最新版BLAST+的本地化-BLAST2.2.28+单机运行（第六次修改）

最新推荐文章于 2025-05-26 17:05:44 发布
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本文详细介绍了如何在本地进行最新版BLAST+的安装与配置，专注于单机环境下的操作流程与优化建议。
bigdata
关注
本地Blast软件2.2.25
02-21
本地blast软件，可以不用联网将待比对的序列与本地数据库中的序列进行比对，可以比对核酸和蛋白等序列。
精选资源
ncbi-blast-2.12.0+-x64-linux .tar.gz
11-18
NCBI BLAST 2.12.0是该软件的最新版本，特别针对64位Linux系统进行了优化。 BLAST的核心功能包括快速的序列比对算法，能够在海量序列数据库中搜索相似片段。这一版本的BLAST提供了多个子程序，如blastn（用于DNA-...
Blast+
海骆驼的沙漠
12-20 2656
总是记不住blast的参数设置，现在把参数及用法放在此处，方便以后查阅~ Nucleotide-NucleotideBLAST 2.2.28+ usage   blastn [-h] [-help] [-import_search_strategyfilename]     [-export_search_strategy filename] [-taskt
LINUX下BLAST+的本地化(最新版blast) (Version 2.0)
bigdataage的专栏
12-08 4280
在以下环境亲测有效：CentOS Linux 64 Bit.  下面涉及到的路径需要根据自己的电脑来修改。 LINUX下BLAST+的本地化(ncbi-BLAST 2.2.27+): 1  下载程序:    在ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/executables/blast+/LATEST/下载    ncbi-blas
ubuntu(18.04) 安装 blast 并在php中调用
喂、你别跑啊~
10-30 634
ubuntu(18.04) 安装 blast
【实用教程】本地blast使用及简单python脚本辅助
Eumenidus的博客
03-24 8568
如何简单快速使用本地化blast进行检索
r语言remarkdown展示图_使用R语言包circlize可视化展示blast双序列比对结果
weixin_29553791的博客
12-08 987
circlize这个包还挺强大的，R语言里用来画圈图还挺方便的。 今天这篇文章记录用circlize这个包画圈图展示blast双序列比对结果的代码植物线粒体基因组类的文章通常会分析细胞器基因组间基因转移情况，基本的分析方法就是blast比对。可视化展示可以选择用这个圈图来做首先是使用blast建库比对makeblastdb -in mt.fasta -dbtype nucl -out mt bla...
精选资源
ncbi-blast-2.6.0+-x64-linux.tar.gz
04-21
1. 下载：首先，你需要从NCBI官方网站下载ncbi-blast-2.6.0+-x64-linux.tar.gz压缩包，并将其解压到你的Linux系统的适当目录。 2. 解压：使用`tar -zxvf ncbi-blast-2.6.0+.tar.gz`命令进行解压。 3. 移动与软链接：...
ncbi-blast-2.10.1+-x64-win64 .tar.gz
09-21
NCBI blast 2.10.1 windows版The NCBI provides a suite of command-line tools to run BLAST called BLAST+. This allows users to perform BLAST searches on their own server without size, volume and database...
ncbi-blast-2.13.0+-x64-win64.tar
07-16
NCBI BLAST+，作为其最新版本2.13.0+，为科研工作者提供了一套强大的序列比对和搜索功能，帮助解析生命现象背后的遗传信息。 BLAST+系统由一系列可执行程序组成，包括blastn、blastp、blastx、tblastn和tblastx，...
