【毕设学习之转录组技术三：历代测序技术】

最新推荐文章于 2025-12-05 17:59:21 发布
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#学习

博客主要提及了第一代测序和第二代测序相关内容，虽未展开详细信息，但聚焦于这两种测序技术。

##第一代测序

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##第二代测序
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【生信】第一二三代测序技术原理的理解
weixin_40695088的博客
12-31 1万+
作为生信初学者，对基因测序第一、二、三代测序技术的梳理和了解，详细介绍了几个广泛应用的测序技术原理如sanger测序和illumina测序等，仅供学习使用。
三代基因组测序技术原理简介
weixin_30484739的博客
08-02 5659
考虑到cnblog不适合基因组领域这种类型的文章， 最终，我自己开通了公众号：碱基矿工，欢迎感兴趣的同学关注！ 也可以关注我的知乎：https://www.zhihu.com/people/yellowtree/activities 2018年1月修改：这篇文章写于2013年，首发在cnblog上，目前已经比较旧了。我重新在WGS系列中对其进行重写，建议移步到这里 　...
【毕设学习之转录组技术二：转录流程】
hhhhhhhhappy的博客
12-30 239
生物信息学：转录流程
【毕设学习之转录组技术一：基因组成+转录流程】
hhhhhhhhappy的博客
12-28 1181
生物信息学
单细胞测序系列之三：单细胞转录组测序
mashiqing的博客
09-30 7035
2006年，Kurimoto等发表了An improved single-cell cDNA amplification method for efficient high-density oligonucleotide microarray analysis这篇文章，其中使用的技术中，已经可见后来的单细胞测序技术的一些雏形1。使用带有polyT尾的V1引物和带有polyA尾的mRNA结合进行逆转录，然后使用Exonucleas I去除多余的引物。
生信分析1：转录组测序数据分析概述
Iseayou2024的博客
07-27 1087
本文概述了转录组测序技术的发展历程与应用。从1970年代的第一代杂交技术到当今的单细胞和空间转录组测序，技术不断革新。文章详细介绍了普通转录组测序（Bulk RNA-seq）的数据处理流程，包括质控、比对、定量和差异表达分析等步骤，并对比了其与单细胞转录组测序的差异。单细胞测序技术（如10x Genomics平台）能揭示细胞异质性，而空间转录组技术则保留了组织空间信息。这些技术各有优势，在未来的研究中互补应用将提供更全面的生物学见解。
DIST：利用深度学习增强空间转录组学
m0_67511537的博客
10-31 2263
摘要 空间分辨转录组学技术能够全面测量完整组织背景下的基因表达模式。然而，现有技术存在分辨率低或测序深度浅的问题。在此，我们提出了一种基于深度学习的方法 DIST，它能对未测量位置的基因表达谱进行推算，并通过自我监督学习和迁移学习来增强原始测量点和推算点的基因表达。我们评估了 DIST 在估算、聚类、差异表达分析和功能富集分析方面的性能。结果表明，DIST 可以准确地估算基因表达量，提高低质量数据的基因表达量，帮助检测更多有生物学意义的差异表达基因和通路，从而更深入地了解生物学过程。 关键词：空间转录组
转录组入门3：了解fastq测序数据（补遗）
Duke_of_Connacht的博客
12-10 1951
fastqc 检测测序文件质量 创建一个文件夹 mkdir fastqc/ 创建一个fastqc.sh脚本 -o: 输出路径 -t: 线程数，和电脑配置有关，每个线程需要250MB 的内存 质量解读 html 格式用浏览器打开 基本信息 Enconding: 测序平台版本号 Total Sequence: reads 的数量 Sequence length: 总的序列数 %GC GC比，这个指标...
Nature Microbiology丨VITA单细菌转录组测序技术助力深入解析奶牛瘤胃微生物组功能异质性
SHANGHAILINGEN的博客
06-17 1480
瘤胃微生物组一直以来都是研究相对不足但又极其复杂的微生物生态系统之一。
基于Python开发的TransAnnot：高效三代全长转录组测序注释软件设计源码
