分子动力学模拟、lammps

最新推荐文章于 2025-10-17 22:11:57 发布

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#区块链

博客围绕区块链展开，但具体内容缺失。区块链是信息技术领域重要概念，涉及去中心化、密码学等技术。

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分子动力学仿真软件：LAMMPS_（25）.多尺度模拟

kkchenjj的博客

07-05

1137

为粗粒化模型定义合适的力场参数。

分子动力学模拟lammps 粘度、表面张力分析in文件

12-23

分子动力学模拟lammps 粘度表面张力分析in文件分子动力学模拟lammps 粘度、表面张力分析in文件

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lammps软件_LAMMPS分子动力学模拟技术：从入门到应用

weixin_39886841的博客

12-03

3750

分子动力学模拟(Molecular Dynamics)是近年来飞速发展的一种分子模拟方法，已经被广泛应用于化学化工、材料科学与工程、物理、生物医药等科学和技术领域，起到越来越重要的作用。MD模拟用来研究不能用解析方法来解决的复合体系的平衡性质和力学性质，用来搭建理论和实验的一个桥梁，在数学、生物、化学、物理学、材料科学和计算机科学交叉学科占据重要地位。开源的分子动力学模拟软件LAM...

分子动力学模拟：方法列举与比较

最新发布

m0_74744705的博客

10-17

833

方法精度计算成本典型体系规模时间尺度经典MD低低10^5-10^6原子纳秒-微秒第一性原理MD高极高10-100原子皮秒级粗粒化MD中低极低10^6+原子微秒-毫秒QM/MM中高高100-1000原子皮秒-纳秒机器学习分子动力学是一种将机器学习技术与分子动力学模拟相结合的方法。用一个通过机器学习训练得到的、高度精确的“势函数”来替代传统经验力场，从而以接近经验力场的计算成本，获得接近第一性原理的计算精度。简单来说，

LAMMPS分子动力学模拟技术及应用

wang86zzz的博客

03-17

4521

学习Lammps主要分为几部分一、MD基础知识 1.1 系综理论 1.2 主要算法介绍 1.3 单位制 1.4 积分步长的选取 1.5 温度和压力控制 1.6 周期性边界条件 1.7 力场简介 1.8分子动力学模拟流程二、LAMMPS基础入门 2.1 LAMMPS在win10和ubuntu系统的安装及使用 2.2 in文件结构格式 2.3 in文件基本语法：结合实例，讲解in文件常用命令 2.4 data文件格式 2.5 LAMMPS常见错误解决途径实例操作：运行并

lammps分子动力学模拟

01-09

很好非常好相当的好都可以下载，学习lammps分子动力学模拟的来下载吧

分子动力学模拟的Lammps实现

10-25

LAMMPS实例_；分子模拟_lammps_lammps实例_分子动力学_lammps编程

09-10

LAMMPS在分子动力学模拟中提供了丰富的势能函数，如斯莱特型势、埃伦费斯特-范德华斯势、查普曼-恩克尔势等，以描述不同类型的相互作用，包括金属、半导体、液体、生物大分子等。 **LAMMPS实例**通常包含输入文件、...

分子动力学模拟及其LAMMPS实现-讲义.pdf

05-21

分子动力学模拟及其LAMMPS实现-讲义.pdf 本资源是一个关于分子动力学模拟及其LAMMPS实现的讲义，涵盖了分子动力学基础、Linux系统常见命令和操作、LAMMPS介绍和并行版安装、LAMMPS模拟基本流程、建模和后处理软件...

分子动力学LAMMPS模拟

weixin_56135535的博客

03-13

432

随着理论化学及计算机技术的发展，分子模拟技术被越来越多地用来加快科学研究与开发过程。分子动力学模拟方法以统计热力学、分子力学及牛顿力学为基础，对纳观体系的状态与过程进行精细研究，已被广泛用于化学化工、生物医药、材料科学与工程、物理等研究领域。理解分子动力学模拟理论基础并掌握相应软件的操作与特点对于相关领域的研究工作尤为重要。专题六实战3：基于反应力场的聚合物热裂解及LAMMPS分子动力学模拟常见错误解析。6 实战3：基于反应力场的聚合物热裂解及LAMMPS分子动力学模拟常见错误解析。

分子动力学模拟的Lammps实现.rar_lammps_lammps教程_分子动力学

07-14

本资源是关于"分子动力学模拟的Lammps实现"的教程，主要针对初学者，旨在帮助他们理解和掌握如何使用LAMMPS（Large-scale Atomic/Molecular Massively Parallel Simulator，大规模原子/分子并行模拟器）进行分子动力...

分子动力学模拟(MD)

AI工程化、开源分享、文档翻译、代码笔记

06-26

6560

一、分子动力学模拟(MD) MD模拟的统计力学基础分子内和分子间相互作用分子间相互作用模型 MD模拟的积分算法二、分子力场类型 GAFF AMBER CVFF OPLS MMFF UFF Dreiding PCFF CFF CFF91 CFF93 ClayFF GROMOS-53A5 and 53A6 CHARMM CGenFF 三、分子动力学模拟软件 LAMMPS GROMACS AMBER Moltemplate OpenMM Tinker CHARMM

LAMMPS手册 分子动力学模拟

05-26

LAMMPS手册。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。

分子动力学模拟

TJS1269的博客

05-10

808

为了能更直观的对比出蛋白中二级结构的变化，分别对比了蛋白二级结构中Helix、Sheet、Turn和Coil的变化，结果发现，在BPQDs+2N0A+PBS体系中，Sheet明显减少，Turn和Coil明显增加，意味着加入PBS缓冲溶液的体系中蛋白的稳定性会减弱，结合前面的视图分析，蛋白结构稳定的减弱，使其更快速的与黑磷间相互作用，范德华能对比结果与表明其相互作用也更强。分别计算了两个体系中蛋白与黑磷间的静电能和范德华能，由于黑磷结构不带点，因此其与蛋白之间并未有静电作用，仅存在范德华作用。

利用LAMMPS 实现导热的分子动力学模拟

weixin_44873868的博客

03-09

1454

本次模拟采用LJ约化单位，晶体为面心立方结构，晶格参数为0.6，沿x（100）、y（010）方向为10倍晶格长度，z（001）方向为20倍晶格长度。采用compute chunk/atom将模型沿着z方向分成20块，设置底端0-1倍晶格长度为热端，中间10-11为冷端。模拟温度为1.35。热端设置为1.7，冷端设置为1.0，弛豫到热源和冷源的温差达到相对稳定的状态。在最后一1000步的温度梯度和温差波动如图1.2所示，可以明显看出热端和冷端的温度差，热流保持着相对稳定的状体。1.3结果整理与分析。

lammps使用in文件进行分子动力学模拟

qq_44963682的博客

06-08

3994

介绍in文件书写的基本框架，和lammps如何使用in文件来进行分子动力学模拟。

LAMMPS分子动力学模拟教程：拉伸过程应用

weixin_42466857的博客

05-22

1705

LAMMPS作为一款开源的分子动力学模拟软件，广泛应用于计算物理、化学、材料科学和生物分子等领域。它通过模拟原子、分子或聚合物的运动来研究复杂物质的性质，尤其在材料科学领域，LAMMPS能模拟从微米到纳米尺度的材料行为，为研究者提供深入洞察。LAMMPS的核心特点是其高效的计算能力，支持多种力场，易于扩展和自定义新的势能函数，使得它能模拟多种材料系统。其并行计算框架适合于大规模模拟，能够在超级计算机上运行。