SambVca在线工具研究配体的空间性质

原创 已于 2023-07-04 13:52:15 修改 · 884 阅读 · 0 ·
CC 4.0 BY-SA版权
版权声明：本文为博主原创文章，遵循 CC 4.0 BY-SA 版权协议，转载请附上原文出处链接和本声明。
文章标签：

#redis #数据库 #缓存

于 2023-06-28 14:59:14 首次发布
SambVca是一个在线工具，用于分析配体的percentage buried volume和立体位阻分布，尤其适用于研究化学反应中的配体性能。用户可上传结构文件，通过设定相关参数获取配体的空间信息，帮助理解反应效率和选择性。

背景知识：

配体的空间位阻信息是影响配体性能的重要因素。用于表征配体体积最常用的参数有二，其一为圆锥角（cone angle），适合表征膦配体等近似为圆锥形的配体；而对于更广泛的配体，更适合通过percentage buried volume来表征。其定义为，在一个以金属原子为中心，半径3.5 A的球体内，配体的范德华半径所占据的体积占球体总体积的百分数。这一参数已成为最重要的表征配体大小的数据之一。

对方法学研究，希望研究配体体积与反应效率和选择性关系者，非常适合利用SambVca来得到配体立体信息。

Ref. Eur. J. Inorg. Chem., 2009: 1759-1766. https://chemistry-europe.onlinelibrary.wile