blast-2.2.26-x64-linux.tar.gz
02-02
64位，linux的
NCBI BLAST工具本地化
MySwingsnow的博客
08-16 2231
本文主要介绍NCBI BLAST如何在Linux（Ubuntu）环境下实现本地化
NCBI数据库本地化
最新发布
fanyucai1
05-26 385
Step3:查看可下载的数据库。Step1:下载blast+step4:下载对应的数据库。Step2:安装依赖。
KeyarchOS系统下本地blast+安装与使用教程
KeyarchOS的博客
01-23 1675
浪潮信息KOS是浪潮信息基于Linux Kernel、OpenAnolis等开源技术自主研发的一款服务器操作系统，支持x86、ARM等主流架构处理器，性能和稳定性居于行业领先地位，具备成熟的 CentOS 迁移和替换能力，可满足云计算、大数据、分布式存储、人工智能、边缘计算等应用场景需求。详细介绍见官网链接浪潮信息云峦服务器操作系统KeyarchOS-浪潮信息。BLAST（Basic Local Alignment Search Tool）是一套在蛋白质数据库或DNA数据库中进行相似性比较的分析工具。
串行的blast+2.2.25本地化: blastdbcmd,makeblastdb,blastn.简介
旅程
05-19 8527
串行的blast+2.2.25本地化系列: blastdbcmd,makeblastdb,blastn.使用简介----------------------------------------------------------------------- blast+中有许多命令.blastdbcmd,makeblastdb是处理数据库较为常用的命令blastn是核苷酸与核苷酸比对的命令.------------------------------------------------------------
生信入门：序列比对之blast在线和本地使用
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主要内容 1 背景 2 在线blast 3 本地blast 3.1 老版本blast 3.2 新版本blast 背景 序列比对（Sequence Alignment）的基本问题是比较两个或两个以上序列的相似性。 blast作为一种序列相似性比对工具，是生物信息分析最常用的一款软件，必须掌握。不管是做两序列相似性的简单比对，还是引物特异性、序列的来源等个性化分析，都会用到blast比对。许...
linux运行blast,Linux下BLAST+的本地化（BLAST 2.2.29+）
weixin_34218582的博客
04-30 1007
Linux下BLAST+的本地化(NCBI-BLAST 2.2.29+):1. 下载软件BLAST:下载: ncbi-blast-2.2.29+-x64-linux.tar.gz (根据自己的操作系统选择)。2. 解压:解压后放在任意目录下都可以，把相应路径加入PATH变量就是。比如解压到用户的主目录(/home/yonpen)下，把解压后的文件夹重新命名为blast，则BLAST+的所有...
Linux下BLAST的使用 【转载】
biolxy的博客
12-15 1万+
1、把BLAST的压缩文件解压，然后将bin目录下的文件拷贝至/usr/local/bin下； 2、制作软链接，将解压后的文件中bin目录链接至/home/username下，eg：ln -s /home/username/blast/bin； 3、在当前用户目录下，编辑bashrc文件，在文件中加入export PATH=/home/username/bin/=$PATH; 4、在当前目录
blast2go本地数据库安装和使用
mengjiaoduan的博客
07-28 5050
http://www.chenlianfu.com/?tag=blast2go
wget https://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/executables/blast+/LATEST/ncbi-blast-2.15.0+-x64-linux.tar.gz显示连接超时
11-10
当你尝试使用`wget`命令从NCBI服务器下载文件时，如果遇到连接超时的情况，通常是因为网络连接不稳定、服务器暂时不可达或者是请求速率超过了服务器限制。这种错误信息可能看起来像下面这样： ``` --2023-07-09 08:00:00-- https://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/executables/blast+/LATEST/ncbi-blast-2.15.0+-x64-linux.tar.gz Resolving ftp.ncbi.nlm.nih.gov (ftp.ncbi.nlm.nih.gov)... x.y.z.w Connecting to ftp.ncbi.nlm.nih.gov (ftp.ncbi.nlm.nih.gov)|x.y.z.w|:443... connected. HTTP request sent, awaiting response... Read error (Connection timed out) in headers. Retrying. --2023-07-09 08:00:05-- https://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/executables/blast+/LATEST/ncbi-blast-2.15.0+-x64-linux.tar.gz Resolving ftp.ncbi.nlm.nih.gov (ftp.ncbi.nlm.nih.gov)... x.y.z.w Connecting to ftp.ncbi.nlm.nih.gov (ftp.ncbi.nlm.nih.gov)|x.y.z.w|:443... connected. HTTP request sent, awaiting response... Read error (Connection timed out) in headers. Retrying... [...] ``` 解决办法可以有： 1. 检查网络连接是否稳定，尝试重启路由器或切换到其他网络源。 2. 如果是代理设置问题，检查代理服务器的状态和配置。 3. 考虑使用`--tries`选项增加重试次数，如 `wget --tries=5 ...`。
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