【毕设学习之转录组技术一:基因组成+转录流程】

本文介绍了转录组学的基础,包括基因的编码区与非编码区、外显子和内含子的区别,以及DNA复制、转录和翻译的过程。转录组学借助RNA-seq技术研究基因表达变化,揭示基因调控网络。重点讨论了转录流程中的mRNA、CDS和ORF概念。

转录组学(一)

       转录组学是功能基因组研究的重要手段,其研究包括 mRNA 和非编码 RNA 的全套转录本 。机体内同一基因在不同时间、不同组织中的表达情况往往不同。转录组学可在 RNA 水平研究特定细胞、组织或器官在不同生长发育阶段或不同生理状况下基因表达的情况,挖掘具有特定生物学功能的关键差异基因;预测具有调控功能的 lncRNA 和具有负调控功能的 miRNA;揭示 circRNA 竞争性内源RNA(ceRNA)调控机制;以及复杂的相互调控网络。基于高通量测序的 RNA-seq 技术是当前转录组学研究的主要手段,因其具有灵敏度高、噪音低、检测范围广的优点 ,被广泛运用于畜禽功能基因的挖掘和分子遗传网络调控机制的研究中。

基因组成结构

       基因DNA分为编码区和非编码区。
       编码区,是细胞DNA的一部分,能够转录信使RNA的部分,它能够合成相应的蛋白质。非编码区(Non-coding region)是不能够转录为相应信使RNA,不能指导蛋白质合成(也就是不能编码蛋白质)的区段。非编码区位于编码区前后,同属于一个基因,控制基因的表达和强弱。
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外显子和内含子

       外显子拼接形成成熟的mRNA,多数基因都有UTR(Untranslated Region,非编码区),它们也是外显子拼接的产物,所以,你会发现mRNA的长度要大于CDS,只有CDS才编码蛋白。外显子与CDS区不是完全一致的,CDS区一定属于外显子,但是外显子不一定是CDS区,也就是说外显

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