蛋白质翻译后修饰棕榈酰化位点预测工具 —— CSS-Palm 2.0

最新推荐文章于 2025-07-08 09:00:18 发布

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CSS-Palm 2.0是一款更新后的工具，专门用于预测蛋白质翻译后修饰中的棕榈酰化位点。这种可逆的S-棕榈酰化作用影响蛋白质的膜亲和性、转运、稳定性和排序。更新后的版本通过改进的CSS算法提高了预测性能，并进行了交叉验证以确保系统稳定性。CSS-Palm 2.0在未包含在训练数据集中的额外数据集上也表现出优越的性能，对于大约1000aa长度的蛋白质，能在5分钟内预测潜在的棕榈酰化位点。

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　CSS-Palm 2.0: an updated software for palmitoylation sites prediction
　 Jian Ren , Longping Wen, Xinjiao Gao, Changjiang Jin, Yu Xue and Xuebiao Yao.
　Protein Engineering, Design and Selection.2008 21(11):639-644

　 [Abstract] [Full Text] [PDF]

As a special class of post-translational modifications (PTMs), numerous proteins could be covalently modified by a variety of lipids, including myristate (C14), palmitate (C16), farnesyl (C15), geranylgeranyl (C20) and glycosylphosphatidylinositol (GPI), etc (Casey, 1995 ; Nadolski and Linder, 2007 ;