BP神经网络+SHAP特征选择和贡献度计算,Matlab代码实现

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🔥 内容介绍

随着大数据时代的到来,机器学习模型在各个领域的应用日益广泛。然而,许多复杂的模型,如神经网络,往往被视为“黑箱”,难以理解其内部决策过程以及各特征对预测结果的影响。特征选择和贡献度计算是提升模型可解释性、优化模型性能的关键环节。本文聚焦于将BP(Backpropagation)神经网络与SHAP(SHapley Additive exPlanations)方法相结合,探讨在Matlab环境中实现基于SHAP的特征选择和贡献度计算。首先,对BP神经网络的原理及其在分类或回归任务中的应用进行简述;接着,详细阐述SHAP方法的核心思想、优势以及其在解释黑箱模型中的作用;然后,重点探讨如何在Matlab环境下实现构建BP神经网络模型、训练模型,并集成SHAP工具箱进行特征贡献度计算和可视化,进而实现特征选择。通过具体的Matlab代码示例,展示了整个流程的实现细节,并分析了不同特征对模型预测结果的影响程度。最后,对该方法在提高模型可解释性、优化模型结构以及实际应用中的价值进行了总结,并对未来的研究方向进行了展望。

关键词:BP神经网络;SHAP;特征选择;特征贡献度;Matlab;可解释性AI

引言

在机器学习领域,神经网络因其强大的非线性拟合能力而在众多复杂问题中取得了显著的成果。特别是BP神经网络,作为一种经典的多层前馈网络,在图像识别、语音处理、自然语言处理以及金融预测等领域都有着广泛的应用。然而,与线性模型或决策树等模型相比,神经网络的内部机制往往更加复杂,其决策过程对用户而言并不透明。这种“黑箱”特性在一些对可解释性要求较高的场景下(如医疗诊断、金融风控)成为了模型推广和应用的主要障碍。用户往往想知道模型为什么会做出这样的预测,哪些因素对结果起着关键作用。

为了解决神经网络的“黑箱”问题,可解释性人工智能(XAI)成为了当前研究的热点。其中,特征选择和特征贡献度计算是提升模型可解释性的重要手段。特征选择旨在从原始特征集中筛选出对模型预测最具影响力的子集,从而简化模型结构、降低过拟合风险、提高模型的泛化能力和计算效率。特征贡献度计算则量化了每个特征对模型最终预测结果的独立影响程度,帮助用户理解模型对输入特征的依赖关系。

近年来,SHAP方法作为一种统一的机器学习模型解释框架,因其理论基础扎实、解释效果直观且能够提供单个样本的局部解释以及整体模型的全局解释而受到广泛关注。SHAP方法基于合作博弈理论中的Shapley值,能够公平地分配每个特征对模型预测结果的贡献。

本文旨在探讨如何在Matlab环境下,将BP神经网络与SHAP方法有效地结合起来,实现基于SHAP的特征选择和贡献度计算。Matlab作为一种功能强大的数值计算和数据分析软件,其神经网络工具箱提供了便捷的BP神经网络构建和训练功能。同时,虽然Matlab原生并不直接支持SHAP工具箱,但可以通过接口调用或其他方式集成外部SHAP工具箱(如Python中的shap库)或利用Matlab自身的数据处理和可视化能力实现SHAP值的计算和分析。本文将重点探讨在Matlab环境中实现这一过程的可行性与具体步骤,并通过代码示例进行演示。

1. BP神经网络原理与Matlab实现

BP神经网络是一种多层前馈网络,其学习过程采用误差反向传播算法。网络由输入层、隐藏层和输出层组成,层与层之间通过权重和偏置连接。信号从输入层前向传播,经过隐藏层的非线性变换,最终到达输出层产生预测结果。如果在输出层产生的预测误差,则将误差沿连接权值反向传播,通过梯度下降法调整各层神经元的权值和偏置,以减小误差,直到达到预设的训练目标。

