SMC++ Resource temporarily unavailable

最新推荐文章于 2025-11-24 16:53:27 发布
原创 最新推荐文章于 2025-11-24 16:53:27 发布 · 733 阅读 · 0 ·
CC 4.0 BY-SA版权
版权声明：本文为博主原创文章，遵循 CC 4.0 BY-SA 版权协议，转载请附上原文出处链接和本声明。

本文详细介绍了在运行runsmc++过程中遇到的OpenBLAS多线程初始化错误，即资源暂时不可用的问题。通过设置OPENBLAS_NUM_THREADS环境变量为1，或使用Python代码限制线程数，可以有效解决此问题。同时，文章还提供了关于Linux系统中线程栈空间及资源限制的深入理解。

在run smc++的时候，遇到问题，

OpenBLAS blas_thread_init: pthread_create failed for thread 16 of 48: Resource temporarily unavailable

OpenBLAS blas_thread_init: RLIMIT_NPROC 1024 current, 4134580 max

 

export OPENBLAS_NUM_THREADS=1

or 

import os

os.environ['OPENBLAS_NUM_THREADS'] ='1'

 

在网上搜的时候，发现了其他的知识：

linux 每一个线程都有独立的栈空间，unlimit -a 可以知道具体的数据。

 

https://blog.youkuaiyun.com/u012110870/article/details/106115577

https://blog.youkuaiyun.com/lifuxianoa/article/details/6796813

https://stackoverflow.com/questions/52026652/openblas-blas-thread-init-pthread-create-resource-temporarily-unavailable

