LAMMPS中的MP方法:使用Matlab进行粘度计算

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本文介绍了如何利用LAMMPS中的Muller-Plathe(MP)方法结合Matlab计算分子动力学系统的粘度。MP方法通过在系统中创建速度梯度模拟剪切流,将系统分为高速和低速区,交换粒子动量以计算粘度。提供了一个使用Matlab执行LAMMPS模拟并解析输出文件获取粘度数据的示例代码。注意,实际应用中需根据具体模拟系统和需求调整LAMMPS输入文件。

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LAMMPS中的MP方法:使用Matlab进行粘度计算

LAMMPS(Large-scale Atomic/Molecular Massively Parallel Simulator)是一个流行的分子动力学模拟软件包,用于模拟原子和分子系统的行为。在LAMMPS中,使用不同的方法可以计算各种性质,包括粘度。本文将介绍如何使用Matlab结合LAMMPS中的MP(Muller-Plathe)方法来计算系统的粘度。

MP方法是一种基于分子动力学的方法,通过在系统中引入速度梯度来模拟剪切流。该方法将系统分为两个区域,即高速区和低速区。通过在这两个区域之间交换粒子的动量,可以计算系统的粘度。

以下是使用Matlab编写的示例代码,用于计算LAMMPS中的MP方法粘度:

% 设置LAMMPS输入文件的路径
inputFile = 'input.lammps';

% 设置LAMMPS输出文件的路径
outputFile =
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