【SimpleITK教程】SimpleITK获取医学图像ROI的外接矩形框bounding box

原创已于 2023-01-18 10:41:37 修改 · 934 阅读

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#SimpleTIK #医学图像处理 #bounding box

于 2023-01-18 10:23:15 首次发布

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这段代码展示了如何使用SimpleITK库读取nrrd格式的图像，应用LabelStatisticsImageFilter计算ROI的统计信息，并获取特定标签的边界框（bounding_box）。通过filter.Execute执行后，可以得到一个六元数组，表示在三个维度上的最小和最大坐标。

摘要生成于 C知道，由 DeepSeek-R1 满血版支持，前往体验 >

代码

image = sitk.ReadImage('xxx.nrrd')
roi = sitk.ReadImage('xxx.nrrd')
filter = sitk.LabelStatisticsImageFilter()
filter.Execute(image, roi)
bounding_box = filter.GetBoundingBox(1) ### 1指的是要获取boundingbox的label值
# bounding_box为六元数组
# 数值为 (sagittal_min, sagittal_max, coronal_min, coronal_max, axial_min, axial_max)