大图像数据处理:从计算可追溯性到算法实现
在大数据时代,尤其是涉及大图像数据的处理中,计算的可追溯性和可重复性,以及图像算法的有效实现是至关重要的。下面我们将深入探讨这些关键概念和相关技术。
计算的可追溯性与可重复性
计算的可追溯性是计算可重复性的必要但不充分条件。为了正确重现任何计算结果,必须了解输入数据集、任务配置、软件版本和计算平台。然而,即使知道所有输入和配置,在不同的执行环境(特别是不同的硬件平台和操作系统)中实现可重复性也可能很困难。例如,32 位和 64 位系统由于处理浮点数的方式不同,可能会产生非常不同的结果。此外,在两个系统上安装同一版本的软件包也可能返回略有不同的结果,因为许多软件包依赖于具有多个版本的其他外部库。
使用像 WIPP 这样集中部署的软件应用程序,如果管理得当,可能有助于计算的可重复性。WIPP 提供可追溯的计算,算法版本在新版本发布之间是已知且固定的,用户可以随时查看其计算使用了哪些软件及其版本。不过,软件更新可能对用户不利,因为算法的新版本不会立即可用,用户必须等待 Web 系统的下一次发布才能使用。
大图像数据实验的测量要求
大图像数据实验需要满足以下测量要求:
1. 多种尺度 :涵盖从纳米到厘米的物理尺度,以及从 TB 到 PB 大小的数字数据集。
2. 复杂特性 :处理检测感兴趣对象(如细胞有丝分裂、迁移、凋亡、分化)的空间、光谱和时间复杂性。
3. 计算速度 :确保时间关键计算的速度(图像分析速度快于细胞变化)。
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大图像数据处理与算法实现
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