生信自学笔记（二）生物信息

基本类型

1. 核苷酸序列数据

DNA 或 RNA 当中四种碱基的排列顺序。

• DNA : A T C G
• RNA : A G C U

2. 蛋白质序列和结构数据

蛋白质序列是指 20 种氨基酸的排列顺序（即蛋白质的一级结构）。
蛋白质结构数据指的是蛋白质的三级结构信息。其三级结构是在各种二级结构的基础上，再进一步盘曲或者折叠形成的具有一定规律的三维空间结构。蛋白质二级结构（英语：Protein secondary structure）在生物化学及结构生物学中，是指一个生物大分子，如蛋白质及核酸（DNA 或 RNA），局部区段的三维通式。二级结构是由生物大分子在原子分辨率结构中所观察到的氢键来定义的。蛋白质的二级结构通常是以主链中氨基之间的氢键模式来定义

3. 分子标记数据

分子标记（Molecular marker）是遗传标记的一种，是在基因水平上的标记，是直接在 DNA 分子上检测遗传变异。分子标记能对不同发育时期的个体、任何组织器官甚至细胞作检测，数量极多，遍及整个