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原创 Cell Reports Medicine||基于脑电图和AI的药物上瘾预测
在所有频段和静息条件中,基于睁眼静息β波段(REO beta) 的模型预测性能最高,主要驱动力来自默认模式网络(DMN)和额顶控制网络(FPN) 的核心连接,特别是 MPFC-LPMFG 和 PCC-RSUP 的连接。甲基苯丙胺,也就是我们俗称的冰毒。睁眼静息δ波段(REO delta) 的模型也表现出显著的预测能力,主要由涉及额顶控制网络(FPN)、腹侧注意网络(VAN)和背侧注意网络(DAN)的连接驱动。(5)特征查看:计算了渴求与FCN之间的相关性,比较MUD患者与健康对照(HC)之间的FCN。
2025-12-01 10:30:00
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原创 各种文件的介绍和读取--基于R
本文介绍了R语言中常见数据文件的读取方法,分为三类:1)规整数据文件(如CSV/XLSX)使用read.csv、read_excel等函数;2)文本文件使用readLines、scan等函数;3)特殊格式文件(如FASTA/GTF)需要专用包如Biostrings。重点讲解了参数设置技巧,如跳过行数(skip)、处理注释(comment.char)等。对于大型文件推荐使用fread提升效率。文章提供了不同文件类型的读取代码示例,帮助解决实际科研中常见的数据读取问题。
2025-11-10 20:25:26
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原创 conda环境构建和包的安装
本文介绍了conda工具的安装与使用。conda是用于管理软件包和环境的工具,能有效解决生物信息学中常见的环境隔离和包冲突问题。教程详细说明了如何下载安装Miniconda,包括通过VS Code上传安装包到服务器的步骤。重点讲解了conda的两个核心功能:环境创建(conda create)和软件包安装(conda install),并演示了R包clusterProfiler的安装过程。此外还介绍了常用conda命令、频道管理以及mamba加速工具的使用注意事项。该工具可显著提高生物信息学工作环境配置效率
2025-11-01 01:44:39
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原创 R语言入门:从零配置到远程开发
本文介绍了R语言在生信分析中的应用及远程配置方法。首先推荐从R语言入门,并详细说明了Windows和Linux系统下的安装步骤。其次重点讲解了使用VSCode进行远程开发的方法,包括SSH插件安装、服务器连接配置、R路径查找等关键步骤。最后通过一个简单的绘图代码示例,展示了R语言的基本使用。全文为生信初学者提供了从软件安装到远程开发的完整指导,帮助读者迈出生信分析的第一步。
2025-10-27 22:16:38
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原创 到底什么是生信
摘要: 本文以个人视角探讨生物信息学(生信)的多元认知:有人质疑其可信度,有人认为门槛极高,也有人盲目跟风。作者指出,生信本质是通过数学等方法解读生物数据,其发展依赖测序技术进步和开源工具普及。关于可靠性,生信结果具有概率性,与湿实验的确定性不同,但二者互补而非对立。文章强调生信思维的重要性,并预告后续将分享分析流程与思维培养方法。
2025-10-12 23:52:48
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空空如也
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