如何解决python读取大数据量文件时造成的内存溢出?

本文介绍了在Python中处理大CSV文件时遇到内存溢出问题的三种解决方案:文件拆分、分段读取(如pandas的chunksize参数)和使用polars模块。作者还推荐了EmEditor作为文件分割工具,并分享了Python学习资源,包括安装包、Web开发、爬虫、数据分析等内容。

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由于以前遇到的数据文件体量都比较小,今天在使用python读取csv文件时直接内存溢出了。

这里特意记录一下解决问题的三种方式,遇到的场景就是使用pandas模块直接读取csv文件然后返回DataFrame对象结果内存溢出。

首先,来看一下解决这个问题的思路是什么,然后再来分析怎么解决这个问题?

最简单的方式就是直接使用软件工具将大文件进行拆分,拆分完成后再进行读取。第二种则是在读取大文件的过程中直接分段读取,比如按照每十行读取的方式直接进行读取操作。

再或者第三种就是使用底层处理比较优质的模块,比如polars,它的底层存储方式就不会发生内存溢出的问题。

# Importing the pandas module and giving it an alias of pd.
import pandas as pd

# Reading the csv file and returning a DataFrame object.
result_ = pd.read_csv('G:/test/data.csv')

#   File "pandas\_libs\parsers.pyx", line 808, in pandas._libs.parsers.TextReader.read_low_memory
#   File "pandas\_libs\parsers.pyx", line 866, in pandas._libs.parsers.TextReader._read_rows
#   File "pandas\_libs\parsers.pyx", line 852, in pandas._libs.parsers.TextReader._tokenize_rows
#   File "pandas\_libs\parsers.pyx", line 1973, in pandas._libs.parsers.raise_parser_error
# pandas.errors.ParserError: Error tokenizing data. C error: Expected 3 fields in line 14, saw 4542

上面就是直接读取大数据量的csv文件会发生python内存溢出的报错。

若是想继续使用pandas模块读取大数量的文件,可以加上分割读取数据的参数就不会发生内存溢出的现象了。

# Reading the csv file in chunks of 10 rows.
result_ = pd.read_csv('G:/test/data.csv', chunksize=10)

chunksize设置为10,就是可以按照每十行的读取方式来读取csv的数据,并且返回的也是DataFrame的数据对象。

然后就是采用polars模块读取的方式来处理大数据量csv文件,polars本身对于大数据的文件支持比较好,并且读取速度也有很大的提升。

可以使用polars模块一次性读取csv文件直接返回DataFrame的数据对象。

# Importing the polars module and giving it an alias of pol.
import polars as pol

# Reading the csv file and returning a DataFrame object.
data_ = pol.read_csv('G:/test/data.csv')

# Printing the dataframe.
print(data_)

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最后一种方式提前将大数据文件做完文件分割之后再进行读取,如果是做文件分割的话推荐一个比较好用的数据文件分割工具-EmEditor。

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