使用ggseg进行大脑分区统计结果的可视化

本文介绍了如何利用R语言的ggseg包对神经影像学研究中的大脑皮层厚度差异进行统计结果的可视化。首先安装ggseg和相关依赖,然后加载数据,结合大脑模板创建可视化图表,通过ggplot2绘制区域及T值,最终自定义样式并保存图表。

在神经科学和神经影像学研究中,了解大脑结构和功能的区域差异非常重要。ggseg是一个基于R语言的包,可以用于可视化大脑结构的分区结果。本文将介绍如何使用ggseg包来可视化皮层厚度差异的统计结果。

首先,确保已经安装了ggseg包和其他必需的依赖包。可以使用以下代码在R中安装ggseg包:

install.packages("devtools")
devtools::install_github("ggseg/ggseg")

install.packages("ggplot2")
install.packages("ggplotify")

在安装完包之后,我们可以加载所需的库并读取皮层厚度差异的统计结果数据。假设我们已经有了一个包含T值的数据框,其中每一行代表一个大脑区域。

library(ggseg)
library(ggplot2)
library(ggplotify)

# 读取皮层厚度差异的统计结果数据
data <- read.csv("path_to_data.csv")

接下来,我们可以使用ggplot2和ggseg来创建可视化图表。首先,我们需要创建一个基础的大脑模板图像,这可以通过调用ggseg包中的create_brain函数来完成。

# 创建基础大脑模板图像
brain <- create_brain("MNI152NLin6Asym")
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