16、深度学习在医学图像分类中的应用

深度学习在医学图像分类的应用

深度学习在医学图像分类中的应用

1. 引言

近年来,深度学习已成为广为人知的研究领域。它是机器学习的一种,而机器学习又是人工智能的一个分支。深度学习可能会重塑健康诊断和管理,它能为人类专家完成分类挑战,并快速检查大量图像。深度学习,也称为深度神经学习,提供了一种高效的实时学习系统,能够从原始临床图像像素中确定分类标签。

与其他提供自动化诊断解决方案的人工智能(机器学习)程序相比,深度学习最近取得了巨大进展。然而,传统的机器学习策略并不适合处理复杂问题。随着临床成像设备的巨大进步,医疗数据不再匮乏。分析图像既具有挑战性又令人兴奋,因为数据量非常大。由于临床图像和策略的快速发展,临床专家需要进行广泛而繁琐的工作,且容易出现人为错误,不同专业人员之间可能存在显著差异。通过人工智能策略进行的自动感染诊断提供了一种替代方案,但传统的人工智能技术并不适合处理复杂问题。深度学习可以帮助分离特征并创建新特征,还能发现感染、衡量预后目标,并为医生提供有用的临床预测表示,以专业地支持他们。

人工智能(AI)和机器学习(ML)最近在临床领域取得了快速进展,如计算机辅助诊断、临床图像处理、图像翻译、图像引导治疗、图像合并、图像配准、图像分割、图像恢复和图像评估等。机器学习方法通过从临床图像中挖掘特征来处理有说服力和高效的信息。这些技术简化并支持专家诊断和预测疾病风险,并轻松治愈疾病。它们还提高了临床医生和研究人员评估疾病基本变化的能力。常用的机器学习计算形式包括线性和逻辑回归、支持向量机、K - 均值、k近邻、随机森林、朴素贝叶斯等。这些技术的局限性包括处理原始图像、繁琐且依赖专业数据,以及需要更多时间来微调数据的属性。然而,深度学习策略,如卷积神经网络(CNN)、循环神经网络(RNN)、长短期记忆网络(LSTM)、生成对抗网络(GAN)、极限学习模型(ELM)等,可以自动从原始信息中提取特征。这些模型试图从大量图像中自动熟悉一定程度的推测、描绘和数据,这些图像显示了信息的理想行为。

2. 医学图像分类

2.1 什么是医学成像

医学成像是获取人体内部器官或组织图像的过程,用于医疗用途,如跟踪健康状况、检测和治疗病变及疾病。此外,它有助于创建解剖和生理数据库,可进一步用于提取相关信息以诊断疾病和损伤。尽管医学领域目前有巨大发展,但对于许多有价值的临床用途,医学成像仍能获取有关人体的知识。不同形式的医学成像技术提供了关于需要临床检查或治疗的身体部位的不同细节。医疗中心、诊所以及独立的放射学和病理学设施都使用临床成像设备。富士胶片、通用电气、西门子医疗、飞利浦、东芝、日立和三星是这些临床成像设备的主要制造商。据Zion市场研究报告,随着临床成像的发展和应用的扩大,到2025年,全球临床成像设备市场预计价值约486亿美元,而2018年预计为340亿美元。

2.2 为什么医学成像如此重要

用于诊断的医学成像被认为是验证诊断和记录许多疾病的重要部分。高质量的图像在许多计算机视觉技术中仍然占据主导地位。它不仅有助于患者决策,还可以减少不必要的医疗程序。例如,使用超声和MRI等医学成像技术可能有助于避免手术程序。早期诊断包括检测老年人问题、慢性疼痛儿童、糖尿病前期和肿瘤检测的实验方法。医学成像使关键医疗信息易于获取,有助于诊断肿瘤生长、肺炎、出血、创伤性脑损伤等疾病。美国国家经济研究局的研究表明,反复进行医学成像可提高个人的生命概率。因此,可以合理假设医学成像诊断和治疗将避免激进和严重的程序。应尽量减少这些措施带来的问题,以降低成本和缩短时间。一位哈佛学者在他的研究中报告说,在这些技术上花费385美元可以为一天的住院节省近3000美元。Linder和Schiska(2015)的一项研究表明,通过临床成像进行的诊断有助于临床专家推荐药物,因此乳腺癌死亡率因这些程序的出现而降低了22%至34%。此外,早期治疗阻止血栓形成,降低了结肠癌导致的20%的死亡率。因此,通过有用的成像技术进行早期检测激励了专家早期分析疾病,也为患者提供了争取更长寿命的机会。作为一种不稳定的技术,随着计算机视觉的发展,临床成像正在逐步发展。因此,在未来几年,随着计算机视觉研究人员和健康专家数量的增加,其应用将继续增长,以推动临床成像的发展。

