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RSS订阅原创 如何选择最适转录本序列构建过表达质粒
主要利用的数据库有 NCBI 和 Uniprot 数据库，首先在 NCBI 检索绵羊 PPARG 基因信息，可以发现绵羊 PPARG 有8个转录本，而人就更多了，有16个转录本。这时就需要明确一个概念，构建过表达质粒使用的是 CDs 序列，转录本一般是包含CDs序列和非编码序列，因此，不。因为除人、小鼠、果蝇等模式生物外，其他物种一般均是 Predicted mRNA，缺少必要的验证信息，因此需要。
2023-09-14 17:59:27
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原创 numba 报错 SystemError: initialization of _internal failed without raising an exception
numba 报错 SystemError: initialization of _internal failed without raising an exception
2023-04-28 01:36:09
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原创 scanpy 调用 sklearn 包报错：ImportError: dlopen: cannot load any more object with static TLS
scanpy 调用 sklearn 包报错：ImportError: dlopen: cannot load any more object with static TLS
2023-03-28 03:14:31
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原创 ”conda，pip，git clone和源码安装“四种方式安装 python 包—示例
”conda，pip，git clone和源码安装“四种方式安装 python 包—示例
2023-03-25 02:03:19
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原创 ”conda，pip，git clone和源码安装“四种方式安装 python 包
”conda，pip，git clone和源码安装“四种方式安装 python 包
2023-03-25 00:56:37
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原创 pip install annoy 报错 error: command ‘gcc‘ failed with exit status 1
pip install annoy 报错 error: command 'gcc' failed with exit status 1
2023-03-24 02:46:16
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原创 安装MACS2报错install_requires must be a string和etuptools.installer and fetch_build_eggs are deprecated
安装 MACS2 报错“install_requires must be a string or list of strings containing valid project/version requirement specifiers" 和“setuptools.installer and fetch_build_eggs are deprecated”
2023-03-23 19:43:43
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原创 SummarizedExperiment 对象访问、操作和转换
用 ArchR 对 scATAC 数据分析，通过getMarkerFeatures() 命令会得到一个对每个 peaks 分析后的统计信息，以该数据为例阐述 SummarizedExperiment 对象访问、操作和转换
2022-11-16 16:29:58
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原创 Linux中运行某个python程序报错 Permission denied
Linux中运行某个python程序报错 Permission denied
2022-10-26 11:02:53
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原创 ArchR 报错“Error in H5Fopen(file) : HDF5. File accessibility. Unable to open file.\n“
ArchR 报错"Error in H5Fopen(file) : HDF5. File accessibility. Unable to open file.\n"
2022-09-05 16:55:06
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原创 HISAT2 - StringTie - DESeq2 pipeline 进行bulk RNA-seq
HISAT2 - StringTie - DESeq2 pipeline 进行bulk RNA-seq
2022-06-30 21:57:53
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原创 报错“Computation failed in `stat_summary_hex()`”
报错“Computation failed in `stat_summary_hex()`”
2022-06-20 22:21:29
943
原创 解决Xshell下不能绘图问题：unable to open connection to X11 display
解决Xshell下不能绘图问题：unable to open connection to X11 display
2022-06-16 17:49:58
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原创 运行 ArchR 报错“createArrowFiles has encountered an error, checking if any ArrowFiles completed..”
运行 ArchR 报错“createArrowFiles has encountered an error, checking if any ArrowFiles completed..”
2022-06-14 11:00:27
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原创 R 安装/更新 package 报错：failed to lock directory ‘/home/anaconda3/envs/R4.1.2/lib/R/library’
R 安装/更新 package 报错：failed to lock directory ‘/home/anaconda3/envs/R4.1.2/lib/R/library’
2022-06-07 14:57:32
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原创 cellranger atac 操作笔记-3：count 输出文件解读 （2-2）
cellranger atac 操作笔记-3：count 输出文件解读 （2-2）
2022-06-03 13:16:19
1607
原创 cellranger atac 操作笔记-3：count 输出文件解读 （2-1）
cellranger atac 操作笔记-3：count 输出文件解读 （2-1）
2022-06-02 14:12:57
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原创 cellranger-atac 操作笔记-1：安装并构建绵羊单细胞ATAC参考基因组
cellranger-atac 操作笔记-1：安装并构建绵羊单细胞ATAC参考基因组
2022-05-31 08:58:35
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