单细胞数据最常用的聚类方法有两种,t-SNE和UMAP (Uniform Manifold Approximation and Projection (T-distributed Stochastic Neighbor Embedding),选择哪种方法进行可视化在最开始是非常纠结的,因为选择哪一个都不能说错,搜集了一下描述降维聚类的方法,看着看着就放弃了,但还是整理了一些比较有用的资源。
1. UMAP, tSNE和PCA聚类结果的比较
2. UMAP降维算法原理详解和应用示例_deephub的博客-优快云博客_umap
4. 最详细的一个,也是最专业的一个