在Matlab中,可以利用神经网络工具箱(Neural Network Toolbox)方便地构建和训练BP神经网络。常用的函数包括:

  • feedforwardnet()

    :创建前馈神经网络模型,可以指定隐藏层的层数和每层神经元的数量。

  • train()

    :训练神经网络模型,需要输入训练数据、目标数据、训练算法、性能函数等参数。常用的训练算法包括Levenberg-Marquardt (trainlm)、Bayesian Regularization (trainbr)等。

  • predict()

    :使用训练好的模型对新的数据进行预测。

构建BP神经网络模型的一般步骤如下:

  1. 数据准备

    :将数据集分为训练集、验证集和测试集。对数据进行预处理,如归一化、标准化等。

  2. 网络结构设计

    :确定隐藏层的层数和每层神经元的数量。这通常需要通过实验或经验进行选择。

  3. 模型创建

    :使用feedforwardnet()函数创建BP神经网络模型。

  4. 模型训练

    :使用train()函数对模型进行训练,选择合适的训练算法和性能函数。

  5. 模型评估

    :使用验证集或测试集评估模型的性能,如均方误差(MSE)、R方(R-squared)等。

  6. 模型应用

    :使用训练好的模型对新的数据进行预测。

Matlab代码示例(BP神经网络构建与训练 - 伪代码):

 

matlab

% 加载数据  
load('your_data.mat'); % 假设数据存储在your_data.mat中,包含特征矩阵X和目标向量Y  

% 数据预处理 (示例: 归一化)  
X_normalized = normalize(X, 'range'); % 将特征缩放到[0, 1]范围  
Y_normalized = normalize(Y, 'range'); % 如果是回归问题,目标向量也可能需要归一化  

% 数据划分 (示例: 训练集、测试集)  
train_ratio = 0.8;  
test_ratio = 1 - train_ratio;  
[X_train, Y_train, X_test, Y_test] = dividerand(X_normalized', Y_normalized', train_ratio, 0, test_ratio);  

% 网络结构设计 (示例: 1个隐藏层,10个神经元)  
hiddenLayerSize = 10;  
net = feedforwardnet(hiddenLayerSize);  

% 配置训练参数  
net.trainFcn = 'trainlm'; % Levenberg-Marquardt算法  
net.performFcn = 'mse'; % 均方误差性能函数  

% 训练网络  
[net, tr] = train(net, X_train, Y_train);  

% 评估模型性能 (在测试集上)  
Y_pred_normalized = net(X_test);  
% 如果目标向量经过归一化,需要反归一化得到原始预测结果  
Y_pred = mapminmax('reverse', Y_pred_normalized, min(Y), max(Y));  

% 计算性能指标 (例如MSE)  
mse_test = mse(Y_pred, Y_test);  
disp(['Test MSE: ', num2str(mse_test)]);  

% 预测新的数据 (示例)  
new_X = [feature1, feature2, ...]; % 新数据的特征向量  
new_X_normalized = normalize(new_X, 'range'); % 对新数据进行同样的数据预处理  
new_Y_pred_normalized = net(new_X_normalized');  
new_Y_pred = mapminmax('reverse', new_Y_pred_normalized, min(Y), max(Y));  
disp(['Predicted Y: ', num2str(new_Y_pred)]);  

2. SHAP方法原理与优势

SHAP (SHapley Additive exPlanations) 是一种基于合作博弈理论的统一模型解释框架。其核心思想是将每个特征对模型预测结果的贡献视为一个“ Shapley value”。Shapley value源于合作博弈论,用于公平地分配合作所产生的总收益给每个参与者。在模型解释的场景下,每个特征被视为一个“参与者”,预测结果被视为“总收益”,而Shapley value则量化了每个特征对预测结果的独立贡献。

