百趣代谢组学文献分享,细胞自噬不知大家是否了解?2016年,日本科学家大隅良典(Yoshinori Ohsumi)凭借“细胞自噬机制方面的发现”获得了诺贝尔生理学与医学奖!
自噬,通俗来说就是自己吃自己。代谢组学文献分享,细胞自噬是指从粗面内质网的无核糖体附着区脱落的双层膜包裹部分胞质和细胞内需降解的细胞器、蛋白质等成分形成自噬体,并与溶酶体融合形成自噬溶酶体,降解其所包裹的内容物,以实现细胞本身的代谢需要和某些细胞器的更新。代谢组学文献分享,细胞自噬对于回收细胞成分是必不可少的,在饥饿应答时尤其重要。

今天小趣通过Nature Plants上的Maize multi-omics reveal roles for autophagic recycling in proteome remodelling and lipid turnover一文给大家详细解读如何运用多组学联合分析阐述玉米自噬的影响。
一、代谢组学文献分享—研究方法
玉米生长对氮缺乏高度敏感,这是其主要的农业限制之一,因此本文作者利用氮胁迫研究玉米自噬的功效。代谢组学文献分享,在植物中,主要的自噬途径由一系列自噬相关(AUTOPHAGY-RELATED,ATG)蛋白质介导,作者将野生型玉米(WT)和敲除核心自噬组分ATG12的突变体(atg12-1:完全敲除,atg12-2:中度敲除)在富氮(+N:15 mM)条件下培养2周,之后一部分继续培养,剩余的转至氮缺乏(-N:0.1mM)条件下培养,一周后取第二片和第四片叶进行各组学检测,代谢组和离子组分别设置5个重复,转录组和蛋白组分别设置3个,每个重复由5片相似的叶片混合而成。

二、代谢组学文献分享—研究结果
1.玉米atg12突变体对氮胁迫敏感
氮饥饿的玉米表现出强烈的生长抑制,但野生型尚未显示加速叶片衰老,而atg12突变体明显衰老。

图1.野生型及atg12突变体在+N/-N中

文章通过多组学分析方法研究了玉米在氮缺乏条件下的自噬机制,发现自噬对于植物应对氮饥饿至关重要,影响脂质代谢和蛋白质稳态。atg12突变体在氮胁迫下表现出早衰现象,揭示了自噬在植物生长和代谢调节中的核心地位。
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