2.3 谁来进行医学成像以及为谁服务

医学从业者使用诊断成像来根据器官状态评估康复程序。成像方式的选择基于所研究的身体部位和患者的健康问题。因此,在进行程序之前,会检查患者身体对成像设备发出的射线是否有不良反应,以确保使用最少的射线发射量。此外,会采取适当的护理措施,以防止对身体其他部位产生影响。医生、患者和计算机视觉学者是医学成像的使用者,具体如下:
- 医疗专业人员 :如医生和临床医生操作它进行结构审查,开必要的药物,并维护图形数据库,以备其他临床情况参考。
- 患者 :是从医学图像的最终报告中寻求服务的人。
- 计算机视觉学者 :使用传统图像处理或基于深度学习的新方法,在医学专家的帮助下,从潜在模式中标记图像数据集。

2.4 医学成像如何进行

医学成像是一种诊断成像,包括放射学。以下是包括的放射学技术:
1. 放射照相术
2. MRI - 磁共振成像
3. 超声内镜检查
4. 热成像
5. 核医学成像
6. 断层扫描

2.5 什么是医学图像分类

对象分类对机器来说是一项具有挑战性的任务。图像分类是一个复杂的过程,包括图像预处理、成像传感器、对象分割、特征提取、对象检测和对象分类等各种程序。使用数据库中维护的预定义模式将待分类的对象与相关类别进行比较。图像分类在不同的用例中是一项基本且有意义的任务,包括远程检测、车辆导航、生物医学成像、视频监控、生物测量、现代视觉检查、机器人导航等。临床图像分类是将临床图像分组到不同类别的方法,以便专家可以轻松分析疾病或用于进一步检查。尽管在该领域发表了大量研究论文,但来自不同来源的临床图像在焦点区域、像素强度、纹理和色彩平衡方面可能会有所不同。如果仅使用传统特征对医学图像进行分类,有效地对某些类别进行表征将是繁琐的。深度学习是过去几年计算机科学及其应用中最新的研究领域之一。Hinton等人(2006)首次讨论了深度学习模型的框架。目前已经提出了几种其他用于解决图像问题的深度学习模型。

2.6 为什么深度学习优于传统方法

医疗行业是临床专家对临床数据进行大部分解读的主要领域。由于医学图像的复杂性、各种参数以及该领域最重要的基础知识,只有少数专家非常了解医学图像的解读。随着前面讨论的医学图像采集设备的出现,随着时间的推移,数据收集的挑战已经减少。因此,我们正处于医学成像快速发展的时期,同时也面临着对其进行有要求和有洞察力的分析。转向大数据增加了医学专家分析数据以获取见解的负担,并且可能容易出现人为错误。此外,传统的机器学习算法无法理解此类与医疗保健相关问题的复杂性,它们大多依赖于相关领域医学专家提取的特征。传统的学习方法是一项劳动密集型过程,并不准确,因为患者数据不同,而且数据分析知识往往与医学专家的经验不同。传统的人工智能计算,如逻辑回归、支持向量机、K - 近邻、决策树等,在不学习模糊示例的情况下准备学习原始图像信息。数据预处理同样耗时,因为它们围绕临床专家提供的数据进行。

相反,基于深度学习的算法在计算机视觉领域取得了巨大进展,能够识别未知模式并从原始图像数据中提取描述符。近年来,由于更精细的数据和对提取特征的监控,临床医生的有效诊断得到了改善。常见的深度学习策略包括卷积神经网络(CNN)、循环神经网络(RNN)、长短期记忆网络(LSTMN)、生成对抗网络(GAN)等算法。这些算法不需要对原始图像进行手动预处理。

3. 深度学习概述

3.1 深度学习的基础

3.1.1 深度学习的方面

深度学习可以通过以下关键特征来表征:
- 层次结构中的多层次表示
- 多功能神经网络
- 训练大规模神经网络
- 非线性多重变换
- 模式识别
- 提取功能
- 用于数据抽象的高级模型

3.1.2 深度学习的驱动因素

使专家能够充分利用深度神经网络保证能力的深度学习驱动因素如下:
- 多层学习网络可用
- 大数据管理潜力
- 高性能图形处理单元(GPU)的使用增加
- 数据规模和神经网络规模的增强
- 神经网络性能的提高
- 大量标记数据可用
- GPU进行并行计算的能力

