在分子生物学与细胞功能研究领域,构建稳定干扰特定基因的细胞株是揭示基因功能的关键技术之一。慢病毒载体因其感染效率高、可整合基因组实现长期稳定表达等优点,成为构建稳定敲低细胞模型的常用工具。本文将结合中国知网、万方数据等平台的相关研究,系统介绍利用慢病毒系统构建TET2基因稳定敲低人髓系细胞SKM-1的全过程。
一、 TET2基因的背景与研究价值
TET家族基因(TET1/2/3)是近年来表观遗传学研究的热点。其中,TET2(Ten-Eleven Translocation 2)基因编码一种α-酮戊二酸和Fe(II)依赖的双加氧酶,其核心功能是催化DNA中5-甲基胞嘧啶(5-mC)转化为5-羟甲基胞嘧啶(5-hmC),从而启动DNA去甲基化过程(An et al., Nature, 2017)。在造血系统中,TET2扮演着“守护者”的角色,其功能失常与多种血液系统异常密切相关。据万方医学收录的多项临床研究统计,TET2是髓系发育异常中突变频率最高的基因之一(中国实验血液学杂志, 2020)。因此,构建TET2功能缺失的细胞模型,对于理解其在中早期的造血调控机制具有重要科学意义。
二、 实验流程详解
1. shRNA干扰载体的设计与构建
载体的设计是整个项目的基石。研究团队根据NCBI GeneBank中TET2的mRNA序列(NM_001127208.2),遵循shRNA设计原则,针对不同外显子区域设计了多条干扰序列。通过预实验筛选,最终选定了两条高效序列:H_TET2-shRNA215和H_TET2-shRNA576。将化学合成的寡核苷酸链退火成双链后,克隆至pGMLV-SCS RNAi慢病毒表达载体中。该载体含有ZsGreen荧光蛋白和嘌呤霉素抗性基因,便于后续的感染效率观察和稳定株筛选。测序结果(见表1)证实插入序列完全正确,载体构建成功。
技术要点:设计shRNA时,需通过BLAST比对避免与非靶基因同源,并通过专业软件预测二级结构和干扰效率,这在小木虫等科研论坛中有广泛讨论。
2. 慢病毒的包装与滴度测定
将构建成功的重组质粒与psPAX2、pMD2.G等包装质粒,通过PEI转染试剂共转染至人胚肾293T细胞中。48-72小时后,收集富含病毒颗粒的细胞上清液,经过超速离心浓缩后,采用梯度稀释法在293T细胞上测定病毒滴度。本实验获得的病毒滴度分别达到5×10⁸ TU/mL(shRNA215)和1×10⁸ TU/mL(shRNA576),符合感染实验的要求。
知识拓展:病毒滴度是决定感染效率(MOI)的关键参数。滴度过低可能导致感染不全,过高则可能引起细胞毒性。
3. 稳定敲低细胞株的构建与验证
将SKM-1细胞与适量慢病毒颗粒共孵育,同时加入polybrene以提高感染效率。感染48小时后,在荧光显微镜下可观察到强烈的绿色荧光,初步判断感染效率较高。随后,使用嘌呤霉素进行加压筛选,直至对照组细胞全部死亡,从而获得稳定整合了shRNA载体的细胞池。
为验证敲低效果,研究人员分别从mRNA水平和蛋白水平进行了检测:
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qPCR验证:结果显示,与空载体组相比,H_TET2-shRNA215组的TET2 mRNA表达量显著降低(p < 0.01),敲低效率超过70%。
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Western Blot验证:在蛋白质水平上同样观察到TET2蛋白表达的显著下调,这与qPCR结果相互印证,确认了TET2稳定敲低细胞株构建成功。
三、 模型的功能学验证与应用前景
成功构建模型后,研究团队进行了一系列功能实验。CCK-8法证实TET2敲低并未显著影响细胞的基础活力,但流式细胞术检测发现,敲低组中处于S期的细胞比例明显增加,同时细胞早期凋亡率下降。这些表型与PubMed上已报道的TET2缺失可改变细胞周期进程和抑制凋亡的结论相一致(Cimmino et al., Science, 2017)。
该稳定敲低细胞模型的成功构建,为后续深入研究TET2影响细胞周期、凋亡、分化等生命活动的具体分子通路提供了理想的工具。例如,可以此模型为基础,利用转录组测序(RNA-seq)技术筛选TET2的下游靶基因,或用于高通量药物筛选,寻找能够模拟或补偿TET2功能的潜在活性化合物。
四、 总结
综上所述,本文梳理了从shRNA设计到功能验证的完整技术路线,成功构建了TET2稳定敲低的SKM-1细胞株。该流程标准化程度高,重复性好,不仅适用于TET2基因,也可为其他基因的功能研究提供技术借鉴。随着基因操作技术的不断发展,此类精准的细胞模型将在阐明生命机理和推动转化研究方面发挥越来越重要的作用。
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