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2.1 bp时序、回归预测和分类

2.2 ENS声神经网络时序、回归预测和分类

2.3 SVM/CNN-SVM/LSSVM/RVM支持向量机系列时序、回归预测和分类

2.4 CNN|TCN|GCN卷积神经网络系列时序、回归预测和分类

2.5 ELM/KELM/RELM/DELM极限学习机系列时序、回归预测和分类
2.6 GRU/Bi-GRU/CNN-GRU/CNN-BiGRU门控神经网络时序、回归预测和分类

2.7 ELMAN递归神经网络时序、回归\预测和分类

2.8 LSTM/BiLSTM/CNN-LSTM/CNN-BiLSTM/长短记忆神经网络系列时序、回归预测和分类

2.9 RBF径向基神经网络时序、回归预测和分类

2.10 DBN深度置信网络时序、回归预测和分类
2.11 FNN模糊神经网络时序、回归预测
2.12 RF随机森林时序、回归预测和分类
2.13 BLS宽度学习时序、回归预测和分类
2.14 PNN脉冲神经网络分类
2.15 模糊小波神经网络预测和分类
2.16 时序、回归预测和分类
2.17 时序、回归预测预测和分类
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<think>我们参考用户提供的引用,特别是引用[1]、[2]、[4]都涉及了使用MATLAB实现CNNSHAP进行图像或特征数据的分类解释。用户明确要求二分类任务的代码。下面我们将按照以下步骤构建代码框架: 1. **数据准备**:加载数据集,进行预处理(如图像归一化、标签处理、数据集划分)。 2. **构建CNN模型**:创建一个适合二分类的卷积神经网络。 3. **训练模型**:使用训练集训练CNN模型,并在测试集上评估性能。 4. **SHAP分析**:使用训练好的模型,利用SHAP值来解释模型的预测,可视化特征重要性(对于图像,可以显示显著图;对于特征数据,可以显示每个特征的贡献)。 注意:MATLAB中并没有内置的SHAP计算函数,但我们可以通过以下方式之一实现: a) 使用MATLAB的Deep Learning Toolbox结合第三方工具(如调用Python的SHAP库)。 b) 或者使用MATLAB的LIME(Local Interpretable Model-agnostic Explanations)工具,但用户要求SHAP。 由于MATLAB直接支持调用Python,我们可以通过MATLAB的Python接口调用SHAP库。这里假设用户已经安装了Pythonshap库。 步骤: 1. **数据准备**:我们以图像数据为例(如果是特征数据,则需要调整数据维度)。 2. **构建CNN模型**:使用MATLAB的深度学习工具箱创建简单的CNN。 3. **训练模型**:使用`trainNetwork`函数。 4. **SHAP分析**:将训练好的模型传递给Python环境,使用SHAP的DeepExplainer进行解释。 由于代码较长,我们将分块展示关键部分。 ### MATLAB代码框架 ```matlab %% 1. 数据准备 % 假设我们有一个图像数据集,存储在一个4D数组中:images (height x width x channels x numImages) % 标签为categorical向量:labels(包含两类,如'class0','class1') % 示例:加载内置数据集(这里使用digitDataset作为示例,实际中请替换为二分类图像数据) digitDatasetPath = fullfile(matlabroot,'toolbox','nnet','nndemos','nndatasets','DigitDataset'); imds = imageDatastore(digitDatasetPath, ... 'IncludeSubfolders',true,'LabelSource','foldernames'); % 只取两类(例如,只取01) imds = subset(imds, imds.Labels == '0' | imds.Labels == '1'); % 划分训练集测试集 [imdsTrain, imdsTest] = splitEachLabel(imds, 0.7, 'randomized'); % 图像预处理:调整大小(如果需要)归一化 inputSize = [28 28 1]; % 根据实际情况调整 imdsTrain = augmentedImageDatastore(inputSize(1:2), imdsTrain, 'ColorPreprocessing', 'gray2rgb'); imdsTest = augmentedImageDatastore(inputSize(1:2), imdsTest, 'ColorPreprocessing', 'gray2rgb'); %% 2. 构建CNN模型 layers = [ imageInputLayer(inputSize) % 输入层 convolution2dLayer(3,8,'Padding','same') % 卷积层 batchNormalizationLayer reluLayer maxPooling2dLayer(2,'Stride',2) convolution2dLayer(3,16,'Padding','same') batchNormalizationLayer reluLayer maxPooling2dLayer(2,'Stride',2) convolution2dLayer(3,32,'Padding','same') batchNormalizationLayer reluLayer fullyConnectedLayer(2) % 二分类,输出为2 softmaxLayer classificationLayer]; options = trainingOptions('adam', ... 