R语言之grep函数和正则通配符查询（转载，稍微改动了些数据，用于学习）

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#R语言 #Bioconductor #生物信息学

本文分享了R语言中使用grep函数结合正则表达式的技巧，包括如何匹配字符串的开始和结束，以及任意字符的搜索，通过实例演示了如何筛选以特定数字开头或结尾的元素。

在R语言的道路上又学到了一个新知识，记下来一起分享！

首先，grep函数可以像数据库查询一样对向量中的具有特定条件的元素进行查询！

其次，介绍几种R语言中的正则通配符：

（1）“^”匹配一个字符串的开始，比如grep("^a","",c("abcd","dcba"))，表示将开头为a的字符串。如果要将开头的一个字符串替换，简单地写成“^ab”就行。

Num <- c(3120,4256,3511,4631,4921,4305,5834,3102,3103,5320,3231,4300,3293,3164,3244,3107,3231)
ipn<-grep("^3",Num,value=T)##开头为3的数字##
ipn
 [1] "3120" "3511" "3102" "3103" "3231" "3293" "3164" "3244" "3107" "3231"

  （2）“$”匹配一个字符串的结尾，比如grep("a￥","",c("abcd","dcba"))，表示将以a结尾的字符串。如果要将开头的一个字符串替换，简单地写成“^ab”就行。

ipn<-grep("4$",Num,value=T)##以4结尾的的数字#
ipn
[1] "5834" "3164" "3244"

 （3）"."表示除了换行符以外的任一字符，比如grep("a.c","",c("abcd","sdacd"))。

ipn<-grep("3.0",Num,value=T)#include all numbers which includes "3?0"
ipn

 

[1] "3102" "3103" "5320" "4300" "3107"

