Orange3实战教程：生物信息---基因集富集分析

基因集富集分析

对基因集进行富集分析。

输入

• 数据（Data）: 数据集。
• 自定义基因集（Custom Gene Sets）: 待比较的基因集。
• 参考基因集（Reference Genes）: 用作参考的基因集。

输出

• 匹配基因（Matched Genes）: 匹配成功的基因。

基因集富集分析（Gene Set Enrichment Analysis, GSEA） 是一种用于发现大型基因群中过度表达的基因集的方法，这些基因集可能与不同表型相关。该工具针对给定的每个基因集，使用 超几何检验（hypergeometric test） 计算富集程度。该检验通过基因组总基因数和基因集大小，评估观察到的基因集与输入基因重叠的概率是否具有统计学显著性。