dospca
关注
深入解析Redis中“Resource Temporarily Unavailable“问题的解决方案
笔者从事电信媒体开发多年，愿意将多年的开发经验分享给同行
05-09 3173
Redis是一个高性能的内存数据库，广泛用于缓存、消息队列、排行榜等场景。然而，在实际应用中，开发者可能会遇到"Resource temporarily unavailable"错误，这通常表明系统资源暂时不可用，导致Redis无法执行请求的操作。本文将深入探讨这一问题，并提供一系列详尽的解决策略。
Linux: errno: 11 EAGAIN +Resource temporarily unavailable； EWOULDBLOCK
mzhan017的博客
01-06 3232
Max processes 30775 30775 processes 、、、、 这里。man clone查看帮助手册，EAGAIN会转到看man fork。EAGAIN错误预示着线程的个数超出了限制。
报错 OpenBLAS blas_thread_init: RLIMIT_NPROC 4096 current, -1 max
weixin_42831564的博客
05-23 2431
Python创建大量线程时遇上OpenBLAS blas_thread_init报错怎么办？
Docker【部署 06】Swarm实践及Operation not permitted和No chain/target/match by that name问题处理
Java与大数据相关实践内容分享！
10-18 1715
Swarm实践及Operation not permitted和No chain/target/match by that name问题处理
运行docker镜像时OpenBLAS blas_thread_init的报错解决
最新发布
weixin_37522117的博客
11-24 196
运行docker镜像时OpenBLAS blas_thread_init的报错解决
「生信Debug」OpenBLAS blas_thread_init: pthread_create: Resource temporarily unavailable
xuzhougeng blog
05-14 4586
BLAS（Basic Linear Algebra Subprograms），翻译为基础线性代数子程序库，里面拥有大量已经编写好的关于线性代数运算的程序。OpenBLAS是其中一个实现了相关运算的开源程序库，其他软件在开发的时候就不需要额外造轮子，直接调用相关的API即可。 之前在使用OrthoFinder遇到了类似的问题，见https://github.com/davidemms/OrthoFi...
-bash:fork:Resourse Temporarily Unavailable
cq8625763的博客
03-04 297
27 Linux错误解决 -bash:fork:Resourse Temporarily Unavailable 首先解释一下为什么会出现该错误： 错误出现在10.52.150.18这台Linux服务器上，原因出在ET的...
-bash: fork: Resource temporarily unavailable
简单即美
09-19 230
如题，ssh连接时报这么个错，但应用可以连接，google了下才用 exec reboot重启了。关注中。。。 问题发现：大量的连接造成系统资源耗尽。 不必着急重启机器，可先通过应用服务器停止了服务，然后再考虑修复问题。...
ping: connect: Resource temporarily unavailable
云淡风轻
01-31 1677
strace看下 ping的报错信息，看到ping还要打开1025端口，看看是不是有程序把它占用了。主机ping自己或者其他的设备报错如下，看了下网络上的其他说法，大多说是下面的两个限制。调整连接队列和最大文件描述符数，问题仍未解决。杀掉占用端口的进程，ping正常了。2.系统级别的最大文件描述符数量。1.网络连接队列的大小。结果是端口真的被占用了。
UDP send 出现大量“Resource temporarily unavailable”
striver1205的专栏
03-28 2421
至此，我们已经分析开头所说困惑，一个小小的“Resource temporarily unavailable”错误，背后蕴藏着太多技术细节，如果得过且过将来必成后患。工作中遇到的每个小问题，背后都蕴藏着大量知识，只有平时多积累总结，才能游刃有余解决所面对的问题。
nginx connect() to unix:/var/run/php-fpm.sock failed (11: Resource temporarily unavailable)
09-30
标题中的“nginx connect() to unix:/var/run/php-fpm.sock failed (11: Resource temporarily unavailable)”是一个常见的错误信息，这通常发生在Nginx尝试与PHP-FPM（FastCGI进程管理器）通信时，但遇到了资源暂时...
普通用户切换报错：资源暂时不可用(Resource temporarily unavailable)
zhang525jia的专栏
07-22 1132
普通用户切换报错：资源暂时不可用(Resource temporarily unavailable)，配置Linux普通用户的打开文件数
关于Linux主机报错(Resource temporarily unavailable)的解决办法
热门推荐
Steven的博客
05-14 2万+
现象描述:主机登陆或者切换用户时报错资源暂时不可用(Resource temporarily unavailable)。[root@zyserver ~]# su - oracle-bash: fork: retry: Resource temporarily unavailable-bash: fork: retry: Resource temporarily unavailable-bash:...
【亲测免费】 SMC++ 项目安装与使用指南
gitblog_00035的博客
09-24 1399
SMC++ 项目安装与使用指南 1. 项目介绍 SMC++（Sequential Markov Coalescent++）是一个用于从全基因组序列数据推断种群历史大小的程序。它通过分析基因组数据中的突变模式，来估计种群在过去不同时间点的大小变化。SMC++ 是一个强大的工具，适用于生物信息学、遗传学和种群遗传学领域的研究人员。 2. 项目快速启动 安装 SMC++ SMC++ 可以通过 Docke...
SMC++进行有效种群分析
weixin_45694863的博客
09-12 1万+
SMC++进行有效种群分析
SMC++ 项目安装与使用教程
gitblog_00467的博客
09-25 1196
SMC++ 项目安装与使用教程 1. 项目目录结构及介绍 SMC++ 是一个用于从全基因组序列数据推断群体历史大小的程序。以下是项目的目录结构及其介绍： smcpp/ ├── assets/ ├── condaconda/ ├── example/ ├── include/ ├── scripts/ ├── smcpp/ ├── src/ ├── test/ ├── util/ ├── docke...
smc++安装
weixin_45694863的博客
10-16 2794
官网：https://github.com/popgenmethods/smcpp 官网最新版都用docker下了，1.15.4以后不再支持conda 下载，这就很烦，我用docker下一直有问题，所以还是下旧版的吧。 #直接conda建环境下载，基本不需要你再下各种的库呀依赖啥的 conda update conda conda create -n smcpp -c conda-forge -c terhorst smcpp conda activate smcpp smc++ 这个时候就可能报错说找不
[数据结构 学习]SM算法c++实现
dienubao5883的博客
09-14 621
int result[2];int* SM(int* A, int n) {int max, min; max = min = A[0]; for (int i = 1; i < n; i++) {if (A[i] > max) {max = A[i];}if (A[i] < min) {min = A[i];}}//遍历并比较...
SMC++ 项目推荐
gitblog_00781的博客
12-24 398
SMC++ 项目推荐 1. 项目基础介绍和主要编程语言 SMC++ 是一个用于从全基因组序列数据推断群体历史大小的开源项目。该项目的主要编程语言是 Python 和 C++。Python 用于实现核心算法和用户交互接口，而 C++ 则用于优化性能，特别是在处理大规模数据时。 2. 项目的核心功能 SMC++ 的核心功能包括： 群体历史推断：通过分析全基因组序列数据，SMC++ 能够推断出群体的历...
resource temporarily unavailable
05-21
### 关于 'Resource Temporarily Unavailable' 错误的原因 'Resource temporarily unavailable' 是一种常见的系统级错误，通常表示操作系统中的某些资源已经耗尽或者暂时不可用。这种错误可能由多种原因引起，具体...
评论
成就一亿技术人!
拼手气红包6.0元
还能输入1000个字符
 
红包 添加红包
表情包 插入表情
表情包 代码片
 条评论被折叠 查看
添加红包

请填写红包祝福语或标题

个

红包个数最小为10个

元

红包金额最低5元

当前余额3.43元 前往充值 >
需支付：10.00元
成就一亿技术人!
领取后你会自动成为博主和红包主的粉丝 规则
hope_wisdom
发出的红包
实付元
使用余额支付
点击重新获取
扫码支付
钱包余额 0

抵扣说明：

1.余额是钱包充值的虚拟货币，按照1:1的比例进行支付金额的抵扣。
2.余额无法直接购买下载，可以购买VIP、付费专栏及课程。

余额充值