（暂时先整理到这里，后续再进行补充。。。。。。）

R语言函数-grep
TechWhizKid的博客
08-19 1708
在本文中，我们介绍了R语言中grep函数的用法，以及如何通过修改代码来实现类似的功能。无论是使用正则表达式还是其他类型的匹配，grep函数都是一个强大而灵活的工具，能够帮助我们在字符向量中进行模式匹配和搜索。这将返回一个新的字符向量matching_countries，其中包含所有包含字母"i"的国家名称。在R语言中，grep函数是一个非常有用的字符串处理函数，它用于在字符向量中搜索匹配特定模式的元素。这将返回以字母"C"开头的国家名称，即matching_countries的值是c(“China”)。
R语言中的grep函数：匹配模式并返回索引或值向量
ByteWhisper的博客
08-28 1109
通过提供匹配模式和要匹配的字符向量，我们可以使用grep函数返回匹配到的字符串的索引或值向量。在R语言中，grep函数是一个强大的字符串匹配函数，它可以用于查找匹配特定模式的字符串，并返回相应的索引或值向量。在上面的示例中，我们使用grep函数结合正则表达式查找以字母"a"开头或以字母"e"结尾的字符串，并返回相应的索引向量。在上面的示例中，我们使用grep函数查找以字母"a"开头的字符串，并通过设置参数value为TRUE来返回相应的值向量。grep函数返回一个整数向量，包含匹配到的字符串的索引或值。
R语言通配符大全
Memory1011的博客
03-08 1245
转自：http://www.pinlue.com/article/2020/03/2322/3710049290502.html
R语言中的grep函数
longnian01的博客
08-09 1228
​ grep是“Global Regular Expression Print”的简称。它来源于Unix操作系统的一个经典命令，用于搜索文本文件中与指定正则表达式匹配的行。这个命令的意思是“全局搜索（global search），使用正则表达式（regular expression），并打印（print）匹配的行”。 ​ 在R语言中，grep函数是一种强大的文本处理工具，用于在字符向量中搜索匹配特定模式的字符串，并返回这些字符串的位置索引或实际的字符串。
22、数据备份与正则表达式实用指南
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plum99的博客
11-22 16
本文介绍了Linux系统中数据备份与正则表达式的实用技术。通过rsync工具实现本地及远程数据备份，并结合别名和cron任务实现自动化。深入讲解了正则表达式的基础语法，包括元字符、锚点、括号表达式、字符类等，并通过grep命令演示实际应用。还展示了正则表达式在crossword谜题求解、数据提取及Python编程中的使用方法，帮助读者提升文本处理与系统管理能力。
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二、字节码与类的加载篇 ​ (18-21章) 1、Class文件结构 [外链图片转存失败,源站可能有防盗链机制,建议将图片保存下来直接上传(img-SBGP4iXi-1636367653208)(D:\学习\吃饭的家伙\java\images\JVM中篇图示\中篇_第1章：JVM架构-简图.jpg)] [外链图片转存失败,源站可能有防盗链机制,建议将图片保存下来直接上传(img-uRyjyCxW-1636367653215)(D:\学习\吃饭的家伙\java\images\JVM中篇图示\中篇_第1章：JV
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三、Linux 文本编辑命令 1、 wc命令 命令格式： ls [选项][目录名] 常用参数： 常用范例 2、 grep命令 命令格式： ls [选项][目录名] 常用参数： 常用范例 3、 正则表达式命令 命令格式： ls [选项][目录名] 常用参数： 常用范例 4、 cut命令 命令格式： ls [选项][目录名] 常用参数： 常用范例 5、 paste命令 命令格式： ls [选...
软件测试面试有那么难吗？这些面试题你能回答出几个
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这知识点都是我在工作，还有面试中学习并总结的，差不多都是一些高频面试题，比较深入的知识点，如果在这平时不去总结，不去刷刷面试题的话，可能在你面试的时候就会被面试官怼的一塌糊涂，就算在面试官问出这个问题的时候你知道怎么回事，就是因为没有去总结，就会出现逻辑混乱的情况，从而失去这份工作机会。
root@NVR:/tmp# tftp -gr test_new_old_database.sh 192.168.0.1 root@NVR:/tmp# ./test_new_old_database.sh 🚀 开始数据库性能测试 📅 Wed Nov 5 09:35:24 UTC 2025 🔍 正在测试: 旧表查询 📌 SQL: SELECT COUNT(*) FROM tZoneInfo; 🔁 执行 5 次... COUNT(*) = 464 sync wal file to db begin! 5b5ec808a70990da0e1ead705a431043 5b5ec808a70990da0e1ead705a431043 5b5ec808a70990da0e1ead705a431043 5b5ec808a70990da0e1ead705a431043 COUNT(*) = 464 sync wal file to db begin! 5b5ec808a70990da0e1ead705a431043 5b5ec808a70990da0e1ead705a431043 5b5ec808a70990da0e1ead705a431043 5b5ec808a70990da0e1ead705a431043 COUNT(*) = 464 sync wal file to db begin! 5b5ec808a70990da0e1ead705a431043 5b5ec808a70990da0e1ead705a431043 5b5ec808a70990da0e1ead705a431043 5b5ec808a70990da0e1ead705a431043 COUNT(*) = 464 sync wal file to db begin! 