16、蛋白质与DNA序列挖掘及连续序贯技术解析

蛋白质与DNA序列挖掘及连续序贯技术解析

蛋白质与DNA序列挖掘

基因科学的重要性与应用

基因科学，也就是常说的基因组学，自孟德尔开创以来，经过140年的发展，已成为生物医学领域发展最快的领域。它对我们的生活产生了重大影响，例如通过重组DNA技术，利用细菌或酵母的基因工程实现了各种药物的大规模生产，解决了全球药物供应不足的问题。

序列相似性搜索

序列相似性搜索是一种简单易用的方法，几乎任何人都可以用它来查找自己的查询序列与已知具有不同临床效应的序列之间的相似性。在这个过程中，p值对于区分高相似度和低相似度非常重要。不过，与BLAST交互式网站不同，MOTIF交互式网站不提供p值，这给从比对结果中进行推断带来了困难。

BLAST实例分析

示例3：25个氨基酸序列的分析

• 操作步骤 ：
  1. 打开BLAST搜索网站（指定地址）。
  2. 选择蛋白质BLAST。
  3. 点击“输入序列”，输入氨基酸序列“SIKLWPPSQTTRLLLVERMANNLST”。
  4. 点击BLAST。
• 输出结果 ：
  • 检测到假定结构域，特定匹配与WPP超家族有关。WPP结构域是一种由90个氨基酸组成的蛋白质，在植物细胞中作为其他蛋白质从细胞质膜到细胞核的转运蛋白。
  • 100个BLAST匹配在查询序列上的分布显示，所有匹配都有很高的比