'MaxEpochs',10, ... 'ValidationData',imdsTest, ... 'ValidationFrequency',30, ... 'Verbose',false, ... 'Plots','training-progress'); %% 3. 训练模型 net = trainNetwork(imdsTrain, layers, options); % 评估模型 YPred = classify(net, imdsTest); YTest = imdsTest.Labels; accuracy = sum(YPred == YTest)/numel(YTest); disp(['测试集准确率: ', num2str(accuracy)]); %% 4. SHAP分析 % 注意:这里需要调用Python的SHAP库。确保已经安装shap(在Python环境中:pip install shap) % 将训练好的模型转换为适合Python使用的格式(例如保存为.h5文件) save('cnn_model.h5', 'net', '-v7.3'); % 注意:MATLAB的save函数保存为.mat,但为了Python读取,我们可以导出为ONNX格式 % 更推荐导出为ONNX格式 exportONNXNetwork(net, 'cnn_model.onnx'); % 然后,我们使用MATLAB调用Python脚本来计算SHAP值 % 创建一个Python脚本(例如shap_explainer.py)并调用它,或者在MATLAB中直接执行Python代码 % 在MATLAB中设置Python环境 pe = pyenv; if pe.Status == 'NotLoaded' pyenv('Version','your_python_executable_path'); % 替换为你的Python路径 end % 调用Python解释器 py.importlib.import_module('shap'); py.importlib.import_module('numpy'); py.importlib.import_module('tensorflow'); py.importlib.import_module('onnx'); py.importlib.import_module('onnxruntime'); % 编写Python代码字符串(或单独写一个.py文件) pyscript = [... 'import shap\n' ... 'import numpy as np\n' ... 'import onnxruntime as ort\n' ... 'from scipy.special import softmax\n' ... '\n' ... '# 加载ONNX模型\n' ... 'sess = ort.InferenceSession("cnn_model.onnx")\n' ... '\n' ... '# 准备背景数据测试数据(这里背景数据取训练集的一部分,例如100个样本)\n' ... '# 注意:需要将MATLAB数据传递到Python,这里我们用numpy数组\n' ... '# 假设我们已经从MATLAB中保存了背景数据测试数据到.npy文件\n' ... '# 这里我们为了简化,在MATLAB中保存数据,然后在Python中加载\n' ... '\n' ... '# 定义预测函数\n' ... 'def predict(x):\n' ... ' # 输入x的形状为(n_samples, height, width, channels)\n' ... ' # ONNX模型可能需要调整输入格式(例如通道优先),具体取决于导出时的设置\n' ... ' # 此处假设导出时为通道最后(HWC),且输入名为input层名称(例如input_1)\n' ... ' input_name = sess.get_inputs()[0].name\n' ... ' output_name = sess.get_outputs()[0].name\n' ... ' # 注意:x的数据类型应为float32\n' ... ' pred = sess.run([output_name], {input_name: x.astype(np.float32)})[0]\n' ... ' return pred\n' ... '\n' ... '# 创建DeepExplainer\n' ... '# 背景数据(这里假设背景数据为100个训练样本,已从MATLAB中保存为background.npy)\n' ... 'background = np.load("background.npy")\n' ... 'explainer = shap.DeepExplainer(predict, background)\n' ... '\n' ... '# 选择一个测试样本(假设测试数据已保存为test_sample.npy)\n' ... 'test_sample = np.load("test_sample.npy")\n' ... 'shap_values = explainer.shap_values(test_sample)\n' ... '\n' ... '# 可视化第一个样本的SHAP值(假设是图像分类)\n' ... 