新冠病毒检测:数字PCR与RT - PCR的联合应用及优势分析
1. 样本检测结果与分析
在新冠病毒检测中,样本25659通过DPCR检测显示为临界阴性(N = 2;ORF1ab = 0),但在第二次Cobas®评估中,E基因和ORF基因的Ct值分别为37.3和34.9。基于这些结果,该样本被认定为真正的阳性样本。
2. DPCR测量与Ct值的相关性
研究发现,DPCR中观察到的阳性液滴数量与各组阳性样本的Ct值之间存在良好的相关性。具体表现为:
- 对于N基因靶标,在8、16和32样本组中,DPCR测量的阳性液滴数量与使用Cobas® SARS - CoV - 2检测法进行RT - PCR测量的E基因预测等效Ct值之间有对应关系。预测等效Ct值是考虑Ct值对数尺度后,组内阳性样本Ct值的平均值。
- 对于ORF1ab基因靶标,同样在8、16和32样本组中,DPCR测量的阳性液滴数量与使用Cobas® SARS - CoV - 2检测法进行RT - PCR测量的ORF基因预测等效Ct值存在关联。
以下是相关关系的表格展示:
|基因靶标|样本组大小|关联关系|
| ---- | ---- | ---- |
|N基因|8、16、32|DPCR阳性液滴数量与E基因预测等效Ct值相关|
|ORF1ab基因|8、16、32|DPCR阳性液滴数量与ORF基因预测等效Ct值相关|
3. 数字PCR与分组检测的评估
研究评估了将分组检测与数字PCR相结合用于SARS - CoV - 2检测的敏感性和特异性。采用市售的COVID - 19多重数字PCR检测试剂盒,该试剂盒
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