Ubuntu系统下MRIcroN、FSL6.0.5、Freesurfer7.1.1、ANTs、MRtrix3、AFNI的安装详解——核磁共振数据处理必备

最新推荐文章于 2025-04-30 10:28:23 发布
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分类专栏： 脑科学核磁共振成像 数据分析 FreeSurfer学习 文章标签： ubuntu 核磁共振软件包
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本文链接：https://blog.youkuaiyun.com/xj4math/article/details/120607425
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本文详细介绍了在Ubuntu系统中安装MRIcroN、FSL6.0.5（包括FSLeyes的安装与修复）、Freesurfer7.1.1、ANTs、MRtrix3和AFNI的步骤。涉及Anaconda的使用、虚拟环境创建、环境变量配置、软件源码编译安装等多个环节，是核磁共振数据处理软件安装的全面指南。

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Ubuntu系统下MRIcroN、FSL6.0.5、Freesurfer7.1.1、ANTs、MRtrix3、AFNI的安装详解

一、安装MRIcroN

打开终端，输入以下命令即可安装成功

sudo apt-get install mricron

二、 FSL6.0.5完整安装与FSLeyes等Not Found修复

原文链接：up主原文链接

采用了这篇博客给出的办法，但是这个办法有一个bug，那就是安装完成之后，fsleyes、imcp、immv等缺失，即fsleyes not found，经过反复试验，最终笔者可以非常顺利的修复fsleyes等缺失的问题啦，现记录在此供大家参考。

操作系统：ubuntu20.04
  使用工具：Anaconda3-2020.11-Linux
  待装软件：fsl6.05 , 下载地址：

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Ubuntu16.04下AFNI快速安装
x_zliang的专栏
04-30 3268
AFNI快速安装 （安装环境Ubuntu16.04，安装目录：/usr/local/bin，AFNI软件版本：linux_ubuntu_16_64.tgz，软件下载地址：https://afni.nimh.nih.gov/pub/dist/doc/htmldoc/background_install/download_links.html#download-current-precompiled...
Ubuntu18.04安装FSL6.0，MATLAB，mricron
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08-29 4114
笔者为了处理DTI数据，安装了需要用到的这几个软件，一直在试错一直在解决，能犯的错都犯了，网上超级多的教程和除错方法看了不少，总算解决了一部分问题 = = 安装包可以在网上下载，笔者当时为了方便直接从其他人那里拷贝来的，实在想要的可以私聊 == 安装环境：虚拟机：VMware workstation，系统Ubuntu18.04 FSL安装包：由wx处拷贝fsl-6.0.1，后改为由wp处拷...
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最新发布
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04-30 852
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freesurfer+matrix3+fsl安装配置
hanshuning的专栏
01-11 981
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Ubuntu/centors安装FSL和MRIcron
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04-18 8626
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0基础脑神经软件安装记录（FSL, MRtrix)，文章以安装过程、问题记录为主。以便日后查找，欢迎交流沟通。
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sudo apt-get install mricron 哎，最近的进展很不顺利，用tbss，用dtitk，都遇到一些障碍。 更甚者按照官网的教程，解压压缩包mricron，都打不开mricron，感觉我都要崩溃了。 不知道什么原因，最近运气极差，数据在手，还没算出来，原计划这个数据至少得十月底算出来，然后十一月份写文章，现在估计要延后。 很烦躁，很焦虑，每天都焦虑。 想说一点，网上非官网，真的...
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Ubuntu16.04安装afni总结（使用预编译好的安装包，解压即能使用的这种） 1.下载预编译好的安装包 https://afni.nimh.nih.gov/pub/dist/doc/htmldoc/background_install/download_links.html#download-current-precompiled-afni-binaries 因为装的系统是Ubuntu...
Ubuntu卸载fsl
08-10
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医学影像分析软件mriCron
04-04
MRIcron中自带dcm2nii可将dcm格式的图像转为nifti http://www.softpedia.com/get/Science-CAD/MRIcron.shtml
mriCron V4医学影像分析软件.zip
09-05
软件介绍: mriCron是一款专业的医学影像分析软件，普通用户是用不到的，通过MRIcron中自带dcm2nii功能，能够将dcm格式的图像转为nifti格式。
MRIcron:用于NIfTI图像的简单医学成像可视化工具。 包括dcm2nii，用于DICOM，Philips和其他专有格式的转换
05-27
MRIcron / NPM / dcm2nii 关于 MRIcron是大脑成像数据的查看器。 正在安装 您可以从多个位置下载该软件： 从下载。 从下载。 运行以下命令以下载适用于Linux，Macintosh或Windows的最新版本： curl -fLO https://github.com/neurolabusc/MRIcron/releases/latest/download/MRIcron_linux.zip curl -fLO https://github.com/neurolabusc/MRIcron/releases/download/MRIcron_macOS.dmg curl -fLO https://github.com/neurolabusc/MRIcron/releases/latest/download/MRIcron_windows.zip 下载并
MRIcron.rar
07-08
可以查看医学图像。
mricron.rar
04-28
1、简单和平易近人的界面 MRIcron的界面非常容易处理，这意味着您不需要很多以前的使用经验就可以使用它。主工具栏包含您可能想要使用的所有组件，如“切换十字线”，“笔工具”或“填充工具”。 2、加载您的图像并选择查看模式 MRIcron允许您从“文件”菜单打开需要的文件，将其载入主窗口，让您在三个不同的面板中在X，Y和Z轴上查看它。可用的视图模式是“轴向”，“冠状”，“矢状”或“多个”。 3、方便的DICOM查看器 综上所述，MRIcron是一种可靠且易于使用的实用程序，您可以在需要使用扫描，X射线和其他类似的医学图像时使用该程序，从而使您可以在很短的时间内完成分析。 4、可以移动图片并对其进行调整，以便访问和分析某个图层。 此外，MRIcron为您提供“MultiSlice”功能，可为医学影像的各个部分创建单张照片，并将它们排成队列，以帮助您更迅速地进行比较。
ubuntu卸载fsl
08-10
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小白的第一篇分享：关于虚拟机Ubuntu18.04上安装FSL，MATLAB，Mricron
qq_37388306的博客
03-10 1185
@写给和我一样的菜鸟起飞教程（真的是菜鸟，大佬就不要看了） 回头看看这么简单地东西我竟然捣鼓了这么多天，真的是有点惭愧，这篇文章希望帮助到刚开始接触虚拟机啦，Linux的人，有问题的话我们可以讨论，你不嫌弃我的话哈哈哈，然后希望有一天我也能成为大佬吧，加油啊啊啊啊啊啊啊！ Ubuntu18.04系统和MATLAB的安装 这个网上已经有很多教程了，我就不废话了，只需要注意一点，64位系统一定要安装U...
mricron
weixin_38169927的博客
08-02 5085
MRIcron MRIcron是一个跨平台的NIfTI格式图像查看器。 它可以加载多层图像，生成体积渲染并绘制感兴趣的体积。 它还提供dcm2nii用于将DICOM图像转换为NIfTI格式和NPM以进行统计。 MRIcron是一种成熟而有用的工具，但您可能希望考虑更新的MRIcroGL作为替代方案。 转载于:https://www.cnblogs.com/d...
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