单样本评分(Single Sample Scoring)
通过单样本对基因集进行评分。
输入
- 数据(Data):输入数据集。
- 自定义基因集(Custom Gene Sets):用于评分的基因集。
输出
- 数据(Data):包含所选基因集对应富集分数的数据集。
单样本基因集富集分析(ssGSEA) 是基因集富集分析(GSEA)的单样本扩展方法,广泛应用于根据单个样本基因过表达情况对基因集进行评分。其原理是通过对有序表达矩阵中基因的排名贡献求和,高表达值会正向影响评分结果。
(参考:Nature论文)