3.2 深度学习架构

3.2.1 深度神经网络(DNN)

为了解决更复杂的模式,引入了一种由输入层、输出层和隐藏层组成的分层架构的神经网络。它有相互连接的神经元,接受输入并在一定程度上处理输入数据,最终将当前层的输出作为输入传递给下一层。神经元将信息求和,并对求和后的信息应用激活函数,最后将结果发送到下一层。额外隐藏层的扩展使我们能够处理复杂的非线性关系,这种类型的神经工程称为深度神经网络(DNN)。

DNN以多层方式分层堆叠神经元。当层数超过1000时,经过良好训练后,深度网络可以凭借庞大的信息数据库记住从输入到输出的所有可能映射,并能为隐藏情况创建智能预测,如插值和外推。因此,基于深度学习的算法对计算机视觉和医学成像有显著影响。在文本识别、语音识别等领域也有类似效果。

3.2.2 卷积神经网络

在卷积神经网络(CNN)中,多层感知器的变体可能直接从视觉图像的原始像素接受模式。CNN有卷积层、池化层、全连接层和softmax层。合并卷积层和池化层将有助于我们提取特征。softmax层被视为分类器。深度神经网络中的每个节点(称为神经元)由一个激活函数协调,用于控制输出。深度学习方法中使用的激活函数有很多种,如线性、sigmoid、tanh和修正线性单元(ReLUs)。

卷积神经网络中的另一个重要操作是池化,这是一种非线性下采样策略。使用的池化层类型有随机池化、最大池化和平均池化。最大池化是对将输入图像分割成矩形块后得到的每个块取局部最大值。最大池化有两个优点:消除最小值以缩短计算时间,减少中间特征图的维度,同时保持框架的平移不变性和鲁棒性。平均池化是另一种池化方法,子块是根据平均值创建的。在随机池化中,激活函数是在块内随机选择的。

以下是不同深度学习模型的常见用途表格:
| 深度学习模型 | 常见用途 |
| — | — |
| 人工神经网络(ANN) | 计算神经科学 |
| 卷积神经网络(CNN) | 图像处理、图像识别、视频分析、自然语言处理 |
| 循环神经网络(RNN) | 语音识别、手写识别 |
| 深度神经网络(DNN) | 声学建模 |
| 深度信念网络(DBN) | 图像识别、信息检索、自然语言理解、故障预测、药物发现 |
| LSTM/GRU网络 | 自然语言文本压缩、手写识别、语音识别、手势识别、图像字幕 |
| 深度堆叠网络(DSN) | 信息检索、连续语音识别 |

mermaid格式流程图展示医学成像流程:

graph LR
    A[患者需求] --> B[选择成像方式]
    B --> C{是否对射线有不良反应}
    C -- 否 --> D[进行医学成像]
    C -- 是 --> E[调整成像参数或更换方式]
    E --> D
    D --> F[获取图像]
    F --> G[图像分类处理]
    G --> H[医生诊断]
    H --> I[给出治疗建议]

3.2.3 循环神经网络(RNN)

循环神经网络(RNN)是一种专门用于处理序列数据的神经网络。在处理序列信息时,RNN能够记住之前的信息并应用到当前的处理中。与传统的神经网络不同,RNN具有循环结构,这使得它可以处理具有时间序列特征的数据,例如语音、文本等。

在医学图像分类中,RNN 可以用于处理具有时间顺序的医学图像序列,如动态的 MRI 扫描、视频监控中的医学图像等。它通过不断地更新隐藏状态,将之前的信息传递到当前时刻,从而更好地捕捉序列中的模式和趋势。例如,在分析心脏的动态图像时,RNN 可以学习到心脏在不同时间点的运动模式,有助于更准确地诊断心脏疾病。

3.2.4 深度玻尔兹曼机(也称为受限玻尔兹曼机)

深度玻尔兹曼机(DBM),也被称为受限玻尔兹曼机(RBM),是一种生成式随机神经网络。它由可见层和隐藏层组成,层内的神经元之间没有连接,层间的神经元之间存在连接。

RBM 的主要作用是学习数据的概率分布,通过调整神经元之间的权重来最大化数据的似然性。在医学图像分类中,RBM 可以用于特征提取和降维。它可以学习到医学图像中潜在的特征表示,将高维的图像数据映射到低维的特征空间,从而减少数据的复杂度,同时保留重要的信息。例如,在肿瘤检测中,RBM 可以提取出肿瘤的特征模式,帮助提高检测的准确性。

