到底什么是生信

  我想用这一篇文章，作为公众号的开端来阐述我对生信的了解。我想要铭记我现在对生信工作的尊重，来在未来的日子里提醒我不忘初心。也许它会像秋天的落叶一样，虽然年年都能在树上重新看到，但是再也不是当年的那片。

    好了，抒情就此结束，我们来回归今天的主题：什么是生信。就我这么多年和高校及企业打交道的经历来看，生信的概念在不同人及不同时期是不同的。

    1、生信不可信。在打交道的很多做实验的教授甚至本身从事生信工作的生信工作者都会有这种想法。有些教授虽然随大流让学生来做生信，但是从来都不觉得生信有什么可信度，那些做生信的学生也会被认为是油滑的不可信的学生。

    2、生信好难，需要极高的数学基础。这种思想常常是在一些接触过高级生信实验室的海归或者精英教授中出现，他们虽然可能自己没有接触过生信，但是却接触过生信最顶尖的这批人，他们常常是某些经典工具的创作者。因此，一些普通的调包或者流程在他们眼里可能不会被认为是生信。

    3、生信不生信我不懂，但是我得有。相信一些同学就这样被老师莫名的安排到生信方向，但是老师也不知道他到底需要什么。

    我想就我个人发表一些不成熟的见解。

    第一方面是生信到底是个啥，能做个啥。说到生信，不得不提到生物学，现代生物学其实才发展了不到100年，生物信息学发展的时间更短，他的发展主要是从DNA序列和蛋白质序列的分析中发展出来的，其实目前也仍然主要是这些测序数据的分析。最开始的时候，想要进行生物信息学分析门槛是很高的，需要自己手写代码及推导公式。之后一些语言专门为生物信息学开发库，例如我们熟知的R的Bioconductor库，一些优秀的代码模块被贡献出来，生物信息学才开始在研究中普及。当然，这也离不开高通量测序为我们提供的海量的数据。说到这，其实生信的含义也就呼之欲出了，其实就是通过数学或者其他学科的方法对生物数据进行解读。幸运的是我们站在了前辈的肩膀上，入门生信并不像以前一样需要极高的数学及代码储备。

    第二方面是生信到底可不可靠。这其实主要是和使用生信想达到什么目的有关，也和生信和湿实验的区别有关。做过实验的小伙伴都知道，造模周期长，养老鼠那一代又一代的更是熬人的活。但是生信的选择就灵活多变了，一个方向不行可以无缝衔接的搞下一个方向，一周能出八个图，这周做不出来的结果可能下周就出来了。这也就导致一些老师不相信生信的结果，当初我的老师甚至让我用excel来复现我用R跑出的结果。其实，生信分析出的结果也是基于其他人一代代积累的数据，我们不该对结果的多变保持怀疑，应该为前辈一代代的积累和共享心存感激。其次，生信使用的很多算法比如贝叶斯，蒙特卡洛等并不是一个确定的结果，只能说大概率是，并不能和实验中小鼠是否真的死亡那么具有直观性。所以，生信主要提供的是可能性，并不代表它不可信。

    其实不管怎么样，毋庸置疑的来说生信分析为生物开拓了更无限的可能性，为生物的进步和发展提供了坚实的基础。事实上，生信最重要的是生信思维的培养，它和实验思维是不同的。以后我会为大家分享生信的分析流程及思维的培养。

微信关注：生信老学长