远程连接与文本数据文件操作指南
1 远程连接相关操作
在计算生物学领域,常常需要在远程计算机(服务器)上工作,因为它们通常比本地计算机(客户端)拥有更强大的计算能力,还可作为 Web 服务器或数据存储设备。这就引出了一些问题,比如如何在远程服务器上执行命令,以及如何在本地客户端和远程服务器之间传输文件。下面将介绍几种不同的解决方案。
1.1 从网络下载数据
这是最简单的远程连接方式,有两个标准命令可用于此操作,分别是 wget 和 curl 。
1.1.1 wget
wget (以前称为 geturl )在大多数 Linux 系统上都有安装,其使用方法非常简单,只需提供要下载的 Web 资源的 URL 即可。以下是一个示例:
$ wget "ftp://ftp.ncbi.nih.gov/genbank/gbrel.txt"
--2012-09-28 14:38:12-- ftp://ftp.ncbi.nih.gov/genbank/gbrel.txt
=> ‘gbrel.txt’
Resolving ftp.ncbi.nih.gov (ftp.ncbi.nih.gov)... 130.14.250.11
Connecting to ftp.ncbi.nih.gov (ftp.ncbi.nih.gov)|130.14.250.11|:21... connected.
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