发育系统生物学之Nature Methods上的一篇论文

最新推荐文章于 2024-12-17 11:06:52 发布
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一篇发表在Nature Methods上的研究论文通过分析基因配对表达特征，揭示了细胞谱系调控机制及其在发育生物学中的作用。这项工作有助于理解生物发育过程中基因调控网络的复杂性。

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拟时序分析神包—monocle的三篇《Nature》
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特别的是，一些因子的结合基序在启动子和增强子中高度富集，其基序与已知的肌肉调节基序一致（Figure4b）。大多数单细胞分析的研究旨在找出发育过程中的关键调节因子，Monocle算法进行的拟时序分析，可以用来展示分化过程中的基因表达水平，所以作者选择了最近一篇研究中的RNA-seq数据进行重新分析，轨迹开始的地方是具有高增殖活性（Ccnb2,Cdk1）的细胞，分化过程中逐渐转向AT1（Pdpn）和AT2（Sftpb）两个进化分支，AT1和AT2分别是I型和II型肺上皮细胞（Figure3a）。
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