'shap.image_plot(shap_values[1], test_sample, show=False)\n' ... 'import matplotlib.pyplot as plt\n' ... 'plt.savefig("shap_plot.png")\n' ... 'plt.close()\n' ... ]; % 在MATLAB中保存背景数据测试数据 % 首先获取背景数据(训练集前100个) backgroundData = readall(imdsTrain); backgroundData = cat(4, backgroundData.input{:}); backgroundData = backgroundData(:,:,:,1:100); % 取前100个作为背景 % 保存为.npy文件(需要numpy的读写支持,可以使用MATLAB的npyio工具包,或通过Python保存) % 这里我们使用MATLAB的函数(需要下载npy-matlab:https://github.com/kwikteam/npy-matlab) % 假设已经将npy-matlab添加到路径 addpath('path_to_npy_matlab'); % 替换为实际路径 writeNPY(backgroundData, 'background.npy'); % 选择一个测试样本 testData = read(imdsTest); testSample = testData.input{1}; % 取第一个测试样本 testSample = permute(testSample, [2 3 4 1]); % 调整维度为[height, width, channels, 1] -> 在Python中为[1, height, width, channels] writeNPY(testSample, 'test_sample.npy'); % 运行Python脚本 py.eval(pyscript); % 显示SHAPshapPlot = imread('shap_plot.png'); imshow(shapPlot); ``` ### 注意事项 1. **数据格式**:在MATLABPython之间传递图像数据时,注意维度顺序。MATLAB图像数据存储为[height, width, channels, num],而Python中通常是[height, width, channels](单个样本)或[num, height, width, channels]。在导出到ONNX时,MATLAB默认使用通道优先(NCHW),但ONNX模型可以支持多种格式。我们的代码中假设输入格式为HWC(通道最后),因此可能需要调整。 2. **SHAP解释器**:SHAP的DeepExplainer目前主要支持TensorFlow/KerasPyTorch模型。对于ONNX模型,我们需要提供一个预测函数,该函数调用ONNX Runtime进行推理。 3. **二分类问题**:在二分类中,SHAP值通常是对每个类别的输出分别计算。注意我们使用`shap_values[1]`来可视化第二个类别(索引1)的SHAP值(因为SHAP返回两个类别的值,索引0对应第一类,索引1对应第二类)。如果要解释第一类,使用`shap_values[0]`。 ### 简化版(如果只想在MATLAB中使用) 如果用户不想调用Python,可以考虑使用MATLAB的LIME方法(`imageLIME`)进行解释,但用户要求SHAP。因此,调用Python是必要的。 ### 相关问题 §§相关问题§§ 1. 如何在MATLAB中安装并配置Python环境? 2. 除了SHAPMATLAB中有哪些模型可解释性工具? 3. 如何将MATLAB深度学习模型导出为ONNX格式? 4. 对于非图像数据(特征数据),如何使用CNNSHAP进行二分类? </think>以下是使用CNNSHAP进行二分类任务的MATLAB完整实现代码框架,结合引用内容并遵循最佳实践: ```matlab %% 1. 数据准备与预处理 % 引用[2]数据准备方法 [data, labels] = loadBearingData(); % 加载数据集(示例使用轴承数据) [trainData, testData, trainLabels, testLabels] = splitData(data, labels, 0.8); % 80%训练集 % 数据标准化 trainData = normalize(trainData); testData = normalize(testData); % 将标签转换为分类类型(二分类) trainLabels = categorical(trainLabels); testLabels = categorical(testLabels); %% 2. 构建CNN模型(引用[2][4]结构) layers = [ imageInputLayer([64 64 1]) % 输入层(根据实际数据尺寸调整) convolution2dLayer(3, 32, 'Padding','same') % 卷积层1 batchNormalizationLayer reluLayer maxPooling2dLayer(2, 'Stride', 2) convolution2dLayer(3, 64, 'Padding','same') % 卷积层2 batchNormalizationLayer reluLayer maxPooling2dLayer(2, 'Stride', 2) fullyConnectedLayer(128) % 全连接层 reluLayer fullyConnectedLayer(2) % 二分类输出层 softmaxLayer classificationLayer]; options = trainingOptions('adam', ... 