3.2.5 深度信念网络(DBNs)

深度信念网络(DBNs)是一种由多个受限玻尔兹曼机堆叠而成的深度神经网络。它结合了生成式模型和判别式模型的优点,具有强大的特征学习能力。

DBNs 的训练过程分为两个阶段:预训练和微调。在预训练阶段,通过逐层训练受限玻尔兹曼机,学习到数据的层次化特征表示。在微调阶段,使用监督学习方法对整个网络进行调整,以提高分类的准确性。在医学图像分类中,DBNs 可以自动学习到医学图像中的复杂特征,并且能够处理大规模的数据集。例如,在糖尿病视网膜病变的检测中,DBNs 可以从大量的视网膜图像中学习到病变的特征模式,从而实现准确的诊断。

3.2.6 深度自编码器(DAE)

深度自编码器(DAE)是一种无监督学习的神经网络,其目标是通过重构输入数据来学习数据的特征表示。它由编码器和解码器两部分组成,编码器将输入数据映射到低维的特征空间,解码器将低维的特征重构为原始数据。

在医学图像分类中,DAE 可以用于数据的去噪和特征提取。通过训练 DAE 对有噪声的医学图像进行重构,它可以学习到图像的本质特征,同时去除噪声的干扰。例如,在处理受到噪声污染的 MRI 图像时,DAE 可以有效地恢复图像的质量,并且提取出有用的特征用于疾病的诊断。

4. 深度学习在医学图像分类中的应用(文献综述)

4.1 深度学习用于糖尿病视网膜病变

糖尿病视网膜病变是糖尿病的常见并发症之一,早期检测对于预防失明至关重要。深度学习在糖尿病视网膜病变的检测中取得了显著的成果。通过使用卷积神经网络(CNN)等深度学习模型,可以对视网膜图像进行自动分析,识别出病变的特征。

研究表明,CNN 能够准确地检测出视网膜图像中的微动脉瘤、出血点等病变特征,其性能甚至超过了传统的检测方法。例如,一些研究使用大规模的视网膜图像数据集对 CNN 进行训练,在测试集上取得了高达 90%以上的准确率。

4.2 深度学习用于组织学和显微镜元素的检测

在组织学和显微镜检查中,深度学习可以帮助病理学家更准确地检测和分类细胞和组织的特征。通过对显微镜图像进行分析,深度学习模型可以识别出癌细胞、炎症细胞等不同类型的细胞,以及组织的结构和形态。

例如,使用卷积神经网络(CNN)可以对乳腺癌组织的显微镜图像进行分类,区分出良性和恶性肿瘤。研究表明,CNN 在组织学图像分类中的准确率可以达到 80%以上,为病理诊断提供了有力的支持。

4.3 深度学习用于胃肠道疾病检测

胃肠道疾病是常见的疾病之一,早期诊断对于治疗和预后至关重要。深度学习在胃肠道疾病的检测中具有很大的潜力。通过对胃肠道内镜图像进行分析,深度学习模型可以识别出溃疡、息肉、肿瘤等病变特征。

一些研究使用卷积神经网络(CNN)对胃肠道内镜图像进行分类,取得了较好的效果。例如,在胃溃疡的检测中,CNN 可以准确地识别出溃疡的边界和特征,为医生提供更准确的诊断信息。

4.4 深度学习用于肺部疾病

肺部疾病如肺炎、肺癌等严重威胁着人类的健康。深度学习在肺部疾病的检测和诊断中发挥着重要的作用。通过对胸部 X 光片、CT 扫描等医学图像进行分析,深度学习模型可以识别出肺部的病变特征。

例如,使用卷积神经网络(CNN)可以对胸部 CT 扫描图像进行肺癌的检测,其准确率可以达到 85%以上。此外,深度学习还可以用于肺部疾病的分类和预后评估,为临床治疗提供重要的参考。

4.5 深度学习用于心脏疾病分类

心脏疾病是导致人类死亡的主要原因之一,准确的诊断和分类对于治疗和预防至关重要。深度学习在心脏疾病的分类中具有很大的优势。通过对心电图(ECG)、心脏超声图像等医学数据进行分析,深度学习模型可以识别出不同类型的心脏疾病。

例如,使用卷积神经网络(CNN)和循环神经网络(RNN)的组合模型可以对心电图信号进行分析,准确地分类出心律失常、心肌梗死等心脏疾病。研究表明,这种组合模型在心脏疾病分类中的准确率可以达到 90%以上。

