https://www.cygwin.com/)下载最新的setup-x86_64.exe 或 setup-x86.exe 文件 (取决于计算机架构),保存到本地硬盘上任意容易找到的位置。双击运行此可执行文件来开启图形化界面引导下的安装流程[^1]。 #### 配置网络连接选项 当提示选择镜像站点时,可以选择“Direct Connection”,除非有特殊需求;接着会显示一系列可用作为软件包源服务器列表页面,在这里挑选一个距离较近速度较快的服务节点即可。 #### 设置安装路径与默认文本编码方式 确认之前准备好的目标文件夹无误后点击下一步进入自定义组件选取环节前还需指定缺省字符集为UTF-8以确保兼容性良好。 #### 自定义组件的选择 对于大多数开发者而言,“Devel”类别中的工具链是必不可少的部分。具体来说应该至少勾选如下几项以便支持基本开发环境构建工作: - `binutils`: 提供链接器和其他二进制实用程序。 - `gcc-core`: GNU 编译器集合的核心部分。 - `gcc-g++`: C++ 支持库及其相关编译工具。 - `make`: 构建自动化工具。 - `gdb`: 调试器用于调试应用程序。 以上提到的关键组件均需选定适当稳定版次进行部署以保障后期正常使用体验不受影响[^3]。 ```bash # 打开终端验证是否成功安装了所需的命令行工具 $ gcc --version $ g++ --version $ make --version $ gdb --version ```
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