Ubuntu/centors安装FSL和MRIcron

本文详细介绍了在Ubuntu和CentOS系统上安装FSL和MRIcron的方法,包括使用脚本自动安装和手动安装的步骤,以及配置环境变量和测试安装成功的方法。

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一 安装FSL有几种方法,用脚本装是最简单的

1.【自动安装】
系统:ubuntu14.04版本(我尝试过16.04和18.04都无法用脚本顺利装上FSL),此版本系统自带python2.7版本,正好用来运行fsl安装脚本
下载地址:https://fsl.fmrib.ox.ac.uk/fsl/fslwiki/FslInstallation

使用脚本安装:终端输入python fslinstaller.py(要求python 2.X版本运行)
1)遇到选项就一直回车(会安装到默认路径/usr/local下)
2)可能会要求输入用户密码
3)等待安装成功(根据网络快慢)
4)重启系统
5)终端输入fsl启动软件

在这里插入图片描述
2.【手动安装】(推荐)
在centos 7下我用脚本也总是装不上,后来发现了一种手动安装方法(我想应该也能应用到16.04和18.04的系统上)。
1.下载centos 7版本的脚本fslinstaller.py
2.进入在脚本所在目录下,输入python fslinstaller.py -o下载压缩包
在这里插入图片描述
3.解压到指定目录tar -xzvf fsl-6.0.1-centos7_64.tar.gz -C "/usr/local/fsl"(注意安装包名字,解压路径"/usr/local/fsl"也可任意更改,但要注意后面的FSLDIR要和它一致)
4.FSLDIR="/

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