4.6 深度学习用于肿瘤检测

肿瘤的早期检测对于提高患者的生存率至关重要。深度学习在肿瘤检测中具有很大的潜力。通过对医学图像如 CT 扫描、MRI 等进行分析,深度学习模型可以识别出肿瘤的位置、大小和特征。

一些研究使用卷积神经网络(CNN)对脑部肿瘤的 MRI 图像进行检测,取得了较好的效果。例如,CNN 可以准确地分割出肿瘤的区域,为手术治疗提供重要的指导。

4.7 深度学习用于阿尔茨海默病和帕金森病的检测

阿尔茨海默病和帕金森病是常见的神经系统疾病,早期诊断对于治疗和干预至关重要。深度学习在这两种疾病的检测中具有很大的应用前景。通过对脑部 MRI 图像、脑电图(EEG)等医学数据进行分析,深度学习模型可以识别出疾病的早期特征。

例如,使用卷积神经网络(CNN)可以对阿尔茨海默病患者的脑部 MRI 图像进行分析,检测出大脑中的萎缩和病变区域。研究表明,CNN 在阿尔茨海默病检测中的准确率可以达到 80%以上。

5. 深度学习的当前进展和局限性

5.1 数据集的有限可用性

深度学习模型的训练需要大量的标注数据,然而在医学领域,获取大规模的标注数据集是一项具有挑战性的任务。医学数据通常涉及患者的隐私和安全问题,数据的收集和标注需要严格的伦理审批和专业的医学知识。

此外,不同的医学中心和研究机构可能使用不同的设备和标准进行数据采集,导致数据的一致性和可比性较差。这使得深度学习模型在不同的数据集上的性能可能存在较大的差异。

5.2 隐私和法律问题

医学数据包含了患者的敏感信息,如个人身份、疾病诊断等。在使用深度学习技术处理医学数据时,需要严格遵守隐私和法律规定,保护患者的隐私和权益。

例如,在数据共享和传输过程中,需要采取加密和安全措施,防止数据泄露。同时,在进行研究和开发时,需要获得患者的知情同意,确保数据的使用符合伦理和法律要求。

5.3 数据和模型标准化

目前,医学领域缺乏统一的数据和模型标准。不同的医学中心和研究机构可能使用不同的图像格式、标注方法和模型架构,导致数据的兼容性和可重复性较差。

为了推动深度学习在医学领域的广泛应用,需要建立统一的数据和模型标准,促进数据的共享和交流。例如,制定医学图像的统一格式和标注规范,开发通用的深度学习模型评估指标等。

6. 结论

深度学习在医学图像分类中具有巨大的潜力和应用前景。它可以自动提取医学图像中的特征,提高疾病的诊断准确性和效率,为临床医生提供有力的支持。

然而,深度学习在医学领域的应用还面临着一些挑战,如数据集的有限可用性、隐私和法律问题、数据和模型标准化等。为了克服这些挑战,需要加强跨学科的合作,整合医学、计算机科学、统计学等多个领域的知识和技术。

未来,随着技术的不断发展和数据的不断积累,深度学习在医学图像分类中的应用将会越来越广泛,为人类的健康事业做出更大的贡献。

以下是深度学习在医学图像分类中的应用总结表格:
| 应用领域 | 深度学习模型 | 主要成果 |
| — | — | — |
| 糖尿病视网膜病变 | CNN | 准确检测病变特征,准确率超 90% |
| 组织学和显微镜元素检测 | CNN | 准确分类细胞和组织,准确率达 80%以上 |
| 胃肠道疾病检测 | CNN | 识别溃疡、息肉等病变,效果较好 |
| 肺部疾病 | CNN | 检测肺癌准确率达 85%以上 |
| 心脏疾病分类 | CNN + RNN | 准确分类多种疾病,准确率达 90%以上 |
| 肿瘤检测 | CNN | 分割肿瘤区域,指导手术治疗 |
| 阿尔茨海默病和帕金森病检测 | CNN | 检测早期特征,准确率达 80%以上 |

mermaid格式流程图展示深度学习在医学图像分类中的应用流程:

graph LR
    A[医学图像数据] --> B[数据预处理]
    B --> C[选择深度学习模型]
    C --> D[模型训练]
    D --> E[模型评估]
    E -- 合格 --> F[应用于医学诊断]
    E -- 不合格 --> C
    F --> G[临床决策支持]
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