最低0.47元/天 解锁文章
samba使用教程
LangLang_2020的博客
01-02 498
samba使用
保姆级教程 | origin绘制steric map（立体图）
baguette的博客
07-06 2715
由于在研究过程中发现了个网站可以自动绘制如下立体图（左侧），但想进行个性化修改却没办法实现，现在在origin里研究如何绘制这种效果的立体图（右侧），根据流程做完后点击“Map raw data”，将该图片的原始数据保留到本地。获得的*.data文件拖入origin中，将第三列“C(Y)”修改为“C(Z)”选中包含XYZ三列数据，点击“绘图-等高线图-颜色填充”，点击“确定”如果按上面的参数设置后，效果如下。
基于CAT的VBM和SBM计算学习笔记（一）VBM
Rose9614的博客
07-24 3905
回顾一下，本笔记介绍了从T1原始图像到灰质体素图像的全过程。在先使用DPABI软件预处理好T1图像后，用Cat的Segment自动化功能得到分割后的灰质体素图像，再用spm进行Smooth。那么就得到了可以使用的灰质体积图像，后续再通过TIV得到全脑体积，然后进行组间比较、临床相关等统计分析即可。
推荐开源项目：morfeus-ml——强大的分子特征计算工具
gitblog_00076的博客
10-10 950
推荐开源项目：morfeus-ml——强大的分子特征计算工具 项目介绍 在化学和材料科学的研究中，分子特征的精确计算是至关重要的。今天，我们为大家推荐一款功能强大的Python包——morfeus-ml，它专门用于计算分子特征，能够帮助研究人员更高效地进行相关研究。 项目技术分析 morfeus-ml是基于Python开发的开源项目，具有以下技术亮点： 易于安装：支持通过pip和conda进...
Error:can not open the file [?./input/1000G.EUR.QC/g1000_eur.fam] to read
2301_79091389的博客
07-18 1171
在命令行中使用 ./input/1000G.EUR.QC/g1000_eur.fam 可能是相对于当前工作目录的路径，而 smr-1.3.1-win.exe 可能期望相对于其执行文件所在目录的路径或者需要完整的绝对路径。确保程序 smr-1.3.1-win.exe 能够正确解析和访问文件 g1000_eur.fam，可以尝试使用完整的绝对路径来指定文件位置。在学习SMR时遇见的一个文件路径问题，浅记一下。
Spring 框架下 Redis 会话存储应用实践
最新发布
深耕后端、偏爱架构，用代码与设计构建可靠系统
12-11 410
本文介绍了使用Redis作为Spring Boot应用会话存储的解决方案。文章首先分析了传统服务器内存会话的局限性，包括单机限制、内存压力和分布式一致性问题。接着阐述了Redis作为会话存储的优势，如高性能内存访问、分布式支持和自动过期机制。通过Spring Boot集成示例，详细说明了配置步骤和会话操作方法，并提供了高并发优化策略，如连接池调优和本地缓存结合Redis。最后以购物车案例展示了Redis会话存储的实际应用，并总结了Redis会话存储在分布式共享、高并发支持和安全性方面的优势。
SpringBoot整合Spring-AI并使用Redis实现自定义上下文记忆对话
CodersCoder的博客
12-11 547
本文介绍了基于SpringAI和Redis实现带有上下文记忆的AI对话系统。通过配置SpringAI与DeepSeek大模型集成，并使用Redis存储对话历史，实现了多轮对话功能。关键技术包括：自定义ChatMemory服务管理对话上下文，包括消息裁剪和Token估算；RedisTemplate配置用于持久化存储；OpenAI接口封装实现模型调用。系统支持会话历史维护、自动消息裁剪和24小时会话过期，为构建智能对话系统提供了可扩展的实现方案。
Redis Hash类型深度解析：结构、原理与实战应用
2303_78940834的博客
12-11 383
Redis Hash是一个键值对集合，用于存储字段-值（field-value）映射。为了避免与Redis本身的key-value结构混淆，我们将Hash内部的键值对称为对。fill:#333;color:#333;color:#333;fill:none;Redis KeyHash类型Value...Redis Hash类型是一个功能强大、灵活的数据结构，特别适合存储对象类型的数据。
分布式锁实现方案Redis和Zookeeper对比实战
在代码的世界里，每天进步1%
12-06 1094
方案推荐场景学习原理Redisson生产环境首选强一致性要求互斥性：同一时刻只有一个客户端持有锁防死锁：客户端崩溃锁能自动释放可重入：同一线程可多次获取高可用：锁服务不能单点故障有问题评论区交流~
Redis（十四）——分布式锁
Java球球憋卷啦🥵
12-10 750
Redis分布式锁是一种业务锁，与数据库锁不同，它锁定的是业务而非数据。相比Java本地锁，Redis锁支持分布式场景。关键特性包括：互斥性、高可用性、防死锁（超时机制）、防误删（唯一标识）和可重入性。实现方式从早期的SETNX+EXPIRE（非原子）演进到SET NX EX命令（原子操作）。Redisson框架通过看门狗机制（自动续期）和Lua脚本优化了锁管理，而RedLock算法（多节点加锁）因主从同步问题逐渐被WAIT命令方案替代。对于强一致性场景，推荐使用ZooKeeper的临时节点机制。分布式锁的
第4篇：Redis Cluster集群深入理解
小雨下雨的雨
12-09 835
