97、胰腺癌与胚胎发生的关联及患者电子健康记录访问工作流研究

胰腺癌与胚胎发生的关联及患者电子健康记录访问工作流研究

一、数据集与预处理

1. 数据集分类
   • 共有12个数据集，分为三类：
     • 人类胚胎数据集（GSE15744），描述了人类胚胎从第4周到第9周的发育情况。
     • 胰腺癌人类组织数据集（GSE32676 - GSE71989 - GSE19281 - GSE15471 - GSE16515 - GSE28735 - GSE62452），包含229个胰腺癌组织细胞样本和176个正常细胞样本。
     • 胰腺癌人类外周血数据集（GSE49515 - GSE60601 - GSE15932 - GSE49641），包含38个胰腺癌患者外周血细胞样本和39个正常供体的正常细胞样本。
2. 数据预处理
   • 对所有数据集应用GC稳健多阵列平均（GCRMA）方法，该方法包括背景校正、分位数归一化和log2转换三个步骤。
   • 除了GPL6244（缺少错配探针）使用oligo R包处理外，大多数数据集使用GCRMA R包处理。

数据集类型	数据集编号	样本情况
人类胚胎