10-03
基于Python开发的TransAnnot软件是一套高效且功能全面的三代全长转录组测序注释工具，它的设计和开发专注于为生物信息学领域的研究者提供一个便捷的平台来进行全长转录组的注释工作。该软件的源码工程由多个文件构成...
转录组测序分析全流程解析
07-15
转录组测序是利用高通量测序技术，快速获取某一物种在特定状态下的转录本序列信息，其基础在于揭示基因的功能和结构特征。 转录组测序的主要目的包括： 检测转录水平差异：比较不同样本的转录水平，发现基因的上调或...
转录组测序技术PPT学习教案.pptx
10-05
转录组测序技术PPT学习教案 转录组测序技术（RNA-Seq）是指利用第二代高通量测序技术进行cDNA测序，全面快速地获取某一物种特定器官或组织在某一状态下的几乎所有转录本。该技术可以对转录本进行高通量检测，提供了...
【毕业设计之转录组技术四：RNA建库】
hhhhhhhhappy的博客
12-30 1251
生物信息学：RNA建库
【PCIe 总线及设备入门学习专栏 5.4 -- Linux EP driver iommu 与 DMA】
CodingCos的博客
12-04 70
本文介绍了IOMMU在Linux系统中的应用场景及关键概念。IOMMU主要用于PCIe设备DMA访问时的地址转换(IOVA→PA)、提供安全隔离以及支持虚拟化场景。文章对比了启用/关闭IOMMU的差异，详细说明了IOVA的使用时机，并列举了内核态地址转换的相关API，包括虚拟地址转物理地址(virt_to_phys)、用户态地址转换(get_user_pages)以及IOMMU相关转换(iommu_iova_to_phys)。特别指出CPU访问BAR时不经过IOMMU，只有PCIe设备DMA时才需要IOMM
算法题归类学习
最新发布
qq_43751506的博客
12-05 360
删除排序链表中的重复元素II（LeetCode 82） - 全删除。删除排序链表中的重复元素（LeetCode 83） - 保留一个。删除链表的倒数第N个结点（LeetCode 19） - 快慢指针。二叉树的最大深度（LeetCode 104） - DFS/BFS。二叉树的最近公共祖先（LeetCode 236） - 递归查找。二叉树的层序遍历（LeetCode 102） - BFS队列。二叉树的中序遍历（LeetCode 94） - 递归/迭代。环形链表（LeetCode 141） - 快慢指针判环。
vite学习
qq_41549657的博客
12-04 624
核心优势极速开发启动：开发阶段不打包，直接让浏览器加载原生ESM,配合ebuild预购建第三方依赖，启动时间从webpack的秒级变为毫秒级热更新（HMR）快:只更新修改的模块，而非全量重建，大型项目热更新耗时<10ms按需编译：开发阶段仅编译当前请求的模块，而非全量打包内置对Typescript、JSX、CSS、静态资源的支持，无需复杂配置生产环境优化：基于Rollup打包，输出高度优化的静态资源，兼顾开发销量和生产性能<docs>Vite 处理.vue。
【Prompt学习技能树地图】LangChain原理及应用操作指南
致力于成为一名data scientist 的奋斗者
12-03 684
基础层主要解决两个核心问题：模型调用的统一化和数据存储的标准化。通过抽象接口设计，为上层应用提供了稳定、可预测的编程模型。表3.2：基础层核心组件概览组件类别核心功能解决的关键问题典型实现模型抽象统一模型调用接口屏蔽不同模型API差异存储抽象统一数据访问方式标准化各类存储系统操作文档处理多格式文档加载与转换统一文档处理流程PDF、HTML、Markdown解析接口规范定义标准化调用契约确保组件间兼容性BaseLLM、VectorStore接口。
学习笔记二十三：支持向量机-间隔与支持向量
dengdaijc的专栏
12-02 734
本文介绍了支持向量机(SVM)的基本原理。SVM通过在样本空间中寻找最优划分超平面来实现分类，其核心思想是最大化分类间隔以提高泛化能力。关键概念包括：划分超平面的数学表示（由法向量和位移项定义）、支持向量（决定超平面位置的最近样本点）以及间隔（反映分类置信度）。SVM的基本型是一个凸二次规划问题，通过最小化法向量范数平方来最大化间隔，同时满足所有样本正确分类的约束条件。该方法具有理论严谨、模型稀疏、全局最优等优势，是经典的分类学习算法。
【办公软件学习】
qq_44901836的博客
12-03 589
办公软件学习技巧，解决办法
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