在三月月份 DahShu 和硅谷生信社群免费线上讲座中,将聚焦生物信息基因测序领域, 邀请了来自硅谷的明星创业公司 – 基因测序数据软件 Sentieon 高级数据科学家胡晋南博士 (Dr. Frank Hu) 同我们分享 Sentieon 如何利用机器学习算法、软件和系统优化,使公司在创业初期就跻身成为业界第一快速、准确的商业机密。
讲座嘉宾:
Dr Frank Hu,胡晋南博士,Sentieon Senior Bioinformatics Scientist
胡博士目前担任 Sentieon 的高级生物信息学科学家,负责产品周期管理并推动 Sentieon 在亚洲市场(尤其是中国)的业务成功。胡博士于2008年获得南京大学的学士学位,2013年获得俄亥俄州立大学的基因组学博士学位,并在 Joint Genome Institute, Lawrence Berkeley National Laboratory 从事计算生物学的博后工作。 胡博士在 NGS 数据分析方面拥有丰富的经验,以第一作者身份在同行评审期刊上发表了多篇论文。 本期 DahShu 讲座,胡博士将同我们分享 Sentieon 是如何利用机器学习迅速成为 NGS 测序数据软件的世界冠军。
讲座时间
北京时间3月10日,周三上午9:00
报名链接
点击链接报名:https://mp.weixin.qq.com/s/fKwNyt2aGKBX2OJGDtbzRg
点击链接申请Sentieon软件:https://www.insvast.com/sentieon
作为一名生信领域的研究人员,小编在进行二代测序数据分析时(如SNP/ Indel 突变检测),最常用的就是用 Broad Institue 开发的 BWA+GATK 流程对原始测序数据进行处理。而经过十多年大量样本的反复验证,BWA+GATK 也得到了学术界和业界的广泛认可,是公认的测序数据原始处理的金标准。
但是,BWA + GATK 流程也有几个显著的问题:

本次在线讲座由Sentieon的高级数据科学家胡晋南博士分享,探讨如何利用机器学习优化基因测序数据处理,Sentieon通过改进数学模型、算法和程序,提供比BWA+GATK更快、更低成本的解决方案。Sentieon的软件DNAscope和TNscope在多个国际生信大赛中获奖,展现出在多组学分析和机器学习应用上的卓越性能。
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