3、生物信息学中的智能体与数据挖掘及基于知识的强化学习

生物信息学中的智能体与数据挖掘及基于知识的强化学习

在生物信息学领域,数据挖掘技术正发挥着越来越重要的作用,但也面临着一些挑战。本文将介绍生物信息学中智能体与数据挖掘的相关应用,以及基于知识的强化学习在数据挖掘中的应用。

酶分类

ATUCG可用于根据酶委员会(EC)的顶级层次结构将酶分类为不同的功能类别,这对于尚未注释的蛋白质的功能研究具有重要意义。因为了解酶所属的家族或亚家族有助于确定其催化机制和特异性,为相关生物功能提供线索。

训练数据准备
  • 从SWISS - PROT数据库中选取“DE”行标注有EC编号的所有蛋白质。
  • 使用这些EC编号的第一位数字,共找到约60,000个标注有EC编号的蛋白质。
  • 提取与InterPro结构域分类相关的AC作为属性,这些AC在SWISS - PROT中作为交叉引用数据库出现。每个SWISS - PROT条目对应一个学习实例,使用InterPro AC作为学习算法的属性。
EC类 属性数量
氧化还原酶 715
水解酶 1269
异构酶 231
转移酶 1309
3D应力敏感度分析拓扑优化】【基于p-范数全局应力衡量的3D敏感度分析】基于伴随方法的有限元分析和p-范数应力敏感度分析(Matlab代码实现)内容概要:本文档介绍了基于伴随方法的有限元分析p-范数全局应力衡量的3D应力敏感度分析,并结合拓扑优化技术,提供了完整的Matlab代码实现方案。该方法通过有限元建模计算结构在载荷作用下的应力分布,采用p-范数对全局应力进行有效聚合,避免传统方法中应力约束过多的问题,进而利用伴随法高效求解设计变量对应力的敏感度,为结构优化提供关键梯度信息。整个流程涵盖了从有限元分析、应力评估到敏感度计算的核心环节,适用于复杂三维结构的轻量化高强度设计。; 适合人群:具备有限元分析基础、拓扑优化背景及Matlab编程能力的研究生、科研人员工程技术人员,尤其适合从事结构设计、力学仿真多学科优化的相关从业者; 使用场景及目标:①用于实现高精度三维结构的应力约束拓扑优化;②帮助理解伴随法在敏感度分析中的应用原理编程实现;③服务于科研复现、论文写作工程项目中的结构性能提升需求; 阅读建议:建议读者结合有限元理论优化算法知识,逐步调试Matlab代码,重点关注伴随方程的构建p-范数的数值处理技巧,以深入掌握方法本质并实现个性化拓展。
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