百趣代谢组学文献分享:OnPLS方法在哮喘领域应用研究

 

百趣代谢组学文献分享，本周分享的文献题目为OnPLS-Based Multi-Block Data Integration: A Multivariate Approach to Interrogating Biological Interactions in Asthma，是由日本前桥群马大学创新研究中心Craig E. Wheelock教授课题组在2018年发表于Analytical chemistry上的一篇文章。

1代谢组学文献分享—研究背景

在后基因组时代，随着组学技术发展的日益成熟，多个不同组学之间的联合分析越来越被科研工作者认可接受，以期寻求不同组学间的内在关系和规律趋势。

代谢组学文献分享，基于两个不同组学联合分析已有类似O2PLS等建模方法，但在两个以上不同组学联合分析的方法尚未发现。代谢组学文献分享，鉴于此，本文采用一种全新的多元变量统计模型方法——OnPLS去探索在哮喘病人中不同转录、代谢、脂肪酸、脂类和临床数据间表达变化关系和引发骨密度下降的机理研究。

2代谢组学文献分享—研究方法

样本来源：临床样本（n=22）包括健康组和哮喘组两种。

六类分析数据模块详情见下图：

 

数据分析：代谢组学文献分享，结合MATLAB 2018a和SciPy工具进行OnPLS方法统计建模，以期发现这六类数据间的含量表达相关性，通过筛选出强相关信息找出哮喘病人口服类固醇治疗前后这些数据的含量变化规律，为后续进一步阐明哮喘病人的发病机制提供有力理论数据支撑。

3代谢组学文献分享—分析流程