推荐开源项目:morfeus-ml——强大的分子特征计算工具

推荐开源项目:morfeus-ml——强大的分子特征计算工具

morfeus A Python package for calculating molecular features morfeus 项目地址: https://gitcode.com/gh_mirrors/mo/morfeus

项目介绍

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在化学和材料科学的研究中,分子特征的精确计算是至关重要的。今天,我们为大家推荐一款功能强大的Python包——morfeus-ml,它专门用于计算分子特征,能够帮助研究人员更高效地进行相关研究。

项目技术分析

morfeus-ml是基于Python开发的开源项目,具有以下技术亮点:

  • 易于安装:支持通过pip和conda进行快速安装,方便用户快速上手。
  • 模块化设计:可以作为Python模块导入,轻松集成到现有工作流程中。
  • 命令行支持:除了Python接口,还提供了命令行工具,方便用户在不同场景下使用。

项目在GitHub上进行了严格的测试,确保了代码的稳定性和可靠性。

项目及技术应用场景

morfeus-ml广泛应用于以下场景:

  • 药物设计:计算药物的分子特征,如配体锥角、埋藏体积等,辅助药物分子设计。
  • 材料科学:分析材料的分子结构和性质,如溶剂可及表面积、Sterimol参数等。
  • 化学研究:研究分子的几何和电子特性,如局部力常数、XTB电子描述符等。

无论是学术研究还是工业应用,morfeus-ml都能提供强大的支持。

项目特点

morfeus-ml具有以下显著特点:

  • 丰富的功能:支持多种分子特征计算,包括咬角、埋藏体积、构象工具、色散描述符、精确配体锥角、配体实角、局部力常数、锥化率、溶剂可及表面积、Sterimol参数、XTB电子描述符等。
  • 易用性:提供简洁的API和命令行接口,用户无需深厚的编程背景即可使用。
  • 开源免费:项目完全开源,用户可以自由使用和修改,适合各种研究和应用需求。

安装方式

pip安装:

$ pip install morfeus-ml

conda安装:

$ conda install -c conda-forge morfeus-ml

使用示例

Python模块使用:

from morfeus import ConeAngle, read_xyz
elements, coordinates = read_xyz("PdPMe3.xyz")
cone_angle = ConeAngle(elements, coordinates, 1)
print(cone_angle.cone_angle)

命令行使用:

$ morfeus cone_angle PdPMe3.xyz - 1 - cone_angle
117.11012922937584

更多详细信息,请参考官方文档

结语

morfeus-ml是一款功能强大、易于使用的分子特征计算工具,适用于广泛的化学和材料科学研究。如果你正在寻找一个可靠的分子特征计算解决方案,不妨试试morfeus-ml,相信它一定能为你带来高效的科研体验!

PyPI - License PyPI Conda (channel only) Conda Python requires Testing DOI

morfeus A Python package for calculating molecular features morfeus 项目地址: https://gitcode.com/gh_mirrors/mo/morfeus

创作声明:本文部分内容由AI辅助生成(AIGC),仅供参考

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