'MaxEpochs', 30, ... 'MiniBatchSize', 32, ... 'ValidationData', {testData, testLabels}, ... 'Plots', 'training-progress'); %% 3. 训练CNN模型 net = trainNetwork(trainData, trainLabels, layers, options); %% 4. 模型评估 predLabels = classify(net, testData); accuracy = sum(predLabels == testLabels)/numel(testLabels); disp(['测试准确率: ', num2str(accuracy*100), '%']); %% 5. SHAP可解释性分析(引用[1][4]方法) % 需要安装Python SHAP库并通过MATLAB调用 pe = pyenv; % 检查Python环境 if pe.Status == "NotLoaded" pyenv('Version','C:\Python\Python310\python.exe'); % 指定Python路径 end % 导出模型为HDF5格式(SHAP兼容) save('cnn_model.h5', 'net', '-v7.3'); % 调用Python SHAP解释器 shapScript = [ 'import h5py\n'... 'import shap\n'... 'import numpy as np\n'... 'from keras.models import load_model\n'... '\n'... '# 加载MATLAB导出的模型\n'... 'model = load_model("cnn_model.h5")\n'... '\n'... '# 创建背景数据(训练集样本)\n'... 'background = np.load("background_samples.npy")\n'... '\n'... '# 创建解释器\n'... 'explainer = shap.DeepExplainer(model, background)\n'... '\n'... '# 计算测试样本的SHAP值\n'... 'test_sample = np.load("test_sample.npy")\n'... 'shap_values = explainer.shap_values(test_sample)\n'... '\n'... '# 可视化结果\n'... 'shap.image_plot(shap_values, test_sample, show=False)\n'... 'plt.savefig("shap_output.png")\n' ]; % 保存数据供Python使用 background_samples = trainData(:,:,:,1:100); % 随机选取100个背景样本 save('background_samples.npy', 'background_samples', '-mat'); test_sample = testData(:,:,:,1); % 选择第一个测试样本 save('test_sample.npy', 'test_sample', '-mat'); % 执行Python脚本 pyrun(shapScript); %% 6. 结果可视化(引用[1][4]) shapImage = imread('shap_output.png'); figure imshow(shapImage) title('SHAP特征重要性可视化'); ``` ### 关键说明: 1. **数据预处理**: - 使用`normalize()`进行数据标准化 - 标签转换为二分类categorical格式(如[0,1]) 2. **CNN架构特点**: - 双卷积层 + 池化层提取特征 - SE注意力模块可添加在卷积层后(引用[2]) ```matlab % SE注意力模块示例(需自定义层) seBlock = [ globalAveragePooling2dLayer fullyConnectedLayer(8) reluLayer fullyConnectedLayer(64) sigmoidLayer multiplicationLayer]; ``` 3. **SHAP分析原理**: - 基于Shapley值量化特征贡献(引用[4]) - 使用DeepExplainer解释CNN决策 - 输出显示关键像素/特征区域(引用[1]) 4. **环境要求**: - MATLAB R2021a+ - Deep Learning Toolbox - Python 3.6+ 安装shap库:`pip install shap` ### 优化建议: 1. 添加**SE注意力机制**提升特征提取能力(引用[2]) 2. 使用**数据增强**防止过拟合(随机旋转/平移) 3. 对**高维特征数据**改用KernelExplainer(引用[3]) > 完整实现需要根据具体数据集调整输入层尺寸预处理步骤。对于非图像数据,需将`imageInputLayer`替换为`featureInputLayer`并调整网络结构[^3][^4]。
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