windows平台 BLAST Database creation error: mdb_env_open: 磁盘空间不足。

最新推荐文章于 2024-06-14 09:40:43 发布
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分类专栏： 日常笔记 文章标签： blast windows
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本文链接：https://blog.youkuaiyun.com/actnote/article/details/115386850
博客内容提到，从blast+2.10.1版本开始遇到运行错误，尝试修改环境变量和使用全英文路径等方法无效。解决方案是安装并使用2.9.0版本，通过下载、解压并将bin目录添加到环境变量即可正常使用。

摘要生成于 C知道 ，由 DeepSeek-R1 满血版支持， 前往体验 >

blast+ 2.10.1往上版本就是会报错
改环境变量到1000000，
以及绝对路径都英文之类的不管用。

安个低于2.10的版本，2.9.0就可以
下下来，解压，把bin加入环境变量即可用。
https://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/executables/blast+/2.9.0/

BLAST Database error: No alias or index file found for nucleotide database [nt] in search path解决办法
高端的博客
11-14 3万+
Blast网页版做生物信息的应该都用过，输入你想比对的序列或者fasta文件提交网页就能出来结果。 但如果你想用blast的命令行模式，用法会跟网页版非常不一样。新手会遇到很多问题，遇到频率最高的应该就是我这篇文章想说的问题BLAST Database error: No alias or index file found for nucleotide database [nt] in searc...
BLAST Database error: No alias or index file found for nucleotide database
qq_35255905的博客
06-06 4917
BLAST Database error: No alias or index file found for nucleotide database 在本地使用blast确实比较麻烦，需要两个步骤 建库 比对 这里，根据官网提供的信息，建库又需要两个步骤； 产生masking data 产生真正的BLAST数据库 1.建库 1.1 创建mask information files. 创建mask informations files有方式，大同小异，在"建库"上的链接可以查询。这里讲一种方法。使用dus
blast database error:
m0_52116696的博客
11-18 1643
本人还未深入了解blast，自己跑的时候遇见的问题 如果你有Gma.pep文件和Vvi.pep文件（蛋白质） Vvi文件建库 我出现问题的语句为: …>blastp -query Gma.pep -db Gma -out Vvi_Gma.blast -outfmt 6 -max_target_seqs 10 -evalue 1e-5 -num_threads 8 问题在于-db Gma 应该改为-db Vvi（建库的） 即: …>blastp -query Gma.pep -db Vvi -ou
Excel Access 新建空白文档/打开已有文档 提示内存或磁盘空间不足的解决方法--验证...
weixin_30706691的博客
06-28 554
服务器上发现,打开mdb数据库,点知道只有个空白的截面,打开已有的excel文件，一样，但多了个提示:内存磁盘空间不足或者关闭不再使用的工作表或者程序.检查过，内存和磁盘很充裕啊。那里不足啊，任务管理器一查看，也正常啊 试过好多方法,不行啊。我上网找啊找。终于，解决了。 方法1、 建议您尝试开启Windows Firewall 和Windows Update两个服务，查看问题情况。（当解决...
Input/output error
qq_38335768的博客
09-06 4577
Traceback (most recent call last): File "./scripts/create_lmdb.py", line 143, in <module> create_lmdb(args.dataset, raw_dir, lmdb_dir, filter_file) File "./scripts/create_lmdb.py", line 65, in create_lmdb txn.commit() lmdb.Error: mdb_txn_
数据库服务器Input/output error (故障20170122)
weixin_34391445的博客
11-14 1310
描述： 数据库系统出现告警，登陆查看使用系统命令报错，提示Input/output error 模拟故障处理过程： 检查文件系统时，该文件系统必须卸载。当出现错误时fsck会提示是否修复， 可以用-y参数：不提示是否修复 fsck - check and repair a Linux file system # df -h Filesyst...
BLAST_FDR:BLAST_FDR和PSI-BLAST_FDR是BLAST和PSI-BLAST的变体-开源
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07-14
mimo,vblast4发4收仿真,初学者可以
Blast比对出现错误BLAST Database error: No alias or index file found for nucleotide database
m0_46468289的博客
03-14 3399
Blast比对出现错误BLAST Database error: No alias or index file found for nucleotide database
Caffe中LMDB使用
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