5b5ec808a70990da0e1ead705a431043 5b5ec808a70990da0e1ead705a431043 5b5ec808a70990da0e1ead705a431043 5b5ec808a70990da0e1ead705a431043 COUNT(*) = 464 sync wal file to db begin! 5b5ec808a70990da0e1ead705a431043 5b5ec808a70990da0e1ead705a431043 5b5ec808a70990da0e1ead705a431043 5b5ec808a70990da0e1ead705a431043 📊 旧表查询 测试结果: 平均响应时间: 0.0 ms 最小响应时间: 0.0 ms 最大响应时间: 0.0 ms 总耗时: 0.0 ms 成功次数: 0/5 失败率: 100% 我觉得是ms精度太差了，我的函数应该怎么改#!/bin/sh # ======================================== # 数据库性能测试脚本（纯 sh 兼容版） # 防止 run_query: not found + expr 错误 # ======================================== TRIES=5 VERBOSE=true # ---------------------------------------- # format_ms: 将 scaled_ms (毫秒×1000) 转为字符串 "x.xxx" # 示例: 1234 → "1.234", 1 → "0.001" # ---------------------------------------- format_ms() { micros=$1 case "$micros" in ''|*[!0-9]*) echo "0.000"; return ;; esac millis=$(expr $micros / 1000) # 整数毫秒 sub_ms=$(expr $micros % 1000) # 小数部分（0~999） case $sub_ms in [0-9]) frac="00$sub_ms" ;; [0-9][0-9]) frac="0$sub_ms" ;; *) frac="$sub_ms" ;; esac echo "$millis.${frac#??}" | sed 's/\.\([0-9]\{3\}\).*/.\1/' } # 替换原来的 get_timestamp_us 调用 get_timestamp_us() { local up=$(cat /proc/uptime 2>/dev/null | sed -e 's/[ \t].*//' -e 's/[^0-9.]//g') case "$up" in ''|*[!0-9.]*) echo "0"; return esac local sec frac [ "${up#*.}" != "$up" ] && { sec=${up%%.*}; frac=${up#*.}; } || { sec=$up; frac="0"; } sec=$(echo "$sec" | tr -cd '0-9'); [ -z "$sec" ] && sec=0 frac=$(echo "$frac" | tr -cd '0-9'); [ -z "$frac" ] && frac=0 frac="${frac}000000" frac=${frac:0:6} echo "${sec}${frac}" } # ---------------------------------------- # run_query: 执行 SQL 并返回耗时和成功状态 # 输出: "$elapsed_scaled $success" （两个整数） # ---------------------------------------- # 在每次查询后加个极短 sleep（仅用于测试） run_query() { sql_cmd="$1" # --- 记录开始时间 --- start_us=$(get_timestamp_us) case "$start_us" in ''|*[!0-9]*) start_us=0 ;; esac # --- 执行 ubus 命令，并捕获完整输出 --- raw_output=$(ubus call record stg_db_debug "{\"hd_id\":0, \"sql_cmd\":\"$sql_cmd\"}" 2>&1) # --- 记录结束时间 --- end_us=$(get_timestamp_us) case "$end_us" in ''|*[!0-9]*) end_us=0 ;; esac # --- 计算耗时 --- if [ $start_us -gt 0 ] && [ $end_us -gt 0 ] && [ $end_us -ge $start_us ]; then elapsed_micro=$(expr $end_us - $start_us) else # fallback：至少估算 1ms elapsed_micro=1000 fi # --- 判断是否成功 --- # 方法1：检查是否有 COUNT(*) 输出（在 raw_output 中） if echo "$raw_output" | grep -q 'COUNT(*)'; then success=1 else # 方法2：检查是否返回了有效 JSON 且无 error if echo "$raw_output" | grep -q '"result":0\|"message"' || echo "$raw_output" | grep -q '"rows"'; then success=1 else success=0 fi fi # --- 🔥 调试输出：打印每次查询详情 --- printf "DEBUG: Query='%s'\n" "$sql_cmd" printf " Raw Output: %s\n" "$raw_output" printf " Start=%s us, End=%s us → Elapsed=%d us (%.3f ms)\n" \ "$start_us" "$end_us" "$elapsed_micro" "$(echo "scale=3; $elapsed_micro / 1000" | bc 2>/dev/null || echo 0)" printf " Success=%d\n" "$success" echo "" # --- 返回结果 --- echo "$elapsed_micro $success" } # ---------------------------------------- # collect_stats: 收集 N 次查询统计信息 # ---------------------------------------- collect_stats() { label="$1" sql_cmd="$2" i=1 total_time_scaled=0 failed_count=0 min_time="" max_time=0 echo "🔍 正在测试: $label" echo "📌 SQL: $sql_cmd" echo "🔁 执行 $TRIES 次..." while [ $i -le $TRIES ]; do # ✅ 安全调用 run_query output=$(run_query "$sql_cmd") [ -z "$output" ] && output="0 0" set -- $output elapsed_scaled=$1 success=$2 # 防御非数字 case "$elapsed_scaled" in ''|*[!0-9]*) elapsed_scaled=0 ;; esac case "$success" in ''|*[!0-9]*) success=0 ;; esac total_time_scaled=$(expr $total_time_scaled + $elapsed_scaled) if [ "$success" -eq 0 ]; then failed_count=$(expr $failed_count + 1) fi # 更新最小最大值 if [ -z "$min_time" ] || [ $elapsed_scaled -lt $min_time ]; then min_time=$elapsed_scaled fi if [ $elapsed_scaled -gt $max_time ]; then max_time=$elapsed_scaled fi i=$(expr $i + 1) done success_count=$(expr $TRIES - $failed_count) if [ $success_count -gt 0 ]; then avg_scaled=$(expr $total_time_scaled / $success_count) else avg_scaled=0 fi fail_rate=$(expr 100 \* $failed_count / $TRIES) echo "" echo "📊 $label 测试结果:" printf " %-20s %s ms\n" "平均响应时间:" "$(format_ms $avg_scaled)" printf " %-20s %s ms\n" "最小响应时间:" "$(format_ms $min_time)" printf " %-20s %s ms\n" "最大响应时间:" "$(format_ms $max_time)" printf " %-20s %s ms\n" "总耗时:" "$(format_ms $total_time_scaled)" printf " %-20s %d/%d\n" "成功次数:" $success_count $TRIES printf " %-20s %d%%\n" "失败率:" $fail_rate echo "" } # ==================== 主程序 ==================== echo "🚀 开始数据库性能测试" echo "📅 $(date)" # 👇 确保函数已加载后再调用！ # 可选：调试函数是否存在 # type run_query || { echo "FATAL: run_query 未定义"; exit 1; } OLD_SQL='SELECT COUNT(*) FROM tZoneInfo;' collect_stats "旧表查询" "$OLD_SQL" echo "✅ 测试完成！"
11-06
因为 `*` 被当成了正则表达式通配符！ ### ❌ 错误写法： ```sh grep 'COUNT(*)' ``` ### ✅ 正确写法（使用字面量匹配）： ```sh grep 'COUNT(*) =' # 匹配完整模式 # 或者 echo "$raw_output" | tr -d ' ' | ...
rgrep命令 查找文件里符合条件的字符串
01-09
rgrep命令的功能和grep命令类似，可查找内容包含指定的范本样式的文件，如果发现某文件的内容符合所指定的范本样式，预设rgrep命令会把含有范本样式的那一列显示出来。 语法格式：rgrep [参数] 常用参数： -? 显示范本样式与范例的说明 -B 忽略二进制的数据 -c 计算符合范本样式的列数 -D 排错模式，只列出命令搜寻的目录清单，而不会读取文件内容 -F 只读取该连接所指向的原始文件的内容 -h 特别将符合范本样式的字符串标示出来 -H 只列出符合范本样式的字符串，而非显示整列的内容 -i 忽略字符大小写的差别 -
R语言之grep函数和正则通配符查询
weixin_45098535的博客
11-27 2205
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R语言grep函数用法
weixin_44612629的博客
01-08 3万+
其语法格式如下： grep(pattern, x, ignore.case = FALSE, perl = FALSE, value = FALSE, fixed = FALSE, useBytes = FALSE, invert = FALSE) 各参数的含义如下： （1）pattern: 字符串类型，正则表达式，指定搜索模式，当将fixed参数设置为TRUE时，也可以是一个待搜索的字符串。 （...
R语言之grep函数和正则通配符查询 [
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