Redis Cluster是Redis官方提供的分布式解决方案，通过数据分片、节点通信和故障转移实现高可用。其核心架构采用无中心化设计，使用16384个哈希槽进行数据分片，通过CRC16算法计算键的槽号。节点间采用Gossip协议通信，实现状态同步和故障检测。客户端请求通过MOVED重定向机制自动路由到正确节点。Redis Cluster支持水平扩展，能够动态添加节点并重新分配哈希槽，同时具备自动故障转移能力，确保集群高可用性。键标签(Hash Tags)机制可将相关键分配到同一槽位，便于事务操作。
redis tools gui ---Redis图形化漏洞利用工具
m0_73767377的博客
12-11 206
基于Python 3开发的Redis漏洞利用工具，主要功能包括：Redis密码爆破、CLI控制台、计划任务反弹shell、SSH公钥写入、目录探测、任意文件写入（webshell）、CVE-2022-0542命令执行以及主从复制命令执行（会清空目标数据）。工具已打包为可执行文件redis_tools_GUI.exe，也可通过Python直接运行。
Redis：安装、主从复制、Sentinel 哨兵、Cluster 集群
m0_73341242的博客
12-10 973
本文梳理了 Redis 在不同业务规模下的典型部署方式，包括安装、主从复制、Sentinel 哨兵机制以及 Cluster 集群架构。随着业务对高可用性与可扩展性的要求不断提升，Redis 的部署也呈现出由简单到复杂、由单节点到分布式的演进路径。单机模式 是 Redis 的基础形态，部署简单，但不具备容错能力。主从复制 提供数据冗余与读写分离机制，但仍然无法解决主节点故障带来的服务不可用风险。Sentinel 哨兵 在主从架构基础上引入自动故障转移能力，实现了高可用部署，是生产环境常用方案。
基于Redis的分布式任务调用框架实现
u013214505的博客
12-07 685
本文介绍了基于Redis Stream实现的分布式任务框架Demo，主要功能包括Agent节点管理、异步/同步调用及消息追踪。通过Redis HASH和SET实现Agent上下线管理，利用Stream进行消息传递：异步调用通过XADD发送消息，XACK确认处理；同步调用结合键空间通知机制实现结果等待。框架支持消息查询跟踪，建议开启AOF持久化并使用事务保证操作一致性。该方案可作为轻量级消息队列替代方案，具有实现简单、易于扩展等优点。
【Redis 数据库介绍】
武帝为此的博客
12-07 764
Redis是一个开源的内存型键值数据库，支持字符串、哈希、列表、集合、有序集合等多种数据结构。它采用内存存储+持久化机制，具有极高的读写性能和低延迟。Redis适用于缓存、会话存储、消息队列、排行榜等场景，特别适合需要高并发和低延迟的应用。与传统关系型数据库相比，Redis缺乏复杂查询能力，但性能更优。Java可通过Jedis等客户端操作Redis，实现高效的数据存取。在实际应用中，Redis常与传统数据库配合使用，发挥各自优势。
Nginx 代理 mysql redis MQ 等各种软件，供客户端访问链接
lizhengyu891231的博客
12-08 253
Nginx 代理 mysql redis MQ 等各种软件，供客户端访问链接
安装的是redis新版本，但导入的时候一直显示是旧版本
weixin_56449709的博客
12-09 201
摘要：本文介绍了解决Python Redis包版本冲突的方法。首先通过grep命令定位错误文件，发现存在非官方源安装的修改版或旧版本残留。解决方案包括：1)强制卸载redis包并删除残留文件；2)清理pip缓存；3)从官方PyPI源重新安装指定版本(7.0.0)。随后提供了验证代码，检查Redis导入和连接功能是否正常，并包含一个测试脚本示例，演示如何存储和读取JSON格式数据。整个过程强调要确保使用正确的安装源和环境。
Redis 入门到精通
wuletaotao的专栏
12-11 432
雪崩：大量 Key 同时过期 → Redis/DB 压垮解决方案：随机过期时间多级缓存限流熔断。
第10篇：Redis监控、运维与故障排查
小雨下雨的雨
12-10 625
Redis监控与运维实践摘要 本文系统讲解了Redis监控运维的关键要点：1）监控核心指标（QPS、延迟、内存、连接数）；2）使用INFO命令、redis-cli工具和Prometheus进行监控；3）日志配置与分析（服务器日志、慢查询）；4）性能测试与故障排查流程；5）常见问题处理（内存不足、性能下降等）；6）运维最佳实践（告警规则、备份策略）。通过建立完善的监控体系，可有效保障Redis稳定运行，快速定位解决问题。
Redis中KEYS命令的潜在风险与遍历建议
铁锚的优快云博客
12-07 261
本文通过一次 Redis 执行 KEYS 命令引发的生产环境故障， 讨论了相应的风险与替代方案。 官方强烈建议仅将KEYS用于调试，常规应用应改用SCAN命令或SSCAN命令来安全遍历key。
评论 1
成就一亿技术人!
拼手气红包6.0元
还能输入1000个字符
 
红包 添加红包
表情包 插入表情
表情包 代码片
 条评论被折叠 查看
添加红包

请填写红包祝福语或标题

个

红包个数最小为10个

元

红包金额最低5元

当前余额3.43元 前往充值 >
需支付：10.00元
成就一亿技术人!
领取后你会自动成为博主和红包主的粉丝 规则
hope_wisdom
发出的红包
实付元
使用余额支付
点击重新获取
扫码支付
钱包余额 0

抵扣说明：

1.余额是钱包充值的虚拟货币，按照1:1的比例进行支付金额的抵扣。
2.余额无法直接购买下载，可以购买VIP、付费专栏及课程。

余额充值