Ubuntu系统下MRIcroN、FSL6.0.5、Freesurfer7.1.1、ANTs、MRtrix3、AFNI的安装详解——核磁共振数据处理必备

最新推荐文章于 2025-04-30 10:28:23 发布
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分类专栏： 脑科学核磁共振成像 数据分析 FreeSurfer学习 文章标签： ubuntu 核磁共振软件包
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本文链接：https://blog.youkuaiyun.com/xj4math/article/details/120607425
本文详细介绍了在Ubuntu系统中安装MRIcroN、FSL6.0.5（包括FSLeyes的安装与修复）、Freesurfer7.1.1、ANTs、MRtrix3和AFNI的步骤。涉及Anaconda的使用、虚拟环境创建、环境变量配置、软件源码编译安装等多个环节，是核磁共振数据处理软件安装的全面指南。

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Ubuntu系统下MRIcroN、FSL6.0.5、Freesurfer7.1.1、ANTs、MRtrix3、AFNI的安装详解

一、安装MRIcroN

打开终端，输入以下命令即可安装成功

sudo apt-get install mricron

二、 FSL6.0.5完整安装与FSLeyes等Not Found修复

原文链接：up主原文链接

采用了这篇博客给出的办法，但是这个办法有一个bug，那就是安装完成之后，fsleyes、imcp、immv等缺失，即fsleyes not found，经过反复试验，最终笔者可以非常顺利的修复fsleyes等缺失的问题啦，现记录在此供大家参考。

操作系统：ubuntu20.04
  使用工具：Anaconda3-2020.11-Linux
  待装软件：fsl6.05 , 下载地址：

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04-04
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09-05
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MRIcron.rar
07-08
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mricron.rar
04-28
1、简单和平易近人的界面 MRIcron的界面非常容易处理，这意味着您不需要很多以前的使用经验就可以使用它。主工具栏包含您可能想要使用的所有组件，如“切换十字线”，“笔工具”或“填充工具”。 2、加载您的图像并选择查看模式 MRIcron允许您从“文件”菜单打开需要的文件，将其载入主窗口，让您在三个不同的面板中在X，Y和Z轴上查看它。可用的视图模式是“轴向”，“冠状”，“矢状”或“多个”。 3、方便的DICOM查看器 综上所述，MRIcron是一种可靠且易于使用的实用程序，您可以在需要使用扫描，X射线和其他类似的医学图像时使用该程序，从而使您可以在很短的时间内完成分析。 4、可以移动图片并对其进行调整，以便访问和分析某个图层。 此外，MRIcron为您提供“MultiSlice”功能，可为医学影像的各个部分创建单张照片，并将它们排成队列，以帮助您更迅速地进行比较。
小白的第一篇分享：关于虚拟机Ubuntu18.04上安装FSL，MATLAB，Mricron
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03-10 1188
@写给和我一样的菜鸟起飞教程（真的是菜鸟，大佬就不要看了） 回头看看这么简单地东西我竟然捣鼓了这么多天，真的是有点惭愧，这篇文章希望帮助到刚开始接触虚拟机啦，Linux的人，有问题的话我们可以讨论，你不嫌弃我的话哈哈哈，然后希望有一天我也能成为大佬吧，加油啊啊啊啊啊啊啊！ Ubuntu18.04系统和MATLAB的安装 这个网上已经有很多教程了，我就不废话了，只需要注意一点，64位系统一定要安装U...
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