12、RT-PCR、抗体检测与数字聚合酶链反应：原理、局限与性能评估

RT-PCR、抗体检测与数字聚合酶链反应：原理、局限与性能评估

一、RT - PCR与抗体检测

在病毒检测中，RT - PCR和抗体检测是常用的方法。当人群中的新冠感染率为1%时，每检测10000人，大约会漏诊22例新冠病例。一种高传染性的病毒可能会通过这些误诊病例继续传播。

在对确诊新冠患者进行的RT - PCR检测中，咽喉拭子样本中SARS - CoV - 2呈阳性的比例，有研究报告仅为32%，而另一项研究中，重症病例为60%，轻症病例为61%。不过，这些数值与本研究中定义的灵敏度并不完全等同。本研究估计的灵敏度可能高于上述研究，可能原因是疫情中心收集的数据中病毒载量较高。而且，本研究中RT - PCR检测SARS - CoV - 2的灵敏度与之前检测SARS的灵敏度（0.80）相近，这可能是因为两种病毒的基因组相似度达82%。

这项研究存在一些局限性：
1. 估计的灵敏度和特异性仅适用于2020年1月至2月在中国武汉紧急开发和使用的特定版本的RT - PCR检测。世界各地的实验室开发了自己的RT - PCR检测版本，后续检测性能可能有所变化。
2. 这是一项基于诊断错误概率知识的回顾性研究。若能设计一项将RT - PCR诊断准确性与更好的金标准方法进行比较的研究，将能提供更明确的估计和更窄的置信区间。
3. 缺乏采样患者感染严重程度的数据以及RT - PCR检测中病毒载量的测量值（如循环阈值）。

通过对中国武汉1014名患者的数据重建了新冠RT - PCR检测的诊断灵敏度和特异性。利用改进的贝叶斯分析量化了由于测试结果和疾病状态联合分布知识不完整以及采样误差带来的不确定性。结果显示，通过咽喉拭子进行的RT - PCR检测有明