蛋白质翻译后修饰SUMO化位点预测工具 —— SUMOsp 2.0

最新推荐文章于 2025-02-23 19:24:46 发布

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SUMOsp 2.0是一款更新后的蛋白质SUMO化位点预测工具，基于手动收集的训练数据集进行优化。该工具采用GPS算法的更新版本，通过多种交叉验证展示出更高的特异性，同时保持了良好的敏感性。相较于SUMOplot和SUMOsp 1.0，SUMOsp 2.0在预测性能上有所提升，特别适用于大量蛋白质的快速预测，可以在约十分钟内处理1000个平均长度为1000氨基酸的蛋白质。

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Systematic study of protein sumoylation: Development of a site-specific predictor of SUMOsp 2.0 .
Jian Ren , Xinjiao Gao, Changjiang Jin, Mei Zhu, Xiwei Wang, Andrew Shaw, Longping Wen, Xuebiao Yao and Yu Xue .
Proteomics.2009; 9:3409-3412 [Abstract] [Full Text]

The past decade has witnessed the rapid progresses on functional dissections of protein sumoylation (Geiss-Friedlander and Melchior, 2007 ). The SUMO (small ubiquit