加权直系同源和旁系同源关系的校正
1. 图校正最大化变体的多项式时间近似方案
在图校正问题中,我们考虑互补的最大化问题,即最大化原始图和校正图之间的保守性。尽管最小化和最大化变体目标相同,但从近似角度来看,它们并不等价。
对于无权图,我们给出对应于 MinWES 的最大化版本的正式表述——最大可满足性编辑(MaxES):
- 输入 :关系图 $R = (V_R, E_R)$;
- 输出 :通过边编辑从 $R$ 得到的可满足关系图 $R’ = (V_R, E_{R’})$,使得其值 $|E_R \cap E_{R’}| + |(\overline{E_R} \cap \overline{E_{R’}})|$ 最大。
给定关系图 $R$,MaxES 在实例 $R$ 上的解 $R’$ 的值称为 $R’$ 的一致性值。
引理 6 :给定关系图 $R$,MaxES 在实例 $R$ 上的最优解的一致性值至少为 $\frac{n^2}{8}$。
- 证明概要 :考虑两种“极端”解,要么使来自两个不同物种的所有基因成为直系同源物,要么使所有基因成为旁系同源物。在 $R$ 中,至少一半的基因是直系同源物或者至少一半的基因是旁系同源物。因此,一种极端解至少保留了总关系数的一半,即 $\frac{\binom{n}{2}}{2} > \frac{n^2}{8}$。详细证明见附录。
引理 6 几乎直接给出了一个 $\frac{1}{2}$ 近似(即保留至少与最优解一半数量的关系)
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