PyMOL开源项目安装与使用教程

PyMOL开源项目安装与使用教程

pymol-open-source Open-source foundation of the user-sponsored PyMOL molecular visualization system. 项目地址: https://gitcode.com/gh_mirrors/py/pymol-open-source

1. 项目的目录结构及介绍

PyMOL开源项目的目录结构如下：

pymol-open-source/
├── AUTHORS
├── CMakeLists.txt
├── ChangeLog
├── DEVELOPERS
├── INSTALL
├── LICENSE
├── PACKAGING
├── README
├── README.md
├── create_shadertext.py
├── monkeypatch_distutils.py
├── pyproject.toml
├── setup.py
├── github/
│   └── workflows/
│       └── _custom_build_custom_build
├── contrib/
├── data/
├── examples/
├── include/
├── layer0/
├── layer1/
├── layer2/
├── layer3/
├── layer4/
├── layer5/
├── layerCTest/
├── modules/
├── ov/src/
├── test/dat/
└── testing/
    └── clang-format

目录结构介绍

• AUTHORS: 项目作者列表。
• CMakeLists.txt: CMake构建文件。
• ChangeLog: 项目变更日志。
• DEVELOPERS: 开发者指南。
• INSTALL: 安装指南。
• LICENSE: 项目许可证。
• PACKAGING: 打包相关文件。
• README: 项目介绍。
• README.md: 项目介绍的Markdown格式文件。
• create_shadertext.py: 创建着色器文本的Python脚本。
• monkeypatch_distutils.py: 用于修补distutils的Python脚本。
• pyproject.toml: Python项目配置文件。
• setup.py: Python安装脚本。
• github/workflows/_custom_build_custom_build: GitHub Actions工作流配置文件。
• contrib/: 贡献者提供的文件。
• data/: 项目数据文件。
• examples/: 示例文件。
• include/: 头文件目录。
• layer0/, layer1/, layer2/, layer3/, layer4/, layer5/: 分层目录，可能包含不同层次的代码或资源。
• layerCTest/: 测试层目录。
• modules/: 模块目录。
• ov/src/: 源代码目录。
• test/dat/: 测试数据目录。
• testing/clang-format: 测试相关的clang-format配置文件。

2. 项目的启动文件介绍

PyMOL开源项目的启动文件主要是setup.py。这个文件是一个标准的Python安装脚本，用于配置和安装PyMOL。

setup.py 文件介绍

• 功能: 该文件负责项目的构建、安装和打包。它通常包含项目的元数据（如名称、版本、依赖项等）以及构建和安装的指令。
• 使用方法: 在项目根目录下运行python setup.py install即可安装PyMOL。

3. 项目的配置文件介绍

PyMOL开源项目的配置文件主要包括pyproject.toml和CMakeLists.txt。

pyproject.toml 文件介绍

• 功能: 该文件是Python项目的配置文件，用于定义项目的构建系统和依赖项。它通常包含项目的元数据、构建工具配置和依赖项信息。
• 内容示例:

  [build-system]
  requires = ["setuptools", "wheel"]
  build-backend = "setuptools.build_meta"
  

CMakeLists.txt 文件介绍

• 功能: 该文件是CMake的配置文件，用于定义项目的构建过程。它包含项目的源文件、目标文件、依赖项等信息。
• 内容示例:

  cmake_minimum_required(VERSION 3.10)
  project(PyMOL)
  add_executable(pymol main.cpp)
  target_link_libraries(pymol PRIVATE some_library)
  

通过以上介绍，您可以更好地理解PyMOL开源项目的目录结构、启动文件和配置文件，从而更方便地进行安装和使用。

pymol-open-source Open-source foundation of the user-sponsored PyMOL molecular visualization system. 项目地址: https://gitcode.com/gh_mirrors/py/pymol-open-source